幫辦大人，看來阜康首當我軍衝要。老湘軍願與金大人一起進攻阜康，不知金大人意下如何？
作戰方案報到肅州，左宗棠點頭稱許：徐占彪所部五營，已經進抵巴裏坤，駐紮在木壘河以東。金順應分兵留駐古城至大石頭一帶，與徐占彪相接。徐萬福等五營立即出關，分別駐紮安西、敦煌、惠回堡、青頭山口，將張曜的留防軍一並調赴哈密，重防南路。
另外，金順所部和老湘軍已經控扼阜康，敵軍北竄，必走阜康以西。傳令：烏魯木齊領隊大臣錫綸，立即將桂錫楨各營派往沙山和馬橋扼守。
接著，左宗棠奏請朝廷下令，要塔爾巴哈台、科布多、烏裏雅蘇台各地領兵大臣增兵防守漠北，並催促南北兩路的儲糧迅速運到巴裏坤和古城。
左宗棠還不放心，又給金順寫信，派快馬交遞。
巴裏坤與古城交界各站，是最緊要的關隘，大軍後路糧餉和文報，必須經此處送達，千萬不能被敵軍截斷。此次大軍逼攻，敵軍逃跑路線，隻有一南一北，一定要嚴密設防。而巴裏坤與古城之間，更是南路吐魯番旁竄的小路，北路敵軍從科布多與紅柳峽出逃，亦可直達古城一帶。現在劉錦棠的生力軍與貴部合搗敵巢，前敵兵力十分強大，麾下一定要分出勁旅部署在古城至大石頭一線的各個要隘，與徐占彪的五營部隊聯絡一氣，才足以截擊突圍的敵軍。這步棋看似無足輕重，其實最為關鍵。
為了萬無一失，左宗棠又對張曜再三叮嚀：吐魯番大路之間有許多小路可以通行人馬，尊部一定要扼守所有的小路，務必做到滴水不漏。千裏之堤，潰於蟻穴，千萬不可忽略！
左宗棠對桂錫楨的部隊沒有把握，又叮囑劉錦棠派兵增援，予以照看。
巴裏坤和哈密已經部署妥當，敵軍逃竄，隻能從西北轉向東邊。我軍攻占古牧地以後，逃敵必定奔向瑪納斯尋找去路。我已派桂錫楨的騎兵前往扼守，麾下也要選派兩三營兵力，再從金順那裏挑派一兩營兵力，駐紮在一起，準備截擊逃敵。幹糧和行糧多帶一些，以免桂錫楨的部隊借口沒有糧食而開溜。對友軍不妨許以重賞，以示激勵。戶部和各省撥來的款子，正在源源而來，你們不要擔心前敵部隊沒有軍餉，盡管放心作戰。
出關第一仗
新疆之戰，紙上談兵已久，遲遲未見硝煙升起。左宗棠就任統帥，老湘軍一進新疆，槍炮聲立刻響起。
1876年7月21日，老湘軍開進濟木薩。7月28日，劉錦棠和金順所部聯合進軍阜康。烏魯木齊的回民軍首領馬人得聽說官軍大部隊開到，在古牧地增加兵力，聯合白彥虎並力抵抗。南路的安集延人也派兵過來增援，越過阜康西進五十裏，抵達黑溝驛。
黑溝驛其實是一片戈壁，沒有水泉。敵軍已占據驛前的黃田設卡，企圖斷絕官軍汲水的道路。
劉錦棠偵察到城西有大片野潦，縱橫二十裏，可以疏通廢渠，導水供給汲飲。他命令部隊從大道進兵，抽調軍士在城西開溝引水，注入廢渠，在渠旁修築營壘。
8月10日，劉錦棠派兵偷襲黃田。部隊到達指定位置後，敵軍方才驚醒。頃刻間，號角聲從四麵響起，劉錦棠和金順登上山岡指揮，令各部分路進攻。戰了一個多時辰，敵軍騎兵不支，與步兵一起接戰。官軍縱橫衝擊，敵軍大敗，丟棄輜重狂逃。官軍追到古牧地城外，方才收兵。
8月12日，劉錦棠和金順開始攻打古牧地。剛剛進抵紅廟子，敵軍幾千名騎兵從東北方向殺來。劉錦棠令餘虎恩、黃萬鵬率騎兵迎擊，將步兵分成兩路，攻打難南關。他自己督率親軍攻打山壘，一鼓作氣，立馬攻克。譚上連等人見山壘已下，鼓動部隊冒著槍炮先登。敵軍棄關，奔回城內。老湘軍進營關壘。
敵軍援兵被騎兵阻遏，無法前進。金順所部擊斃敵軍高級將領，敵軍向南麵敗潰。
