對於內地生而言，香港與內地高校差異較大，要過語言關，要適應當地文化，無疑是更大挑戰。一位中文大學的內地學生說，香港學生隻懂得儀器的英文名稱，而內地學生隻懂得中文叫法，這種交流的障礙和衝突特別明顯，在理科各種課程的學習中尤為突出。
曾在複旦大學“委培”一年的香港大學法律係學生駱嘉昀做過比較，“香港大學與北大、複旦等內地一流學府在‘文化’上差別很大。”學會自主和做選擇，將是內地學生在香港麵臨的最大難題。駱嘉昀還說，“所有課程的時間都要學生自己安排，還要爭取獎學金、交流的機會，這些光想是沒有用的。”不過這既是難關也是鍛煉。還在上預科的劉揚覺得自己成熟很快，因為“辦身份證、簽證續簽等都要自己處理，交流也要自己計劃，而國內的大一學生還和高三時差不多”。
香港城市大學的內地學生劉熠說：“在這個時候，真的需要慎重考慮一下，並不能完全憑一些外麵的一些宣傳，或者說那個專業比較熱門那個學校比較著名等等。應該考慮一下自己希望什麼、興趣在哪裏、長處又在哪裏，選擇一個自己又有興趣、又發揮自己長處的專業。”
據介紹，由於香港的金融行業非常發達，是同倫敦、紐約齊名的國際金融中心，所以香港高校開設的金融類專業在世界上還是非常有競爭力的。學生如果希望學習金融類專業，可考慮前往香港上學，這樣不僅能在香港這個跨國銀行總部、會計師事務所等雲集的亞太金融中心開闊自己的專業視野，還能增加許多進入世界名企工作的機會。但是有些專業香港就不一定比內地好，在香港的大學就不一定學得好，在香港就不一定找得到好工作。
也就是說，香港的大學並不是每個學科都好。比方說香港城市大學的資訊專業很好，排名靠前；但如果孩子想學酒店管理，城市大學就不怎麼樣，那麼最好就要去香港中文大學。換過來，中文大學的資訊專業就不如城市大學。
香港大學教務長韋永康也認為，比如你有興趣做農業發展研究的，香港在這方麵並沒有什麼大的領域，所以學生要自己看到將來想做什麼，我覺得他也應該到香港大學，或者到香港任何大學之前，做一點自己的分析、考慮看看，到底香港大學是什麼樣的學校、什麼樣的教育，香港的城市適不適合他們。不要說人家申請，他也申請。多一點了解，然後最終自己做一個決定，到不到香港大學來。
香港大學中國事務總監黃依倩2006年7月19日在接受《新民晚報》記者李瑋采訪時也表示，內地和香港的高校各有各的優勢：“比如，內地高校以學風嚴謹和學科係統性見長，而港大則以發展學生潛能為特色。”
新浪網友“科大青椒”日前說，在自然科學方麵，香港並不一定有很大優勢，比如數理化，香港學數理化的學生並非最優秀的學生，教師授課當然就不能太深。