首次飛行試驗的成功，證明我國研製的飛船和新型運載火箭性能優良，新建的載人航天發射場和航天測控網具有先進水平。這次飛行試驗中進行的空間遙感和環境監測以及空間材料、生命、天文和物理科學試驗，拓寬了我國和平利用空間的領域。
飛船返回時，返回艙與軌道艙分離，軌道艙在太空軌道繼續運行，並按計劃開展預定的科學實驗工作。返回艙返回地麵，經確認完好無損，於23日運抵北京。次日，在北京空間技術研製中心大廳，"神州"號試驗飛船舉行了開艙儀式。工作人員打開返回艙封蓋後，首先取出一個盒子，裏麵裝著具有象征意義的中華人民共和國國旗和中華人民共和國澳門特別行政區區旗，還有一條參與這次工作的全體工作人員簽名的紅色條幅。這麵國旗將於2000年1月1日升起在天安門廣場上空，澳門特別行政區區旗也將於澳門回歸祖國的那一天在澳門特別行政區飄揚。隨後，工作人員又從艙內取出一個郵包，裏麵是3000枚紀念這次重大事件的紀念封和一些郵票。此外，在這次具有曆史意義的飛行試驗中，"神州"號返回艙內還搭載了許多物品。中國空間技術研究院和有關單位的專家們將抓緊時間分析各種數據，以帶動我國航天事業及相關科技和產業的發展，並為將來航天員上天作好技術準備。
月8日，中華全國總工會向為載人航天工程第一次飛行試驗做出突出貢獻的先進集體和先進個人頒發了全國五一勞動獎狀和全國五一勞動獎章。此前，中國運載火箭技術研究院於12月3日給"神州"號的功臣——王德臣等5位科學家頒發了特等"長征獎"，每人獎金10萬元。載人航天一直是國際航天界十分關注的一個高科技領域。我國發展載人航天技術，對促進科技進步，增強綜合國力和國防實力，增強民族自豪感和凝聚力，都具有重要意義。我國載人航天工程自1992年實施以來，取得了預期的效果。工程的研製和建設，體現了中國特色和技術進步，為走出一條符合我國國情的發展載人航天的路子進行了有益的探索；攻克了大量的關鍵技術，掌握了許多新技術、新工藝，提高了我國航天技術及相關技術的整體水平；培養了一支跨世紀的航天科技隊伍；使我國擁有了一批載人航天工程設施，為我國航天事業的持續發展奠定了堅實的物質技術基礎；豐富了我國大型航天工程管理經驗。首次飛行試驗的成功，表明中國人民完全有能力獨立自主地攻克尖端技術，在世界高科技領域占有一席之地。我國科技專家將對這次試驗結果進行科學分析，在完善各係統方案的基礎上，今後還要進行若幹次無人飛行試驗，最終實現我國載人航天的曆史性突破。
澳門回歸祖國懷抱年12月19日深夜，中葡兩國政府澳門政權交接儀式在澳門文化中心花園館隆重舉行。12月20日零時，伴著雄壯的《義勇軍進行曲》，中華人民共和國國旗和中華人民共和國澳門特別行政區區旗莊嚴升起，標誌著中國政府恢複對澳門行使主權，澳門終於回到祖國懷抱。
澳門自古以來就是中國的領土。16世紀中葉，澳門被葡萄牙逐步占領，1840年鴉片戰爭後，葡萄牙人攫取了對澳門的管治權。在經曆了400多年的風雨歸程之後，澳門終於回到祖國懷抱，這是中華民族的一大盛事。
改革開放的深入發展，"一國兩製"構想的提出，為澳門回歸提供了堅實的基礎。1987年4月13日，中葡兩國經過友好談判，發表了《中華人民共和國政府和葡萄牙共和國政府關於澳門問題的聯合聲明》，澳門由此進入12年的平穩過渡期。在中葡兩國的積極合作基礎上，雙方妥善解決了澳門回歸中國的各種曆史遺留問題，為順利回歸準備了條件。
年5月5日，全國人民代表大會澳門特別行政區籌備委員會在北京宣告成立，籌建澳門特區的工作正式啟動。在一年半的時間裏，籌委會完成了全國人大常委會賦予的9項任務，包括：籌組澳門特別行政區第一屆政府；產生第一任行政長官人選報中央人民政府任命；製定第一屆立法會和司法機關的具體產生辦法；提出與平穩過渡有關的重大法律問題的處理意見，以及研究涉及澳門經濟、社會、文化等各個方麵平穩過渡的許多問題；提出特區成立慶典儀式和慶祝活動方案等。1999年5月15日，何厚鏵當選為特區首任行政長官人選；20日，國務院任命何厚鏵為澳門特區第一任行政長官，澳門從此進入"澳人治澳"、"高度自治"的時代。
經過緊張而有序的籌備，隆重、莊嚴的中葡澳門政權交接儀式如期舉行。12月19日23時42分，政權交接儀式開始。葡萄牙總統桑帕約在講話中說，兩國就澳門地位協議的最終達成，充分體現了雙方在此問題上的實事求是態度及和平方式解決問題的智慧，使兩國之間數世紀的悠久關係步人一個新時期。23時58分，葡萄牙國旗和澳門市政廳旗緩緩降下。20日零時整，軍樂團奏響中華人民共和國國歌，中華人民共和國國旗和澳門特別行政區區旗冉冉升起。至此，中葡兩國政府完成了澳門政權的交接。國家主席江澤民隨後講話，他說，從這一刻起，澳門的發展進人一個嶄新的時代。澳門回歸後，中國政府將堅定不移地貫徹執行"一國兩製"、"澳人治澳"、高度自治的方針。江澤民說，中國政府按照鄧小平提出的"一國兩製"的偉大構想，成功地解決了香港、澳門問題，這是中國人民在完成祖國統一大業中取得的重大進展。"一國兩製"在香港、澳門的實踐，已經並將繼續為我們最終解決台灣問題發揮重要的示範作用。中國政府和人民有信心有能力早日解決台灣問題，實現中國的完全統一。他相信，回到祖國懷抱的澳門，必將迎來更加美好的未來。