老湘軍和金順所部分別在古牧地城的東南和西北紮營，晝夜修築炮台，高出城牆一丈，連日開炮轟擊。東北和正東城牆都被炸塌。官軍調來更多的劈山炮圍攻，使守軍無法修補城牆。
8月16日，知府羅長祜和副將楊金龍將開花大炮移到正南方，寧夏鎮總兵譚拔萃所部奔向東北方，漢中鎮總兵譚和義所部向正東方運動，提督譚慎典、董福祥等部用布袋盛土，埋伏在牆濠邊，隻等城牆一倒，便要衝進城內。陝安鎮總兵餘虎恩、提督黃萬鵬、陶生林、張春發、陳廣發等人，各自督率所部，嚴陣以待，準備截擊。
部署妥當以後，劉錦棠率領親軍在城南的山壘督戰。
8月17日黎明時分，南城牆倒塌，山壘鼓聲驟起，各部填濠登城。金順所部也從東北方並進，立刻攻下古牧地城，擊斃敵軍六千人。安集延派來的幾百名援軍，也被殺的殺，抓的抓，全軍覆沒。
白彥虎在官軍攻破黃田卡時就已逃走，在烏魯木齊與安集延和回軍將領馬人得相會。幾名要員聽說古牧地失守，精銳部隊被官軍殲滅，哪裏還有心思應戰，各自率領婦女南逃。
劉錦棠得到探馬報告，知道烏魯木齊兵力空虛，決定立刻掩殺過去。
第二天，老湘軍長驅直搗烏城。部隊距城十裏，劉錦棠接到軍報：三城的敵軍全部逃走了。所謂三城，就是烏魯木齊迪化州的滿漢兩城，以及已死回民叛軍妥明修築的偽王城。
劉錦棠督促各部急行軍，抵達迪化城，看到敵軍一千多名騎兵正在南逃，立刻揮軍分路猛追。接著領兵進城，接管三座城市，搜捕敵軍殘餘。
黃昏時分，譚拔萃等部追到鹽池墩，又擊斃敵軍六百多人。前麵就是戈壁了，譚拔萃不敢冒險深入，決定收兵。
這時，安集延的帕夏又派幾千名騎兵增援，來到距城西一百八十裏處，聽說官軍已攻破烏魯木齊，隻得策馬返回。
捷報傳到肅州，左宗棠頗感意外。前敵部隊在十天之間連克幾座堅城，可見敵軍不堪一擊。這一次他不再低調，派出快馬向京城告捷。
烏魯木齊各城，是新疆的關鍵所在。同治三年妥明叛亂，殺害都統與提督，竊踞城內，兩年後自稱清真王，派部屬馬泰、馬仲、馬明、馬官，分別駐守古牧地、吐魯番和瑪納斯城。
六年後，妥明與安集延在庫車交戰，被安集延人擊敗。安集延人立刻前往吐魯番，策反妥明的部屬馬仲，反過來攻打妥明，打得妥明投降。安集延人令妥明仍然當他的清真王，駐守烏魯木齊，另外任命馬仲為總管。後來徐學功進剿叛逆，陣斬馬仲。馬仲的兒子繼任總管，與妥明鬧矛盾，再次糾集安集延人攻打妥明。
妥明死後，馬明與馬官全部投降安集延。從此安集延人在烏魯木齊征收土地稅，令回民和漢民遵從安集延的風俗，都剃光頭，穿圓領衣。烏魯木齊各城就這樣被外國人侵占。安集延人兩次與回軍搏鬥，搶掠他們所有的剩餘物資，全部運到南路，驅使強壯的男人踞守各城，作為他們的屏蔽。
白彥虎逃竄到新疆以後，知道自己的勢力鬥不過安集延，便想借安集延人的力量作為自己的保障。因此，對於帕夏的意誌，他一點也不敢違反。帕夏一天天富起來，而當地回民一天天窮下去。白彥虎聽說朝廷大軍從巴裏坤與古城浩蕩而來，便剃光頭發，穿上圓領服，向安集延人投靠，讓死黨帶領當地回民阻擊官軍，自己卻袖手旁觀，鑽空子逃走，這是他一貫的手法。
