一提起“陰陽五行”，人們一般會很快聯想到舊社會專看墳地風水的“陰陽先生”，或在車站、鬧市和街頭巷尾給人看相、測字和卜卦的“算命先生”。於是，在一些人的心目中，陰陽五行似乎成了封建迷信的同義語；甚至中醫學也被看作是故弄玄虛的玄學了。
陰陽學說，是我國古代的一種哲學思想，即樸素的唯物論和辯證法思想。陰陽二字在日常生活中是經常使用的。拿天氣來說，有細雨綿綿的陰天，有晴空萬裏的豔陽天；拿日曆來說，農曆稱陰曆，公曆稱陽曆。現代醫學細菌培養有陰性菌和陽性菌之分，物理學中電極有陰極和陽極之分，化學中的離子有陰離子和陽離子之分，檢查身體有陰性體征和陽性體征等等。由此可見，陰陽作為相對概念，是用來區別事物屬性的。因為任何事物都具有既對立而又統一的兩個方麵。
陰陽學說在中醫學中應用十分廣泛，滲透在中醫學各個領域。從人體組織結構來說，上部屬陽，下部屬陰；外側屬陽，內側屬陰；體表屬陽，內髒屬陰。從人體生理和病理來說，正常的生理活動，是陰陽雙方保持協調的結果；如果陰陽失調，就要發生疾病。從疾病的診斷來說，診斷任何疾病，都要區別是陰證，還是陽證；而對於疾病的治療原則，就在於調整陰陽以恢複其相對平衡。中藥也是以陰陽為指導用於臨床的。如辛甘發散藥屬陽，酸苦湧瀉藥屬陰；味鹹藥屬陰，味淡藥屬陽。
五行學說，也是我國古代的一種哲學思想，它從另一個側麵來說明事物的變化規律和內在聯係。它認為，木、火、土、金、水是構成自然界的五種物質，其他任何事物都可以與其相比擬而歸入這五類。例如：人體的心、肝、脾、肺、腎（五髒），筋、脈、肉、皮毛、骨（五體），眼、舌、口、鼻、耳（五竅）
等以及春、夏、長夏、秋、冬（五季），風、暑、濕、燥、寒（五氣），青、赤、白、黃、黑（五色），酸、苦、甘、辛、鹹（五味）等，均依次被歸屬於木、火、土、金、水。這五種物質以及按其屬性所歸納的多種事物之間有著相互滋生、相互製約的關係，並處在不斷的運動變化之中。將這種相互滋生、相互製約的關係用“生”“克”二字來表示。具體生克關係是：木生火，火生土，土生金，金生水，水生木，木又生火，……這種“生”的關係循環不盡；木克土，土克水，水克火，火克金，金克木，木又克土，……這種“克”的關係往複無窮。
總之，中醫學將陰陽五行學說作為闡述人體生理、病理以及疾病的診斷、治療等方麵的說理工具，是中醫基礎理論的重要組成部分，與封建迷信毫不相幹。