他們還保留著一種特殊的宗教紀年法，每年13個月，每月20天，稱為卓爾金年。這種紀年法不是以地球上所觀察到的天體運行情況為根據測算出來的。敏感的人們有理由懷疑，這種紀年法來自他們的祖先，而他們的祖先則來自另一個星球。
瑪雅人會製造車輪，卻不應用在實際生活上，令人感到大惑不解。尤其瑪雅人既不用車輪，也不借助家畜，更不用金屬，那他們建造巨石建築，真的隻用人力嗎？在大型金字塔附近，並沒有道路或水路可供運輸，但有大型的平坦的廣場，因此使人懷疑瑪雅人是否曾受到外星人的協助建造金字塔。在許多瑪雅的古建築群遺跡中，如危地馬拉的提卡爾、墨西哥的帕倫格等，在高大的金字塔和建築群中間都有寬敞的廣場，外星人可能就把這些廣場當做飛碟降落場所。因此瑪雅人可能在外星人的協助下，直接使用飛碟作交通工具，所以始終沒有留下道路的遺跡和運輸工具的遺物。
1927年在洪都拉斯一次瑪雅文化古代都市魯巴達的挖掘工作中，考古學家在已倒塌的祭壇中發現一千年前的水晶頭蓋骨。此水晶頭蓋骨是利用高純度的透明水晶所製成，沒有留下使用工具的痕跡，其硬度約是七度，用一般刀子是絕不可能打造完成的，而且和人類的頭蓋骨十分類似。
更令人驚訝的是，當激光射中頭蓋骨的鼻孔，刹那間整個頭蓋骨放出光芒。經過專家的細心研究，證實此水晶頭蓋骨是利用某種碰撞力量雕刻成的，在其頭部及麵部發現有“雙晶”（受碰撞而形成的結晶）。古代的工匠究竟是運用什麼高科技製造這個水晶的呢？據很多人猜測這也很有可能是外星人的傑作。
1952年6月5日，人們在墨西哥高原的瑪雅古城帕倫克一處神殿的廢墟裏，發掘出了一塊刻有人物和花紋的石板。當時人們僅僅把這當做是瑪雅古代神話的雕刻。但到了六十年代，人們乘坐宇宙飛船進入太空後，那些參與過宇航研究的美國科學家們才恍然大悟：帕倫克那塊石板上雕刻的，原來是一幅宇航員駕駛著宇宙飛行器的圖畫！雖然經過了圖案化的變形，但宇宙飛船的進氣口、排氣管、操縱杆、腳踏板、方向舵、天線，軟管及各種儀表仍清晰可見。這幅圖畫的照片被送往美國航天中心時，那些宇航專家們無不驚歎，一致認為它就是古代的宇航器。這似乎令人難以置信，但卻是確鑿的事實。
傳說中瑪雅人最早的神祇來自外星，是他們帶來文明的腳步，促使地球上形成孕育文化的搖籃。那麼為什麼他們又突然消逝得全無蹤跡？神秘的瑪雅人之謎究竟何時才能查出其全貌呢？至今仍無人知曉。
蒂卡爾古城突然消失之謎
迄今為止，瑪雅文明還是一個尚未解開的迷局。公元10世紀的瑪雅遺跡，散布在中美洲的熱帶叢林之中，其中的蒂卡爾城就是一個神秘的地方。
蒂卡爾，意即“能聽到聖靈之聲的地方”，是最重要的瑪雅城邦之一，也是迄今為止發現的曆史最悠久，規模最大的一座瑪雅古城，公元200年到公元850年左右達到頂峰。10世紀末，蒂卡爾被徹底遺棄，在原始森林中默默地度過了幾百年光陰。
1848年一個叫莫德斯托·門德斯的人被蒂卡爾傳說所吸引，來到這裏作了一次探險性考察，然而未獲結果。直到上世紀這座湮沒在原始森林中長達數十世紀之久的文化遺址才被正式發現。
這座古聖城距今已有1100年至2000多年的曆史。整個古建築群被一望無際的林海包圍著，在樹林中掩映著眾多的勝景靈跡：巍峨雄壯的金字塔，金碧輝煌的神廟、殿堂，令人費解的石碑，形象逼真、栩栩如生的雕刻，廣漠宏偉的廣場，讓人讚歎和敬仰不已。
蒂卡爾建在沼澤環繞的丘陵上，由九組建築群和大廣場組成，以橋梁和堤道相連，占地麵積約2.6平方公裏。整個8世紀，蒂卡爾曾連續出現三個強大的國王：阿卡高王、雅克京王和奇坦王。今天所看到的蒂卡爾城，就建於這三個國王的太平盛世。
外貌驚險的金字塔是蒂卡爾最主要的建築成就。這裏的瑪雅金字塔和墨西哥、埃及的有很大不同，一般為斜截錐形，由高大的台基及其頂端的神殿構成，其外觀十分勻稱。藍天之下，一座座拔地而起的金字塔刺破林莽的密網，在絢爛的熱帶陽光下遙遙相對，熠熠生輝。更令人歎為觀止的是蒂卡爾金字塔斜度達70度的驚人設計，其外形有如歐洲哥特式教堂般奇峭，因而被稱為“叢林大教堂”。