這次我軍從北路進攻，意圖之一，是要阻截敵軍，不讓他們四處逃散，以節省駐防兵力。意圖之二是揮師南下，以防被敵軍牽製。官軍從關內出兵，越過伊吾和車師一帶，翻越天山重險，與敵軍角逐，不顧兵力和餉力是否充足，也不顧作戰是否順利，都要冒險打這一仗。原因何在？因為烏魯木齊必須收複，否則我軍就無法立足，而一旦敵軍四處奔逃，我軍就無法遏止。那樣一來，不僅陝甘受到威脅，就連直隸、山西和內外蒙古，也會沒有安寧之日。如果我軍在巴裏坤和古城以東貧瘠的地區停止不前，兵少不足以扼守要衝，兵多就會浪費軍餉，是無法持久下去的。
但是，這一仗我們打贏了，而且贏得如此迅速，如此痛快。西征軍站穩了腳跟，沒有辜負朝廷的期望！
西征軍連獲大捷之後，沒有停止前進。劉錦棠進駐烏魯木齊的時候，昌吉、呼圖壁和瑪納斯北城的守軍全部棄城南逃，隻有瑪納斯南城的回軍仗著城小而堅固，決定死守。
8月24日，金順率部從昌吉進攻，老湘軍分路在東南山穀搜查逃敵，越過鹽池墩，抵達柴窩堡，每天都有斬獲。
從柴窩堡往西一百二十裏，便是達阪城，距離烏魯木齊城南二百裏。帕夏聽說北路的據點全部喪失，趕緊派出騎兵，收攏烏魯木齊各城逃出的部隊，進入達阪城駐守。他本人來到托克遜，修築三城，以為犄角，派勁旅守衛，以抵抗從烏魯木齊開來的官軍。另派馬人得防守吐魯番，以抵禦哈密開來的官軍。
白彥虎擅長偷襲。他已經率領部屬餘小虎潛到南山小東溝，偵知官軍正要攻打達阪城，便從南山、古牧地和阜康騷擾官軍後路，每到一處，都遇到了老湘軍的鐵拳。他發現官軍的包圍圈沒有空子可鑽，便到托克遜來投靠安集延。
北路獲勝，左宗棠考慮進規南路，打算由劉錦棠所部攻打達阪城，張曜與徐占彪合攻吐魯番，而北路隻留下金順防守。這樣一來，兵力頗感單薄，還得從外省調兵。
兩宮太後明鑒：北路勢如破竹，應該立即揮師南下，規複舊疆。
南路自從乾隆二十四年平定以後，建了八座城市，分別是喀什噶爾，英吉沙爾，葉爾羌，和田，阿克蘇，烏什，庫車，喀喇沙爾，稱為“南八城”。吐魯番卻不在八城之列，因為它地處天山之南，是南八城的門戶，前往回疆，必須取道於此。
從吐魯番向西，經過喀喇沙爾、庫車、阿克蘇、葉爾羌、英吉沙爾，就到了喀什噶爾，中間有四十九台，路程四千一百裏，比烏魯木齊至伊犁的一千三百裏，還遠了三倍。
我決定派劉錦棠全軍自北而南，張曜和徐占彪自東而西，收複南路。攻擊兵力有騎兵和步兵四十多營，兵力比較雄厚。
但是大軍向前推進，不但後路重地需要增兵，軍需後勤也要依次設立機構，以便供給部隊，於是需要衛隊。前敵攻克城堡，必須留下部隊駐守，剿滅殘匪，安撫百姓。部隊走得越遠，留防兵力需求越大，攻擊部隊兵力越少，士氣不免沉落。曆史經驗告訴我，開戰時的勁旅，到頭來衰敗下去，多半是因為兵力大減。
從南路地勢而言，東南長而西北短，從吐魯番、達阪城向西，直到阿克蘇，一路走下去，不需要分路並進。進入阿克蘇之後，局勢開闊，中路一千四百裏到葉爾羌。再行三百六十裏到英吉沙爾，又行二百裏抵喀什噶爾。阿克蘇北麵靠近伊犁，葉爾羌東南遙與和田相接，都要分派主力扼守樞紐，然後直搗中堅，才能迅速結束戰役。
道光年間，張格爾起事，隻占了西四城，所以長齡、楊遇春從烏魯木齊與托克遜進兵。當時長清首先扼守阿克蘇，憑河擊退敵軍。為什麼要扼守阿克蘇？是為了東四城不敢蠢動。於是長齡和楊遇春可以從無敵區發起攻擊，軍餉充足，運輸快捷，大功告成。
我們這次從烏魯木齊進兵，局勢還是一樣，但是吐魯番、達阪城與托克遜都被敵人占領，前方兩千多裏都是敵占區，顯然難度更大。而這次軍餉缺乏，兵員短少，比當時又差得太遠。如果在半路上停下來請求增援，就會耽擱時間，恐怕發生不測。因此我經過再三考慮，決定預先增兵。
