首都北京是國慶慶祝活動的中心。早在1998年5月起，首都建國50周年慶祝活動領導小組及其籌備委員會就開始抓緊設計方案，組織力量，分工落實。經過細致籌備，首都國慶慶祝活動主要包括：（1）1999年9月20日，在北京展覽館隆重舉辦了"光輝的曆程——中華人民共和國建國50周年成就展"。此次展覽曆時27天，以直觀、形象、生動的形式，采用各種現代化手段，濃縮了半個世紀以來中國人民走過的不平凡道路，多方位展示了建國50年來發生的巨大變化，特別是黨的十一屆三中全會以來改革開放和社會主義現代化建設的巨大成就。共有社會各界群眾150萬人次參觀了此次展覽。配合此成就展，還出版了大型文獻畫冊《光輝的曆程——中華人民共和國建國50周年成就特輯》，以近1300張圖片、65張統計圖表、近12萬字反映了成就展的精華。（2）9月28日，在人民大會堂舉行了《祖國頌》大型文藝晚會。晚會以宏大的結構、精美的製作、磅薄的氣勢，激勵人心，催人奮進。（3）9月30日晚上，國務院在人民大會堂舉行盛大的國慶招待會，黨和國家領導人與5000名中外人士歡聚一堂，共慶佳節。（4）10月1日上午，首都各界慶祝中華人民共和國成立50周年大會在天安門廣場隆重舉行。50萬各族軍民以盛大的閱兵儀式和群眾遊行，歡慶祖國的節日。（5）10月1日晚上，首都舉行國慶聯歡晚會，10萬名群眾在天安門廣場上載歌載舞，慶祝新中國成立50周年。（6）10月2日。北京舉辦國慶遊園活動，勞動人民文化宮、中山公園、北海公園、天壇公園等各大公園全部向遊人開放，以優美的景色、豐富多彩的活動內容吸引了數十萬群眾前往參觀遊覽。
月1日首都舉行的中華人民共和國50周年慶祝大會是全國國慶慶典活動的中心。這天上午，天安門廣場上空飄浮著34個大紅燈籠造型的氣球。其中2個直徑為7米的氣球下懸掛著五彩繽紛的花籃，象征50年來我國各項事業發展迅速、碩果累累、欣欣向榮、生機勃勃。其餘32個氣球分布在廣場四周，象征全國各省、自治區、直轄市各族人民的團結和統一。廣場上彩旗迎風招展，10萬名少先隊員、青年學生手持花束，組成紅底黃字的巨幅"國慶"字樣的圖案。
時整，慶典開始。莊嚴的升旗儀式之後，國家主席江澤民乘坐國產紅旗檢閱車，檢閱了由42個威武雄壯、軍容嚴整、裝備精良、精神抖擻的人民解放軍陸海空三軍和人民武裝警察部隊、民兵預備役部隊組成的地麵方隊。這是中國共產黨的第三代領導核心第一次在天安門廣場檢閱三軍部隊。
檢閱部隊後，江澤民登上天安門城樓發表國慶講話。他說，今天，我們在宏偉的天安門廣場，隆重慶祝中華人民共和國成立50周年。這是全國各族人民的盛大節日，也是檢閱我們成就和力量的莊嚴典禮。經過50年特別是改革開放20年來艱苦卓絕的奮鬥，昔日積貧積弱的中國發生了翻天覆地的曆史巨變。勤勞、勇敢、智慧的中國人民在黨的領導下，在古老的華夏大地上創造了舉世驚歎的人間奇跡。實踐已經充分證明，隻有社會主義才能救中國，隻有社會主義才能發展中國。實踐也充分證明，建設有中國特色社會主義，是實現中國經濟繁榮和社會全麵進步的康莊大道。江澤民主席在講話中宣布，從本世紀中葉到下世紀中葉，中國人民經過100年的艱苦創業，將基本實現社會主義現代化。在新的千年中，中華民族必將以自己新的燦爛成就，為世界文明作出更大的貢獻。江澤民強調，我們將繼續堅持黨的基本理論、基本路線、基本綱領，依靠全國各族人民的力量，在新的世紀裏不斷譜寫建設有中國特色社會主義的新篇章。將繼續堅持"和平統一、一國兩製"的方針，在實現香港和澳門順利回歸後，最終完成台灣與祖國大陸的統一。將繼續堅持獨立自主的和平外交政策，在和平共處五項原則的基礎上發展同所有國家的友好合作關係。他號召全黨和全國人民。高舉馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論的偉大旗幟，朝著輝煌的目標奮勇前進。
時36分，激動人心的閱兵分列式開始。由中國人民解放軍儀仗大隊組成的儀仗方隊護衛著八一軍旗走在最前麵。隨後，來自陸、海、空三軍，武裝警察部隊，民兵預備役的1萬多名官兵和400多台戰車、火炮、各種導彈等，分別組成16個徒步方隊和25個車輛方隊，浩浩蕩蕩通過天安門廣場，接受祖國和人民的檢閱，受閱部隊以空前的陣容、一流的訓練水平、堅定有力的步伐、勇往直前的英姿，展示了我軍革命化、現代化、正規化建設的巨大成就，展示了我軍威武之師、文明之師、勝利之師的風貌，展示了共和國鋼鐵長城維護祖國安全與統一、促進世界和平與發展的堅強決心和強大力量。11時5分，由空軍航空兵為主體，陸軍海軍航空兵聯合組成的10個空中梯隊低空飛過天安門廣場，拉出一道道絢麗的彩煙。