新法已經公布，公孫鞅擔心百姓們不相信，不遵守，便在都城的南門立了一根三丈長的木頭，並下令：“能把這根木頭搬到北門，賞十金。”百姓對此覺得很奇怪，都不敢去搬。公孫鞅又更改命令，增加到五十金。有一個人壯膽搬起木頭，搬到了北門，公孫鞅果真賞給了他五十金。此舉使百姓們感覺到了公孫鞅及新法的權威性。
新法剛實行時，百姓們對此產生過強烈的爭議，貴族們則希望取消新法。恰在這時，太子觸犯了新法。公孫鞅便說：“新法行不通，就是由於上層可以隨便觸犯它。”他決心依法懲辦太子。太子以後將繼承王位，不能施行刑罰，公孫鞅便對太子的老師公子虔處以刑罰，太子的另一位老師公孫賈還被處以黥刑。公正的執法，使得秦國百姓漸漸地自覺遵守法律。新法施行十年後，秦國的社會麵貌發生了很大變化，全國沒有盜賊，百姓“路不拾遺”，家家富裕，人人豐衣足食。男子都勇於當兵打仗，再也不為私人恩怨而鬥毆。許多當初反對新法的人都在訴說新法的好處了。
接著，公孫鞅擔任了大良造一職，率兵攻打魏國，大勝，並占領了魏國的安邑（今河南省安陽市西南）。
又過了三年，聽從了公孫鞅的建議，秦國的國都遷到了鹹陽，並在鹹陽建造了冀闕作為王宮。又把以前的小鄉小邑和村落合並，設置縣令、縣丞，使秦國全國分成了三十一個縣。鼓勵百姓，開墾了大量田畝。同時在田間開挖田塍，作為耕地之間的疆界，以明確賦稅。還統一了度量衡製度。
新法實行四年後，太子的老師公子虔再次觸犯了法律，被公孫鞅處以割去鼻子的處罰。
過了五年，秦國變得更為富強。周朝天子派人給秦孝公送來祭神的肉，各諸侯國都向秦孝公表示祝賀。
再接下來的一年中，即公元前340年，秦孝公聽從公孫鞅的意見，派公孫鞅率兵攻打魏國。魏國派遣公子卬（ánɡ）帶兵迎擊秦國軍隊。兩軍對峙之際，公孫鞅致信公子卬：“我曾與公子友好，現在又各自率軍，不忍心互相攻殺。願意與公子相會，訂立盟約，飲酒作樂，然後各自收兵回國，使兩國安定。”公子卬不知是計。公孫鞅與公子卬會盟之際，秦國軍隊的伏兵突然發起襲擊，俘虜了公子卬，並趁機打垮魏國軍隊。由於魏國接連被秦國和齊國擊敗，實力大減，不得不割讓黃河以西的土地獻給秦國以求和。魏國因此還把都城由安邑遷到了大梁城。這時的魏惠王非常後悔，說：“我真悔恨沒有聽公叔痤的勸告啊！”公孫鞅率兵打敗魏國軍隊後，秦孝公把於、商等十五座城邑封給他，稱他為商君，從此人們都叫他商鞅。
商鞅在秦國做了十年宰相，由於推行新法，損益了秦國王室貴族的利益，很多人都對他恨之入骨。秦孝公死後，太子繼位，為秦惠王。當時已有人提醒他，要他注意秦國王室貴族的謀害，甚至告訴他死亡都已逼在眼前，但商鞅認為自己對秦國有功，沒有聽從。
公子虔、公孫賈誣告秦惠王，說商鞅正在準備謀反。秦惠王大怒，派兵前去拘捕商鞅。商鞅逃離奢都城，秦惠王又派兵追趕。商鞅逃到函穀關口，因天色已晚，想住旅店，店主不知他就是商鞅，拒絕了他，說：“按照商君之法，若是收留無帖之人住宿，店主是要殺頭的。”商鞅不由得長歎：“唉，我自己推行的法令，卻害了我自己！”於是他連夜逃往魏國。魏國人痛恨他以欺騙之法俘虜了公子印，不肯收留他。商鞅因此無路可逃。後來，魏國人認為商鞅是秦國的犯人，而秦國強大，應該送回秦國，商鞅便又被押回秦國。回到秦國後，商鞅逃回自己的封地商邑，準備起兵攻打鄭國。秦國軍隊很快攻來，並在鄭國的黽池抓住了商鞅。秦惠王派人把他押到街市上，曆數商鞅的所謂罪行，以五馬分屍之刑殘忍地殺死了他。
商鞅雖死，可他所推行的新法卻取得了成功，秦國也因此而強大起來，最後統一了中國。