報告指出，實施科教興國戰略，是實現經濟振興和國家現代化的根本大計，要大力推進改革，加快國家創新體係建設，促進科技成果的轉化和推廣，繼續把教育放在優先發展的戰略地位。要進一步實施可持續發展戰略，加強對資源的規劃和管理，合理利用和保護資源，加大治理環境汙染的力度。控製人口增長，提高人口質量。促進社會主義精神文明建設，繁榮各項社會主義文化事業。
報告要求，加強行政立法工作，強化執法監察，推進依法行政。要依法整頓經濟秩序，嚴厲打擊經濟違法犯罪活動。深人開展"嚴打"鬥爭，搞好社會治安綜合治理，維護社會穩定。從嚴治政，建設廉潔、勤政、務實、高效政府。報告要求各級政府和各部門進一步轉變職能，轉變工作作風，提高工作效率。加強廉政建設，進一步加大反腐敗鬥爭的力度，標本兼治，綜合治理。積極穩妥地推進地方政府機構改革，加強民族團結，維護祖國統一，促進共同發展。加強國防現代化建設，走有中國特色的精兵之路。
報告指出，要繼續全力支持香港特區政府按照基本法施政，推進香港與內地的經貿、科技、文化等各個領域的合作，維護香港的長期繁榮穩定。確保澳門實現平穩過渡和政權的順利交接。要繼續堅持"和平統一、一國兩製"的基本方針和江澤民主席提出的八項主張，認真做好各項對台工作，為進一步改善兩岸關係作出實際努力。要繼續貫徹鄧小平外交思想，始終不渝地奉行獨立自主的和平外交政策，堅決維護我國的獨立主權、領土完整和民族尊嚴，反對霸權主義，維護世界和平。在和平共處五項原則的基礎上，繼續發展同世界各國的友好關係。
九屆人大二次會議審議了《政府工作報告》，認為報告對政府1998年工作的總結是實事求是的，提出的1999年政府工作的總體要求和主要任務，經過努力是可以實現的。3月15日，大會表決通過了關於政府工作報告的決議。
這次會議還表決通過了《中華人民共和國憲法修正案》，根據這一修正案，鄧小平理論的指導思想地位、依法治國的基本方略、國家現階段的基本經濟製度和分配製度以及非公有製經濟的重要作用等被寫進中華人民共和國憲法。
會議還表決通過了關於1998年國民經濟和社會發展計劃執行情況與1999年國民經濟和社會發展計劃的決議，決定批準國務院提出的1999年國民經濟和社會發展計劃，批準曾培炎受國務院委托所作的報告；通過了關於1998年中央和地方預算執行情況及1999年中央和地方預算的決議，決定批準國務院提出的1999年中央預算，同意項懷誠受國務院委托所作的報告。
會議表決通過了《中華人民共和國合同法》，自1999年10月1日起施行。表決通過了《中華人民共和國澳門特別行政區第九屆全國人民代表大會代表的產生辦法》，根據這一辦法，澳門回歸後，將產生澳門特別行政區九屆全國人大代表12名。
經過表決，會議還分別通過了關於全國人民代表大會常務委員會工作報告的決議、關於最高人民法院工作報告的決議、關於最高人民檢察院工作報告的決議。
月15日，九屆人大二次會議閉幕。會議號召全國各族人民高舉鄧小平理論偉大旗幟，在以江澤民同誌為核心的黨中央領導下，統一思想、堅定信心，抓住機遇、知難而進，團結一致、艱苦奮鬥，把建設有中國特色社會主義的偉大事業勝利推向21世紀。
《中華工民共和國憲法修正案》通過
3月15日，在北京舉行的第九屆全國人民代表大會第二次會議以2811票讚成、21票反對、24票棄權表決通過了《中華人民共和國憲法修正案》。
憲法是國家的根本大法，在國家的政治、經濟、社會生活等方麵具有極其重大的作用。此次修憲是對1982年憲法的第三次修改。1988年和1993年我國曾對該部憲法的部分內容作了修改。黨的十五大以後，中國的改革開放和現代化建設出現了新的局麵。社會各界的許多人士建議根據十五大精神和改革與建設實踐的發展，對憲法作必要的修改。中共中央經過研究，提出了此次修憲的原則，即：隻對需要修改的並已成熟的問題作出修改，可改可不改的問題不作修改。隨後，中共中央成立了憲法修改小組，組織草擬了關於修改憲法部分內容的初步意見，經中共中央政治局常委審定並經中央政治局會議原則通過後，於1998年12月5日發給各省、自治區、直轄市黨委，中央各部委，國家機關各部委黨組（黨委），軍委總政治部，各人民團體黨組和中央委員、中央候補委員征求意見。