密宗的咒語共包括108種真言，一般都要以3或7或108的倍數來念誦。
密宗持咒的方法主要有10種，即：（1）蓮花念誦；（2）金剛念誦；（3）唇吻念誦；（4）光明念誦；（5）隨息念誦；（6）聲生念誦；（7）真實念誦；（8）心意念誦；（9）計數念誦；（10）三摩地念誦。
密宗的教徒在修長壽時，念的是“延壽咒“，修煉時，要與觀無量壽佛相配合。
3．結手印
身密為藏傳密宗“三密”之一，其主要特征是“手印”，即手結印契。手印，簡單說來就是雙手所做的各種姿勢。多數手印的含義，皆按固定的規則組成，一般以左手表示禪定，右手表示“方便”（辦事）。又以右手五指從小指至大指依次表示菩薩道“十度”中的施、戒、忍、進、定五度，以左手小指至大指依次表示智、力、願、方便、慧五度。又五指從小指至大拇指，依次表示地、水、火、風、空“五大”。十指按十度、五大的關係組合，交叉、鉤曲、伸直，配合而為多種多樣的手印。密宗的手印數以千計，常見的有380餘種，每一種都有特別的涵義和作用。手印作為手勢語言，表示一定含義，可以輔助真言，起到自我暗示的作用。手印配合五大的組合法則，符合中醫經絡、陰陽、五行相生相克的原理，有助於氣血的交流、開合、抗衡，從而產生輔助入定或調動內氣的作用。對於修持有素者來說，手印作為一種表示一定意願，與自身經絡相應的發功信號，有助於內氣的發放及意念作用的成功。
身密的修持以手印為主。手印配合想像的意念，形成某一修法。有人提出：手印像天線，人體像收音機。這說明了人的手印可以溝通人體與大自然的關係。實際上，身密中的手印運用，涉及人體光學、電學、無線電學的奧秘，有待科學的進一步發展來加以研究解釋。
藏傳佛教的養生修煉方法（2）
4．氣、脈、明點修持法
藏密功理認為，人的身體是由脈、氣（風）、明點組成的，脈、氣（風）、明點三者相互依存，脈如居宅，精如財寶，氣（風）心為主人。密宗三修持之一的脈、氣、明點的修習，就是一種引導意念依一定路線運行的入靜方法。
密宗通過修脈、氣（風）、明點，能使人體更好地從飲食中吸收營養物質——水穀之氣，從而得到“真氣”，或稱元氣或正氣。它是維持人體生命活動、營養全身的組織、抵抗外邪侵襲、推動髒腑機能活動最重要的物質。故通過氣、脈、明點的修習，可使身體悅澤，麵色光輝，鬢毛潤澤，耳目精明，令人食美，氣力強健，百病皆除。還能使人體真氣充足，體內脈道或者血脈，甚至包括經絡、神經、內分泌係統通暢，具有養生延年之功效。
脈，是無上瑜珈所說身中氣血循環的通道，大致相當於中醫所說的經絡。藏密認為：人身共有7萬2000脈，其中重要者有120，尤其重要的有24，而對瑜珈修煉者來說，最重要的有左、中、右三脈。三脈中尤以中脈為最重要，此脈又稱“命脈”。一般認為中脈上端達頭頂“梵穴”（百會），向前彎下至兩眉之間，下端開口於“密處”（外生殖器口），而左脈和右脈就在中脈的兩旁，從左右兩鼻孔上行入腦分循中脈兩側下行，至臍下四指處與中脈會合。三脈於頂、喉、心、臍等處纏繞成結，稱“脈結”，是阻止氣入中脈而自控生命、心識的生理性障礙。
脈輪，則是無上瑜珈修煉時在身內觀想的重要部位，相當於道教所說的丹田。脈輪皆以中脈為軸心，向四周輻射出支脈，狀若車輪，故稱“輪”。在寧瑪派的《大圓滿禪定休息要門密記》中談到：“以依於身，身之根本為脈，脈中有氣與明點，是氣與明點依於脈，脈又依於身也。……頂上有大樂輪，形若傘，周具輪齒三十二（32條支脈）；喉間有受用輪，若傘倒立，周具輪齒十六（16條支脈）；心中有法身輪，亦若傘，周具輪齒八（8條支脈）；臍中有化身輪，亦若傘倒立，周具輪齒六十四（64條支脈）明點。”
無上瑜珈將人身中生命能量的凝聚點及體液看做是明點。因此明點又被譯為“真精”、“真水”等。它主要分為：離戲明點、錯亂明點、物明點三類。離戲明點是精神精華，為最細風心之體。錯亂明點即一般人身中所具、由依無明所起的身心的活動所生，及修瑜珈時在身內所觀想的明點。而物明點則為有形質的水液，分淨濁兩種。淨者為飲食精華化成的精血津液，濁者為汗涕尿等排泄物。