一次，一位產婦產後大出血。那是因為胎盤沒有剝離。主治醫師是個外國人，手大，很難伸進子宮。站在旁邊的林巧稚說：“我來試試吧!”主治醫師點頭應允。於是林巧稚上了手術台。
胎盤剝離下去，出血止住了。主治醫師向她投來讚許的目光。
由此，林巧稚就開始了實際操作。
半年之後，總住院醫師生病，馬士敦讓林巧稚代理總住院醫師的職務。她擔起了別人要奮鬥四五年才能爭取到的重任。
馬士敦有紳士派頭，對下級極嚴。早晨八點鍾，他準時上班，“住院總”要在他的辦公桌上擺好一杯熱牛奶；八點半，他要聽“住院總”的彙報；九點，“住院總”要邁著小碎步兒，緊緊地跟在主任後麵查病房。主任提出的問題，“住院總”和住院醫師們要馬上做出回答。必須背出自己所負責的病人的情況，必須肯定地說出處理意見和進行這種處理的依據。這裏，來不得半點懶惰，來不得一絲一毫的馬虎。這裏，競爭比在學校更厲害。
在新的競爭場上，同樣地林巧稚又成了引人注目的佼佼者。
原任總住院醫師，得的是肺結核。在林巧稚代理他的職務10個月之後，仍未康複。馬士敦決定，林巧稚升為正式總住院醫師。要知道，總住院醫師是一個何等重要的台階啊！它是通往主治醫師的橋梁！這個寶座，曆來是住院醫師們奮力爭奪的目標。為了它，同事之間，互相封鎖，互相拆台，互相傾乳之事，時有發生。林巧稚不搞這些。她是憑著自己的刻苦和勤奮，憑著對患者的一顆負責的和慈愛的心！因此，她對同事們投來的羨慕和妒嫉的目光，不予理踩，十分坦然。
其實，在馬教授手下當總住院醫師，絕非輕鬆的差使。除上午查房之外，每天晚上，“住院總”還要向他彙報整個病房的情況。對他在電話中連珠炮式的追問，必須應答如流。這倒鍛煉了林巧稚，使得她養成了事必躬親，深人實際，對任何病例都要掌握第一手材料的習慣。
有趣的是，每天晚上向馬士敦彙報，時間必須在八點整。有一個星期天，林巧稚到朋友家去吃飯，趕不回來，八點整，就在那裏給馬老頭打電話。這個精細的老頭，也許是聽出電話裏的聲音比較遙遠，就問道：“你是在醫院裏嗎?”嚇得林巧稚從此以後再也不敢離開醫院寸步！
漸漸地，額外的重負一個個地壓在林巧稚身上。經常為馬士敦看守特別病人，就是一個繁重的負擔。然而，這個馬老頭在技術上卻是壟斷和保守的。他那一把刀不肯輕易放下，也不肯輕易把技術傳授給別人。就連林巧稚也不例外。在三年任住院醫師期間，馬士敦讓林巧稚摸到三次做手術的機會兩次是簡單的剖腹取子;至於第三次全切宮，純屬一個偶然的機會。那是一個滴水成冰的冬夜，道濟醫院婦產科來了電話，請馬士敦會診。馬士敦嫌冷，把這次機會讓給了林巧稚。林巧稚冒著刺骨的寒風，跑到道濟醫院。經會診，認為必須給病人切除子宮。她馬上動手，在非常簡陋和困難的條件下，順利地完成了手術。就這樣，林巧稚，闖出來了！
在協和，一般是當了主治醫師之後才有出國進修的機會；然而林巧稚由於工作成績卓著，剛做了一年住院醫師，二年“住院總”，就在1932年7月，得到協和獎學金，踏上了赴英國學習深造之路。