在阿裏巴巴的發展史上，具有轉折性和戰略性的一幕就是阿裏巴巴收購雅虎中國業務。2005年8月11日，阿裏巴巴在京宣布收購雅虎中國全部資產，同時得到雅虎10億美元現金投資。根據阿裏巴巴公司11日發布的材料，阿裏巴巴收購的雅虎中國的資產包括雅虎中國門戶網站，雅虎的搜索技術、通信和廣告業務，以及3721網絡實名服務；雙方還計劃將一拍在線拍賣業務中雅虎的所有部分並入阿裏巴巴；阿裏巴巴公司還將獲得互聯網品牌“雅虎”在中國的無限期獨家使用權。收購雅虎中國後，阿裏巴巴公司旗下公司將包括阿裏巴巴中國網站，阿裏巴巴英文網站，淘寶網、支付寶和搜索門戶一搜、在線拍賣網站一拍、中文上網服務3721及雅虎中國門戶。同時，雅虎將向阿裏巴巴投資10億美元現金，用於從阿裏巴巴及其他股票持有者手中購買阿裏巴巴的股票。根據此次達成的協議，雅虎將獲得阿裏巴巴40％的經濟受益權和35％的投票權。雅虎因此成為阿裏巴巴最大的戰略投資者。
阿裏巴巴公司目前擁有全球領先的B2B業務以及亞洲領先的拍賣和網上安全支付體係，此次並購完成後，阿裏巴巴將獲得雅虎領先的搜索技術和平台支持，以及強大的產品研發保障。而搜索技術將在電子商務發展中起到極其關鍵的作用。馬雲曾經不止一次地強調“搜索”在電子商務領域的重要性，而鑒於3721的中小企業渠道資源對阿裏巴巴所從事的B2B領域的重要，此前阿裏巴巴也曾參與到對3721的競價中去，如果收購成功，阿裏巴巴輾轉入主雅虎中國，無論是對雅虎的本土化策略而言，還是對阿裏巴巴的電子商務而言，似乎都是一件雙贏的事情。
並購完成後，阿裏巴巴將可以運用雅虎的搜索技術進一步豐富和擴大電子商務的內涵，在B2B和C2C領域鞏固和擴大自己的領先優勢。雅虎中國的網絡實名與阿裏巴巴B2B業務都是為中小企業服務，這二者的結合將會給眾多中小企業提供更大的選擇機會。
馬雲放言：“阿裏巴巴下一步的戰略方向是電子商務，永遠是電子商務、電子商務、電子商務……？薰對於阿裏巴巴是否會做門戶網站或即時通信，馬雲說：“至少我們現在是在做電子商務，我們所做的一切事情都是為了電子商務，電子商務需要的一切事情我們都會做。”
雅虎當家人楊致遠對阿裏巴巴未來的發展也是集中在B2B方麵：阿裏巴巴將選擇全力做好自己所熟悉的事務。電子商務是阿裏巴巴的根基所在，他們在搜索業務上投入了大量精力，如果將搜索業務與電子商務進行良好整合，無疑將產生巨大的市場影響，而這種做法已成為全球性潮流。以電子商務為中心，加上電子郵件、即時通信及AliPay在線支付係統，這就是阿裏巴巴將大力發展的核心業務，而他們的市場增長也將圍繞這些領域而展開。
時至今日，阿裏巴巴的事業幾乎是一路順暢的。它的策略很簡單，也很執著，就是堅持做經紀人，自己不直接交易，但它在中外企業的供求鏈上，搭建了一個最大的“信息中轉俱樂部”，生意你們自己去談，但給我留下介紹費、場地費。
2004年，阿裏巴巴已經達到了500多萬家會員，在海外世界500強當中有170多家企業是阿裏巴巴的客戶。到目前為止，阿裏巴巴在中國的企業會員突破了300多萬家，海外有200萬家，專業買家達40多萬。2003年，阿裏巴巴實現贏利1億元。
現在的阿裏巴巴還不是馬雲的理想狀態，現在商家隻是聚集在阿裏巴巴上交換買賣信息，馬雲希望將來是“工作與生存在阿裏巴巴”，把財務、人事、經營全放在上麵。與此同時，仿佛為了證明自己的定力了得，對這幾年三大門戶網站紛紛撈錢的短信、彩信業務，以及陳天橋、馬化騰們的網遊業務，馬雲都未曾涉及。