俺答兵在北京郊外搶掠了幾天之後，見明政府軍隊不做抵抗，就大肆橫行了一陣，押運著搶來的大批男女牲畜和金帛財物，誌滿意得地引兵西去了。
麵對俺答兵的撤去，仇鸞屬下的10多萬軍隊麵麵相覷，沒有一將一卒發放一箭。隻有在俺答兵退了很遠之後，仇鸞才帶著軍隊尾隨其後，假裝追擊一番。這時，俺答汗本想從白羊口那個地方出塞，結果受到了明朝守將的阻扼，又隻好擁眾返道東南，在昌平北麵突然與假裝追擊的仇鸞軍隊相遇。仇鸞出乎意料他自己差點被俘去，軍隊也大亂逃潰。俺答騎兵破陣而入，殺傷明軍，1000多人，又帶領他的部下從古北口出塞了。仇鸞潰敗後，為了向世宗邀功請賞，殺了幾十個百姓的頭充數，世宗也沒加核實，就加封他為太保，賜給他一些金帛。
世宗感到這次失敗是一場奇恥大辱，為了泄憤，就把兵部尚書丁汝夔抓來問罪，投入監牢裏。丁汝夔立即向嚴嵩求救，嚴嵩安慰他說：“不要害怕，有我在，一定不會讓你死的。”後來，看到世宗真的發怒，要處丁汝夔死刑的時候，嚴嵩卻噤若寒蟬，一聲不吭了。這時，丁汝夔才明白過來，臨刑時大聲呼喊：“這都是嚴嵩把我給斷送了。”
因為這件事發生在世宗在位第二十九年，那年是庚戌年，所以這次事件被稱為“庚戌之變”。
張居正改革
明世宗死後，由他的兒子朱載繼位，改年號為隆慶，這就是曆史上的明穆宗。這一次皇帝的更替和以前皇帝的更替一樣，又給下麵的大臣有一個革除弊政的機會。張居正就利用這種機會，進行了一場改革運動。
張居正很早就走上了宦途。一開始，他在翰林院任編修，當時正是嚴嵩當權的時候，他看到天下群盜湧起，貪風不止的局麵，感到國家的形勢很不妙。他認為這種形勢非得有一個磊落奇偉的人不可，隻有這樣，不拘常規才能廓清天下這種混亂的局麵。但是，當時皇帝昏庸，奸臣執掌朝政，他的思想也就比較悲觀，認為世上即使有這種磊落奇偉的人，當政的皇上也未必了解他，即使了解他也未必肯起用。這樣，張居正就隻在翰林院當了7年的編修，然後就稱病辭官回家了，在家裏閉門讀書。
就這樣，張居正在家整整又讀了6年書，由於他的父親很希望他能夠在政治上有所建樹，他隻得又進京當官，任國子監司業。張居正的性格比較深沉，而且很有膽略，這次進京後，他就懷有更大的抱負。在辦完公事之後，他就注意研討曆代盛衰興亡的曆史經驗教訓，留心觀察社會現實。明穆宗登位那年，他就被遴選入放內閣。第二年，他針對世宗以來的種種弊端，向穆宗上了一道奏疏，指出當時朝政已經是積習成弊，頹廢不振了，如果不及早實行一些改革，結果會積重難返。
張居正在那道奏疏中陳述了他的一些政治主張，是很有見識的，在當時也是勢在必行的，穆宗皇帝對這個也深表讚賞，可惜的是他在位僅6年就去世了，那時候，張居正還不是內閣首輔，所以他這些主張暫時不能得到實行。
穆宗去世後，由太子朱翊鈞繼承了帝位，開始了明神宗治天下的時代。這時，張居正聯絡宦官馮保，攆走內閣的首輔高拱，在皇太後的支持下，出任了內閣首輔，擁戴著10歲的神宗小皇帝。張居正已經大權在握，年幼的小皇帝又對他言聽計從，於是，張居正就把他昔日的政治主張，在神宗統治的時候，逐一地付諸實施，掀起了一番雷厲風行的政治改革。
張居正改革首先整飭吏治，他認為當時朝野拖遝成風，吏治不清。於是，他就提出了考核吏治，要求為官清廉，政治清平，讓老百姓過上安定的生活。他又製定出一套考核官吏政績的辦法，通過考勤，來分別官員們的勤惰、賢愚的狀況，把那些辦事拖拉的官員毫不留情地罷免或者黜陟了。張居正在選拔和任用官吏的時候，主張唯才是用，不受毀譽、親疏關係的影響，人要有真才實學，就加以破格重用。對那些沒有軍功，能力又十分低下的，即使是皇親貴戚，也決不濫封爵位，輕授官職，這樣就使整個官僚機構不十分龐大。
張居正在改革的過程中，為了改變賦役嚴重不均的狀況，減輕無地或者少地農民的賦稅，後來又下令在全國推行“一條鞭法”。這樣，又為明政府的財政增加了不少收入，也減輕了農民的許多負擔。
張居正在進行這些改革的同時，還做了許多加強邊防的工作。明世宗時發生庚戌之變，那時，張居正也在北京，他目睹了俺答軍隊圍困北京的局麵，他內心深有感觸，他就決心對邊防加以整頓，加強力量。