曼哈頓工程
二戰期間，納粹德國進行了核武器的研究。得知這一情況後，丹麥偉大的物理學家、諾貝爾獎獲得者波爾立即前往美國。他與費米、愛因斯坦商討後，建議美國必須搶先製造出原子彈。後來，為了專門從事核武器的研究工作，美國建立了代號為“曼哈頓工程”的原子彈研究機構。1945年7月16日，美國研製出了第一枚原子彈，並在新墨西哥州的一個沙漠空軍基地試驗成功。
早在1939 年，阿爾伯特?愛因斯坦就給羅斯福總統寫過一封信，信中說希特勒可能正在研製一種新型炸彈。這種炸彈的威力非常大，可以在瞬間摧毀整座城市。羅斯福迅速成立委員會，加快了美國原子彈的研究步伐。恩裏科?費米等物理學家曾經估算，僅幾磅重的不穩定元素例如鈾就可以產生史無前例的爆炸威力。
1942 年，羅斯福啟動了美國有史以來最昂貴的研究計劃：也就是將理論付諸實踐，研發出第一顆原子彈。來自加利福尼亞的傑出理論物理學家羅伯特?奧本海默被任命為原子彈計劃的主持人。奧本海默急需建造一個專門的實驗室，他在新墨西哥州的偏遠地帶有一個大農場，於是他選擇附近的洛斯阿拉莫斯作為實驗室的建造地。此外，奧本海默還從美國的各所大學裏挑選出頂尖的科學家，將他們帶到氣候惡劣的新墨西哥，開始和他們一起製造原子彈。奧本海默在洛斯阿拉莫斯建起了實驗室，還分別在田納西州的橡樹嶺和華盛頓的漢福德設立了一個工廠。對外人而言，洛斯阿拉莫斯並不存在，在任何一張地圖上都找不到它。它隻有一個郵址：聖塔菲1663 號信箱。
原子彈
一顆中子進入鈾原子之後與鈾原子發生反應，中子破裂。這一破裂過程就是裂化，裂化引發一係列反應，當中子從一個原子核撞擊到另一個原子核上時，就會釋放出巨大的能量。
這項計劃耗資20 億美元，共有20萬人參加。隻有極少數人了解工作的真正目的。甚至連哈瑞?杜魯門，也是在羅斯福去世後繼任美國總統時，才得知此計劃的意圖。
1942 年，杜魯門就任國家防禦計劃調查特別委員會主席。這位直言不諱的密蘇裏州參議員，因為執意揭發軍事開支中的浪費而名聲大振。杜魯門發現一項耗資幾十億美元的計劃正在秘密進行，他想對此有更多了解，但戰爭部長亨利?斯廷普森警告他不要進行任何調查。
1942 年12 月2 日，原子彈研究有了重大突破。恩裏科?費米在芝加哥的實驗室中成功進行了鏈式反應。奧本海默現在知道爆炸原子彈是有可能的。
當美國的歐洲盟國與納粹德國進行激戰時，太平洋戰役使美軍陷入了戰爭的低迷狀態。數百萬人投入到這場噩夢般的抗日戰爭中，試圖改變戰爭的形勢。為了抗擊日本的軍事擴張行徑，美軍展開了一係列激戰。其中包括中途島戰役，以及其後的瓜達爾卡納爾戰役。美國逐漸收複了淪陷的太平洋諸島。