（2）精漿生化檢查：精漿的化學成分分析有助於對附睾、前列腺、精囊功能的了解。患者有精液量少、無精症、少精症、不明原因的精子活動力下降、附屬性腺先天缺陷及附屬性腺疾病等情況時，可做精漿生化檢查，常見有果糖、肉毒堿、酸性磷酸酶等。
（3）免疫不育的相關檢查：有些男性不育與產生抗精子自身免疫反應有關，輸精管道梗阻、睾丸損傷或炎症、附睾和附屬性腺感染等都可在體內形成抗精子抗體。通過精子凝集試驗、精子細胞學毒試驗、精子製動試驗及間接免疫熒光試驗等免疫學方法，進行患者血清中的抗精子抗體的定性或定量測定。
（4）血、尿的檢查：血和尿常規的檢查，抗鏈球菌溶血素“Ｏ”測定，血糖、尿糖測定，梅毒血清反應測定，以排除可能與男性不育有關的糖尿病、梅毒等疾病。
（5）相關微生物檢查：泌尿、生殖係統感染常常導致男性不育，與男性泌尿、生殖係統感染有關的病原微生物有細菌、病毒、螺旋體、支原體等，常見的有淋球菌、乳頭瘤病毒、支原體、沙眼衣原體等。疑有生殖道炎症可做尿細菌培養、前列腺液或精液細菌培養。
（6）內分泌檢查：生殖內分泌功能障礙影響男性的性功能和生殖功能，是男性不育症的一個重要原因。內分泌檢查主要是有關性激素T、FSH、LH、PRL、E2 的測定和各種激發試驗，如 HCG 刺激試驗等。
（7）遺傳學檢查：男性相關染色體及基因的正常是維持正常生殖功能的基礎，染色體及基因的異常會導致性分化異常和（或）精子生成障礙，從而嚴重影響生殖功能。
4. 特殊檢查與診斷
對於一些難以確診的男性不育症患者，必要時可做一些特殊檢查，以確定診斷，常用的檢查方法有：
（1）X 線及 CT 檢查：為確定輸精管道的梗阻部位，可采用輸精管、附睾造影，輸精管、精囊造影或尿道造影等；前列腺造影可發現前列腺增大的程度及前列腺癌；睾丸及附睾結核可通過 X 線檢查確定病變範圍；陰莖的 X 線檢查主要針對陰莖硬結症、陰莖異常勃起。高泌乳素血症者，可攝蝶鞍 X 線斷層正側位片以確定有無垂體腺瘤，也可通過 CT 或 MRI 檢查確診。男性生殖係統 CT 檢查可確診前列腺增生肥大、前列腺癌、睾丸發育不良、睾丸腫瘤等。
（2）超聲檢查：主要用於鞘膜積液、附睾血腫、精索靜脈曲張、附睾囊腫、附睾炎症、睾丸腫瘤、睾丸扭轉等。多普勒超聲有助於確診精索靜脈曲張，前列腺疾病也可用超聲波方法進行檢查。
（3）睾丸活檢：直接檢查睾丸曲細精管的生精功能及間質細胞的發育情況，局部激素的合成與代謝通過免疫組化染色法進行檢查。本方法主要用於無精子症或少精子症患者。當精子計數低於 2000 萬/毫升時，即有指征做睾丸活組織病理學檢查。這項檢查可鑒別無精子症或少精子症的原因，是睾丸生精能力喪失還是精道阻塞。睾丸活檢可采取穿刺或陰囊切開法取活組織。生精功能障礙有以下幾種情況。
① 支持細胞綜合征（生精上皮發育不良）：幾乎所有的精曲小管見不到生精上皮而僅有支持細胞，管徑輕度縮小，其他大部分正常，是先天異常所致，無治療指征。
② 精子成熟障礙：精子發育停滯在初級精母細胞、次級精母細胞或精子細胞階段不能發育成精子。
③生精功能減退：精曲小管中存在各階段正常的生殖細胞但其數量減少，生精的上皮組織結構紊亂，未成熟精子細胞脫落在小管腔中，個別細胞出現核異常改變。
④克蘭費爾特綜合征（Klinefelter syndrome）：精曲小管直徑變小，無生殖細胞僅有支持細胞，精曲小管基底膜增厚或呈玻璃樣變，間質細胞過度增生，染色體多為 47，XXY。