由於軍事上的大量開支，秦始皇死後留下了一個國庫空空的爛攤子。在這種情況下，縱使後人有千般本事，萬丈雄心，也無力回天了。
（四）秦朝亡於郡縣製
有的學者認為秦朝滅亡並非亡於焚書坑儒之類的暴政，而是亡於郡縣製。
為了有效地管理國家，也為了替子孫萬代奠定基業，秦始皇在統一全國後，首先吸取戰國時期設置官職的經驗，建立了一套相當完整的中央集權製度和政權機構。
秦始皇在朝廷中設置丞相、太尉、禦史大夫。丞相有左右二員，是百官之首，掌管國家政事。太尉掌軍事，但不常置。禦史大夫是丞相的助手，專掌圖書秘籍，監察百官。
丞相、太尉、禦史大夫以下，是分掌具體政務的諸卿，其中有掌宮殿掖門戶的郎中令，掌宮門衛屯兵的衛尉，掌京畿警衛的中尉，掌刑罰的廷尉，掌穀貨的治粟內史，掌山海池澤之稅和官府手工業製造以供應皇室的少府，掌修建宮室的將作少府，掌國內民族事務和外交事務的典客，掌宗廟禮儀的奉常，掌皇室屬籍的宗正，掌輿馬的太仆等。丞相、太尉、禦史大夫與諸卿在朝廷上議論政務，最後由皇帝裁決。
此外，秦代還有一些比較重要的官職，如博士“掌通古今”，即通曉古今史以備皇帝谘詢，同時負責圖書收藏；如典屬國與典客一樣主管少數民族事務，不同的是典客掌管與秦友好的少數民族的交往，而典屬國則負責已投降秦朝的少數民族；如詹事管理皇後和太子的事務。
安頓好了朝廷，秦始皇又采納李斯的建議，廢除分封製，改行郡縣製。地方行政機構分郡、縣兩級。郡縣主要官吏由中央任免。
郡設守、尉、監（監禦史）。郡守為郡的長官；郡尉輔佐郡守，並典兵事；郡監負責監察。秦始皇把全國分成三十六郡，南平百越，北擊匈奴後又增至四十一郡：
秦地：巴郡、蜀郡、隴西郡、北地郡；
趙地：太原郡、雲中郡、邯鄲郡、巨鹿郡、雁門郡、代郡、常山郡；
魏地：上郡、河東郡、東郡、碭郡、河內郡；
韓地：三川郡、上黨郡、潁川郡；
楚越之地：漢中郡、南郡、黔中郡、南陽郡、陳郡、薛郡、泗水郡、九江郡、會稽郡、長沙郡、衡山郡；
齊地：東海郡、齊郡、琅玡郡、膠東郡、濟北郡；
燕地：廣陽郡、上穀郡、漁陽郡、右北平郡、遼西郡、遼東郡；
南越故地：閩中郡、南海郡、桂林郡、象郡；
匈奴故地：九原郡。
縣，萬戶以上者設令，萬戶以下者設長。縣令、縣長之下有丞、尉及其他屬員。縣令、縣長主要管政務，縣尉掌握軍事，縣丞掌管司法。
縣以下設鄉，負責攤派徭役，征收田賦，查證本鄉被告案情，參與對國家倉庫糧食的保管工作。鄉設三老掌教化，嗇夫掌訴訟和賦稅，遊徼掌治安。
鄉下設裏，裏是最基層的行政單位。裏由裏典擔任長官，後代稱裏正、裏魁。裏中設置嚴密的什伍戶籍組織，以便支派差役，收納賦稅，並規定互相監督，一人犯罪，鄰裏連坐。此外還有管理治安、嚴禁盜賊的專門機構，叫做亭，亭設亭長。亭還負責接待往來的官吏，為政府輸送、采購、傳遞文書等事。兩亭之間，相距大約十裏。
兩千多年來，人們一提到“秦”，總要在前麵加一個“暴”字，“暴秦”幾乎成了秦朝的代名詞。
其實，封建統治是專製統治，專製統治的最高目的是為了鞏固帝王的特權，因此，對於一切妨礙帝業的言論和行為，即使是父子兄弟，也要殘酷鎮壓。封建帝王的殘暴是專製體製的必然產物，說暴政是秦王朝滅亡的根本原因，是不妥的，哪個王朝不殘暴？