清涼峰因地形複雜，生態環境特殊，林木茂盛，雨水充足，因而不僅珍稀動物種類繁多，還有大量具有特殊經濟價值和科研價值的優良珍貴樹種。屬國家保護的珍稀動物有梅花鹿、白冠長尾雉、獼猴、蘇門羚、白鷳、大靈貓、小靈貓、穿山甲、黑鹿、獐、四不像等數十種；石雞、大鯢也頗有名氣；另外，還有山雀、灰喜鵲、啄木鳥等200多種山禽，常翔集在山間深穀和茂密林中，或嚶嚶細吟，或啾啾歡唱，使保護區內更加充滿生機。清涼峰是皖南山區的綠色寶庫之一。現已查明，保護區內有高等植物千餘種，其中木本植物400多種，珍稀植物30餘種，被列為國家重點保護的植物有華東黃杉、珍珠黃楊、香果樹、蓮香樹、鵝掌楸、金錢鬆、黃山梅、天女花、繡球花等20餘種。被國家列為重點保護的一類樹種“華東黃杉”，是白堊紀或更古時代殘存下來的孑遺樹種，安徽省內除黃山雲穀寺等處尚存一兩株外，已瀕臨絕種邊緣。而科學工作者卻在此處發現了成片的20多株華東黃杉。不僅具有觀賞、實用價值，更有著突出的科研價值。
如同鄰近的牯牛降，作為自然保護區之一的清涼峰，經有計劃地開發後，不僅會使自然景觀得到更好的保護，還會有人文景觀點綴其間。到那時，它既是國內外科研人員的目光注意之所，又是廣大旅遊者向往的、串在黃山至杭州旅遊熱線上的一顆山嶽風景名珠了。
十六、河南伏牛山國家級自然保護區
該區位於河南省西峽、內鄉、南召、欒川、嵩縣、魯山等6縣境內，麵積56024公頃。保護區由西峽老界嶺黑煙鎮、黃石庵、南召寶天曼、欒川老君山、嵩縣龍池曼、魯山石人山等6個保護區組成。這6個保護區分別於1980年和1982年經河南省人民政府批準建立，經規劃調整後構成一個完整的統一體，並於1997年晉升為國家級，主要保護對象為天然闊葉林森林生態係統。
伏牛山東西走向，是我國北亞熱帶和暖溫帶的氣候分區線和中國動物區劃古北界和東洋界的分界線，也是華北、華中、西南植物的鑲嵌地帶，屬暖溫帶落葉闊葉林向北亞熱帶常綠落葉混交林的過渡區。區內森林植被保存完好，森林覆蓋率達88％，是北亞熱帶和暖溫帶地區天然闊葉林保存較完整的地段。特殊的地理位置和複雜多樣的生態環境條件，加之人為幹擾較小，使本區保存了豐富的生物多樣性資源。區內維管束植物有2879種，其中有中國特有屬37個，單屬種59個，國家重點保護野生植物有連香樹、香果樹等32種；野生動物中獸類有62種，占河南省獸類總數的86％，鳥類有213種，占河南省鳥類總數的71％，昆蟲的種類則超過3000種，列為國家重點保護的野生動物有金錢豹、麝、大鯢等50多種。伏牛山還是長江、黃河、淮河三大水係一些支流的發源地，為重要的水源涵養林區。
十七、湖北神農架國家級自然保護區
位於湖北省房縣、興山、巴東三縣交界處，麵積70467公頃，1978年經湖北省人民政府批準建立，1986年晉升為國家級，1990年加入聯合國教科文組織國際“人與生物圈”保護區網，主要保護對象為北亞熱帶山地森林生態係統及特有、珍稀物種。
本區地處大巴山係與武當山係之間，主峰大神農架海拔3052米，素有“華中屋脊”之稱。區內植被以亞熱帶成分為主，兼有溫帶和熱帶成分，並具有明顯的垂直地帶性。本區是國內各動植物區係彙集的地區，同時也是我國特有屬的分布中心之一。高等植物有1919種，其中國家重點保護植物有珙桐、水青樹等32種。藥用植物有1200多種；陸生脊椎動物有500多種，國家重點保護動物有金絲猴、小熊貓等43種；神農架特有物種有神農香菊等10多種。近年來，神農架多次發現有“白熊”、“白金絲猴”等白化動物，引起中外科學家的高度重視。此外，神農架奇麗的自然景觀，豐富的生物資源和濃厚的神秘色彩，是生態旅遊和探險旅遊的勝地。
十八、湖南壺瓶山國家級自然保護區
位於湖南省石門縣境內，麵積40847公頃，1982年建立省級自然保護區，1994年晉升為國家級，主要保護對象為亞熱帶森林生態係統和野生動植物種。
壺瓶山主峰海拔2098.7米，為湖南最高峰。保護區內相對高差達1847.7米，地形複雜，生態環境多樣，生物資源豐富，植被垂直分帶現象明顯，森林植被為華中植物區係地帶性的代表。由於該地在曆史上未受到第四紀冰川的影響，保存了大量的古老孑遺植物及種群。區內共有高等植物206種，其中國家重點保護植物有34種，珙桐、水青樹、野臘梅等特有原生型珍稀植物群落具極高的科研價值。陸棲脊椎動物有272種，昆蟲有4145種，且新發現新屬1個，新種31個，列為國家重點保護的野生動物有25種，特別是該區有華南虎及其繁殖種群的存在。保護區豐富和特殊的生物多樣性資源使其具有重要的植物地理學意義及保護價值。