卓勝統領部隊駐紮包頭，他手下有個記名提督金運昌，曾在甘肅的寧、靈二州與我的部隊共同作戰，他率領的淮北勇丁，勇敢頑強，能夠吃苦耐勞。我移駐肅州以來，金運昌屢次請求參加西征。我告訴他糧餉運輸艱難，增兵會有困難。但是金運昌不畏艱險，西征意誌更加堅定。我聽說他的部隊，騎兵和步兵共有五千多人，堪稱勁旅。軍餉每月需要三萬幾千兩，由安徽和陝西各負擔一半。
新疆北路已經解嚴，山西和包頭的駐防軍原本可以撤銷。金運昌全軍西上，符合遠防不如近剿的原則。我已經寫信給山西巡撫鮑源深，請他考慮派遣。現請朝廷下令，讓他立刻調派金運昌，乘秋末冬初之際，率部開拔西來，歸劉錦棠調遣。中路軍有了這支援兵，可以一意馳驅。攻克南路各城之後，有足夠的兵力駐防，輪流推進，就不愁前敵兵力不足了。
慈禧知道，左宗棠調兵遣將，素有章法，很快就同意照辦。
收複新疆的戰役打響以後，中俄關係進入微妙時期。為了戰爭順利進行，左宗棠暫時不想與俄國交兵。外交無小事，左宗棠知道新疆的武官們缺乏外交經驗，擔心他們鬧出什麼意外。於是他請求慈禧對大臣們嚴加約束，凡是與俄國人交涉，必須征得他的同意。
新疆與俄國毗連，邊界問題，與現在的戰事無關。現在就邊界問題開始交涉，會引起爭論，不但舉措不當，而且有可能妨礙眼下的作戰。語言交際，偶爾失當，也足以導致猜疑和爭執。我奉命督辦新疆軍務，身在事中，邊防利害之分，百年安危之計，自然不敢不引以為己任，但必須權衡輕重緩急，審時度勢，統籌全局，才能久遠相安。
俄國雖然是中央集權國家，但不同的事情還是由不同的人來分管。其來中國者暫雖馴順有加，無尋釁生端之意，然而如果開始有失於慎重，結果就很難預料。請朝廷嚴令將軍、都統各位大臣，凡有跟俄國人交涉的事件，除了已有規定的，可以照常辦理以外，遇到俄國與我們交涉新疆問題，都要向我報告，由我決策主辦。溝通渠道隻有一條，就不會眾說紛紜，爭辯也就自然平息。
慈禧同意在南疆戰役結束以前，先把伊犁問題放一放，也同意左宗棠獨自處理就新疆問題與俄國進行的交涉，別人不得插手。
左宗棠增派侯名貴、章洪勝、方友升的三營，增強劉錦棠的兵力，逐步搜捕後路逃敵，運送行軍糧草和軍火，儲備在烏魯木齊。又調張曜所部從哈密西瞭台出兵，取道七克騰木，向辟展進軍。徐占彪從木壘河大道出兵，與之會師。他們的行動時間，根據駐防地的遠近決定，聽從劉錦棠的安排。徐萬福等人駐紮安西的五營，奉令調到巴裏坤的各個隘口。哈密辦事大臣明春裁和文麟的威儀軍，奉令駐防哈密。
在左宗棠重新部署兵力期間，金順所部攻打瑪納斯南城，首次遇到難啃的骨頭，久未攻下。左宗棠接到報告，令老湘軍火速增援。
10月2日中秋節，劉錦棠派譚拔萃和羅長祜率六千人赴援。代理伊犁將軍榮全也從塔爾巴哈台出兵增援。
援兵開到後，分頭開挖地道，幾次爆破，將城牆炸開裂口。守軍拚死堵禦，用人牆來擋。攻守雙方傷亡慘重。
10月17日，官軍開炮猛轟，炸死敵軍的韓姓主將。11月4日，守軍將領海宴請降。11月6日，敵軍幾千人帶著武器出城。金順發覺有詐，嚴陣以待，令民團將領徐學功喊話，要求敵軍放下武器。敵軍將領何碌突然開槍，令部屬撲向城壕。官軍已有防備，各部一並殺出，奮力反擊，將敵軍全殲。瑪納斯南城便告收複。
左宗棠令徐學功在各城廣泛開展屯田，招來西河五坌的團民，發給種籽和農具，派道員周崇傅在巴裏坤設立機構，招商開市。