不過，武學在靖康之變中沒有起到什麼重大作用，南宋初武學遂停辦，直到紹興十六年（1146）宋高宗說：“國家武選，所係非輕。今諸將子弟，皆恥習弓馬，求換文資，數年之後，將無人習武矣，豈可不勸誘之。”連軍人子弟都以學武為恥，想改換門庭，走文職的道路。這使得和議雖成，但金人威脅的陰影並未在趙構心目中消除，所以他才有這番話，力主恢複武舉、武學。可是當時的宰相秦檜卻陽奉陰違，不肯認真對待，這是個徹底的“親金派”，生怕此舉惹得金人不高興。高宗對秦檜是心存畏懼的，秦檜死後，他曾說，每見秦檜，膝褲裏總藏著匕首，以防不測(2)。秦檜的專橫跋扈，可見一斑，皇帝支使的事情，他不幹，皇帝也沒辦法。
紹興二十五年秦檜死，武舉、武學才提上日程＇！建炎以來係年要錄》卷一七二中記載說：
上曰：“昨詣景靈宮朝獻，見武學頹弊，亦全無士人＇向諭宰臣，雖略修葺舍宇，至於養士，元未嚐措置，已二年餘矣＇文武一道，今太學養士，已見就緒；而武學幾廢，恐有遺材＇祖宗以來，武學養士，自有成法，可令禮、兵部速條具以聞。”
高宗看到武監裏沒有學生、沒有老師的頹弊景象，感到恢複武學的迫切，他指示按照北宋辦武學條例抓緊辦。這樣紹興二十六年武學才正式恢複，置官招生。學校仍分上、內、外三舍，每期仍是一百人。因為外患壓力很大，統治者對於武學還是比較重視的。
孝宗、度宗都曾臨幸過武學，太學日益被士人看重，但其容納力有限，於是有人就轉向武學，因為它也是太學的一部分。
三、武學生
1.國子監學生們的影響力
武學生指武監中的學生，不包括州縣等地方武學中的學生。
北宋末以後的國子監的學生用現代話說是非常“牛”的，甚至比在朝為官的士大夫還“牛”。因為他們是一個群體，大都年輕，很少世故，在議論時事、幹預朝政等方麵，遠比士大夫們大膽。上庠錄雲：“世稱太學聚天下士，既知道理，又無持祿固寵之累，故其品藻人物，皆合公議，於是以太學為無官禦史。”現在有的研究者說宋代是古代學運的極盛時期(2)，這是有道理的。北宋末年的太學生陳東在就是那時的學生領袖，名震一時，其影響力絕不亞於抗金派的領袖李綱。到了南宋，國子監學生在士人心中的地位又提升了一格。曾做過太學生的羅大經在！鶴林玉露？無官禦史》中寫道：
太學古語雲：“有發頭陀寺，無官禦史台。”言其清苦而鯁亮也。嘉定間，餘在太學，聞長上同舍言，乾淳間，齋舍質素，飲器止陶瓦，棟宇無設飾。近時諸齋，亭榭簾襆，競為靡麗，每一會飲，黃白錯落，非頭陀寺比矣。國有大事，鯁論間發，言侍從之所不敢言，攻台諫之所不敢攻，由昔迄今，偉節相望。近世以來，非無直言，或陽為矯激，或陰有附麗，亦未能純然如古之真禦史矣。餘謂必甘清苦如老頭陀，乃能攄鯁亮如真禦史。
太學生都住校，有如帶發修行的頭陀，生活又很清苦，除了專心讀書外，就是議論時事，關心朝政。他們大多年輕’意氣風發’比老於宦場的官僚要純真許多，他們“言侍從之所不敢言，攻台諫之所不敢攻”，受到社會的尊敬。齊東野語》記載了一封士子寫給祭酒的信：