不同的物質的命名也不盡相同，那麼怎麼來為化學物質命名呢，以下介紹幾種常見有機化合物的命名方法。
.烷烴的命名烷烴的命名是所有開鏈烴及其衍生物命名的前提，它的命名主要經過以下幾個步驟：
選主鏈。主鏈應該選擇最長的碳鏈，當遇到幾條相同的碳鏈的情況，則應選擇擁有較多取代基的碳鏈為主鏈。
編號。通常給主鏈編號時，都從離取代基最近的一端開始。
書寫名稱。一般用阿拉伯數字來表示取代基的位次，在書寫中要注意的是，首先要寫出取代基的位次及名稱，然後再寫烷烴的名稱；其次是如果有多個取代基時，要把容易的放在前麵，複雜的放在後麵；另外，通常會用半字線將阿拉伯數字與漢字隔開。
.幾何異構體的命名對烯烴幾何異構體的命名通常包括兩種方法，即順、反和Z、E，這兩種方法都用於簡單的化合物的表示，而Z、E方法則用於比較複雜的化合物。
用順反方法表示簡單的化合物時，相同的原子或基團在雙鍵碳原子一側的為順式，在兩側的為反式。
如果化合物比較複雜，如雙鍵碳原子上所連四個基團都不一樣時，這時候就不可再用順反表示，隻可用Z、E表示。
不過在命名幾何異構體的時候還是要注意，雖然一些化合物兩種方法都可以用，但是這兩種方法並不是想對應的，順式的不一定是Z型，反式的不一定是E型。
.光學異構體的命名光學異構體的結構通常有2種表示方法：D、L和R、S。因為用D、L標記法有一定的局限性，所以R、S標記法是使用比較多的，它是依據手性碳原子所連4個不同原子或基團在空間的排列次序進行標記的。不過光學異構體通常用投影式表示，所以我們理解這種命名還要明白費歇爾投影式的投影規則及構型的判斷方法。
.雙官能團和多官能團化合物的命名確定母體是雙官能團和多官能團化合物命名的主要內容。如何確定母體，常見有以下幾種情況：
當鹵素和硝基與其他官能團同時存在時，鹵素和硝基應該作為取代基，其他官能團為母體。
當雙鍵與羥基、羰基、羧基同時存在時，要以醇、醛、酮、羧酸為母體，而並不是烯烴。
當羥基與羰基同時存在時，以醛、酮為母體。
當羰基與羧基同時存在時，以羧酸為母體。
當雙鍵與三鍵同時存在時，應選擇最長的碳鏈為主鏈，而其還要既包含雙鍵又含有三鍵，給雙鍵或三鍵以盡可能低的數字編號，如果雙鍵與三鍵的位次數一樣，則應給雙鍵以最低編號。