聖誕節前夕，日本人果然關閉了協和醫學院和協和醫院。住院的病人被命令在幾天內撤離。
林巧稚領到兩個月的遣散費，無可奈何地離開了生活20年的協和，回了家。
家裏的事情也叫她犯愁。侄女懿鏗即將臨產，卻住不進醫院。無奈，隻得向左鄰右舍借來幾塊鋪板，搭起一張“家庭產床”。1942年1月3日，懿鏗在這張“家庭產床”上生下了一個女兒。
林巧稚雖然也為家中添丁而欣喜，但一想到失業在即，日本人正催著搬家騰院，心頭不免又蒙上重重憂愁！
日本軍隊占領協和醫院後，把協和的兩個宿舍大院也控製了起來，派駐士兵把守，並下令住戶限期搬走，各尋出路。
被遣散的協和醫生，有的背井離鄉，去了外地，有的暫棲古都，以私人開業行醫謀生。為了維持一家人的生活，林巧稚也準備走後一條路。
一連幾天，她和周華康倆人早出晚歸，幾經周折，付出昂貴的代價，在東堂子胡同10號找到一所住房。
新的家布置起來了。這是一個比較寬敞的四合院。門洞左邊的三間南房做診室。周華康、林懿鏗夫婦和孩子住西廂房；林巧稚和大姐款稚、侄女敏鏗住北房。敏鏗負責采買器械、藥品。又請了兩位護士。家庭診所籌備妥當，林巧稚便請人用黃銅作表皮，作了一塊牌子，上麵刻著三行方方正正的顏體楷書：醫學博士林巧稚醫師婦產科牌子掛在東堂子胡同10號的門口。
協和醫學院畢業的大夫，在當時北平社會上頗有聲望。林巧稚的診所開業後，慕名來找她看病的患者很多。以前，窮苦的老百姓一般不敢登協和醫院的大門，因為它的醫療費用實在太昂貴。現在，私人診所收費低廉，他們都樂意來此求醫。這使林巧稚有機會接觸了更多的下層群眾。
平時，林巧稚在家中看門診；有時，也拎著藥箱出診，還騎著小毛驢到市郊或者更遠的地方給人接生、治病。她，穿著簡樸，粗茶淡飯，但有一個嗜好一直沒有改掉，那就是臨走的時候，一定要喝一杯咖啡，提提神，好振作精神守護產婦。
生活的變遷，使林巧稚眼界大開。她時而登堂入室，被請到官僚富豪的深宅大院去出診；時而走街串巷，蹬三輪、拾煤核人家的大雜院去接生人世間的貧富對比，是這樣鮮明，這樣強烈。林巧稚的心，越來越傾向於那些在社會底層為求生存而痛苦掙紮的同胞們。她常常想起漂泊南洋做苦工、死在異國他鄉的祖父，想起因宮頸癌無法治療而過早去世的母親，這一切，使她產生了一種朦朦朧朧的意識：不為良相，當為良醫。縱然能改變社會的現狀，一定要為解脫蒙難同胞的病痛之苦竭盡綿力！
那時，北平城自己開業的醫生中，有不少是病人躺在手術床上，才向家屬提出苛刻條件的。這些人很快發了大財，有了汽車、洋房。但林巧稚鄙夷這種昧良心的行為。每每聽到這類事情，總是搖著頭，發出一聲不以為然的長歎。自言自語地說：“我，夠生活就行啦，要那麼多錢幹什麼。
她在自辦診所的幾年間，不要說沒有汽車，就連一輛人力車也沒包；她沒有洋房，住的是那所租金越來越貴的四合院，過的是清貧的生活。
在那到處充斥著汙濁氣息的社會裏，林巧稚潔身自好，信守自己的做人道德。
急診，往往是在夜晚。在那動蕩不安的年代，一個身體單薄的中年女子，夜半出診所遇到的困難可想而知。有時候，她請家中的幫工陶二找輛人力車;有時候，隻能以步代車。小巷漆黑，她被路樁絆倒過，被冰雪滑摔過。但她爬起來，撣撣土，走得更快了。她從來都把治病救人當作自己的天職。
有一夜，夜已很深，人力車已十分稀少，好容易找到一輛，卻見車夫的麵色有些躊躇。
林巧稚說：“拉一趟吧，我加倍給你車費!”“不，不是這個意思。”車夫趕緊解釋，“您，一個婦道人家，天又這麼晚了”。
“啊，沒關係，”林巧稚急切地說，“我是去接生的，晚了就要誤事啦!”
車夫被感動了，二話沒說，拉著她就跑。林巧稚也被感動了：“還是好心的人多!”有一個傍晚，一輛人力車急停在東堂子胡同10號的門口。車夫進門要找林大夫。
林巧稚聞聲走出來，說“我沒要車呀!”
“不，是我家裏的，她難產!”
話音未落，林巧稚回身拿起診包，就上了車。車子在一個破破爛爛的大雜院門前停了下來。北風吹著破碎的窗紙，發出呼噠呼噠的響聲。一個小破缸做成的煤焦子爐，火星都快要滅盡了。鋪著破絮的床上，產婦在痛苦地呻吟著