“我們大日本帝國，對先生您的起義表示支持。”當時的台灣總督，兒玉源太郎故作熱情地對孫中山說。
因為他剛接到日本政府的指示：趁中國大亂之機將自己的勢力範圍從台灣擴大到福建和東南沿海。
孫中山當時一心想推翻清王朝，對日本政府的陰謀認識不夠，他將從日本手上購到準備用於起義的大量軍械放在台灣，隻想待一切準備就緒，再運到廣州去。
此事辦妥後，孫中山親自率領部分興中會會員，於1900年10月初趕到香港，部署起義。因香港當局阻止，孫中山又無法登岸，結果還是隻能在船上開會。
“此次起義，是我們以武裝革命手段，來實現民主共和國理想的又一次嚐試。根據以往的經驗，我們的失敗主要是勢單力薄，這一次，我們盡了全力來謀求更多的支持，采取依靠會黨和外援的做法。在軍械方麵，我們得到了日本人的支持，從他們手上購到了精良的武器；在資金方麵，除了我們興中會會員及愛國僑胞的傾力支持，還有許多跟我們的主張不很一致的人，也給予了支持，譬如劉學詢先生，就支持了百萬以上……”
“我們的目的是：驅除韃虜，恢複中國，創立合眾政府。我們堅決地選擇了武裝奪取政權的正確道路來達到我們的目的。因為隻有這樣，別無他法。起義的地點，我們確定在廣州和惠州，廣州為正軍，惠州作為旁軍作策應。為什麼要選擇這兩個地方，因為這兩個地方容易聚集我們的人，更便於接濟……”
這裏值得說明的是，在當時，興中會從領導到會員現在有籍可考的有286人，他們差不多都是廣東人。依此看來，孫中山對起義地點的選擇，是很正確的。
“現在我宣布：派史堅如到廣州去，負責廣州起義；派鄭士良到惠州去，負責惠州的起義。”
隨著孫中山的宣布，在熱烈的掌聲中，史堅如和鄭士良站起身來向大家點頭。
史堅如，是民族英雄史可法的後裔，自幼喜讀史書，尤好研究古今成敗的原因和中外兵家戰略，他崇拜英雄豪傑，憂國憐民，嫉惡如仇。1898年“戊戌政變”發生後，他大罵西太後那拉氏“可殺也！”1899年11月，他加入興中會，“誓以身殉革命”。孫中山對他非常器重，不久令他回國，聯絡長江一帶的會黨。
鄭士良，少有大誌，跟隨鄉中父老習武，結識不少會黨人物。1886年入博濟醫院學醫，與孫中山同學，對孫中山的革命主張十分折服。他既是興中會會員，又是會黨的領袖，得到孫中山的命令後，即刻趕往惠州，準備起義有關事宜。
誰知道，鄭士良準備工作正在進行，軍械都還沒有運到，清廷卻已經分水陸兩路，由提督何長清和鄧萬林率兵前來合圍。孫中山知道又是泄密讓清廷得到風聲，立即電告鄭士良：率義軍突出合圍，一到廈門，便有軍械接濟。
1900年6日晚，起義軍夜襲清軍，初戰告捷。10月15日，起義軍進攻平山、龍岡，再次告捷。10月17日，起義軍與清軍在永湖遭遇，以少勝多，鄧萬林中槍墮馬，狼狽逃命，起義軍第三仗告捷。10月20日，起義軍又在崩岡第四仗告捷。
就憑手中簡陋的武器，起義軍多次戰勝前來合圍的清軍，部隊已由起義開始的八千人發展到二萬餘人。清軍的合圍，眼看就成為泡影，可就在這時候，義軍已近彈盡糧絕。對這種情況，孫中山事先已經料到，下令急調台灣儲存的軍械，運往戰地。