羅非魚因其對環境適應條件廣、抗病力強、食性雜等特點，與其他淡水魚類相比疾病較少。但在冬季和春夏之交水溫較低的季節，由於水質相對較差、水溫較低、攝食偏少，也易受細菌、寄生蟲等感染和侵襲。特別是近幾年來，網箱、流水養殖等集約化養殖方式的發展，一旦發生病害，極易引起暴發性魚病，因此要重視疾病防治工作，以防為主，防治結合。
（一）發病原因
尼羅羅非魚在飼養過程中發病的原因，主要和水環境不適、飼養管理不當以及病原體侵害有關，在越冬期間尤為突出。
一是隨著科技與經濟的進步，人類對自然資源的利用能力越來越強，工業廢水和生活汙水日益增多，如含有有毒有害物質（重金屬、硫化氫、氯化物等）的廢水流入池塘，輕則影響魚的健康，使其抗病力減弱，引發疾病，重則造成死亡。
二是水中溶氧含量和魚體的生長密切相關，雖然尼羅羅非魚能耐低氧，但在越冬或高密度養殖的情況下，會出現水中溶氧含量低的現象，如不及時增氧，魚經常處於缺氧浮頭狀態，就會影響攝食，使生長緩慢，體質變弱，甚至造成生病死亡。
三是水體中溫度的高低對尼羅羅非魚的生長至關重要。
尼羅羅非魚的適宜生長溫度為24～32℃，安全生存溫度不低於16℃，最低生存溫度為12℃。在越冬的整個過程中，水的溫差在短時間內不能超過2～3℃，否則亦會引起魚病或死亡。
四是越冬親魚、魚種的選擇和處理、捕撈運輸、放養飼養管理等日常管理工作做得不嚴格，也是引起尼羅羅非魚生病的重要原因。
（二）綜合防病
1.魚池消毒
無論是養殖池塘還是越冬池以及周邊環境，在放魚前都應按常規進行清理和消毒清塘。養殖池在放魚種前用生石灰清塘，越冬池放魚前排幹池水，清除附著物和汙物，用1～4毫克/升漂白粉溶液全池潑灑，流水池以及相應的管道也應進行消毒。放魚後每隔1個月左右用1毫克/升漂白粉或0.8毫克/升硫酸銅全池潑灑，進行魚池消毒，定期預防疾病。
2.嚴格選種，小心操作
繁殖用的親魚和留作次年放養用的魚種，進越冬池前要嚴格篩選，一定要選擇體質健壯，沒有傷病的魚。受到損傷的魚不能進越冬池。
在拉網、轉塘、運輸過程中操作要做到輕、快，防止魚體受傷、脫鱗。
3.魚體消毒
親魚、魚種在入池、進箱前均應把住消毒關，特別是集約化養殖，魚種往往由外地運來，除揀出死魚和受傷、脫鱗的魚外，還應用4%食鹽溶液浸洗5～10分鍾。
4.水質調控
良好的水環境是促進羅非魚攝食、增強魚體抵抗力和抑製病菌孳生的重要條件。在養殖期間，應注意調節水質，定期潑灑生石灰，一方麵能調節水質，另一方麵對水體有消毒殺菌作用。溫水流水養殖和越冬期要適時調節好水溫，使越冬水溫能保持在18～20℃，並定時排汙，增加水交換量。池塘養殖也應調節水質，定期添加新水。
5.科學投飼
要獲得高產，就要科學地投喂飼料，使魚健康生長，特別是在集約化養殖方式中，人工投喂的飼料幾乎是魚類營養的惟一來源。投飼不足，營養缺乏，必將使魚體消瘦，易感染病害。
（三）常見病的防治
1.爛鰓病
【病原】主要由斜管蟲寄生於鰓部、車輪蟲寄生於體表，或因細菌感染所致。
【症狀】斜管蟲對寄主的選擇不嚴格，不限魚苗、魚種或成魚，車輪蟲對苗種危害很大。染病後，魚口部張大，浮於水麵，體表發白，鰓蓋變紅，眼球白濁。嚴重時鰓葉壞死變白，因呼吸困難而死亡。
【防治】用0.7毫克/升硫酸銅和硫酸亞鐵（5：2）合劑全池潑灑或浸洗。