此時的太子丹已經花了百鎰黃金，為荊軻準備了天下最鋒利的匕首，還讓工匠在匕首上塗上了毒藥。接著便準備行裝，讓荊軻啟程。太子丹還為荊軻找來了一位名叫秦舞陽的勇士，充當荊軻的助手。給荊軻送行的那天，天很冷，風很大。太子丹及人們身穿白色的衣帽，鄭重地祭了路神。大家一直把荊軻送到城外的易水河邊。高漸離擊打著築，荊軻則和聲高唱：“風聲蕭瑟易水寒冷啊，壯士一去不複返啊！”情景十分悲壯。
到了秦國，荊軻就以價值千金的禮物賄賂秦王的寵臣蒙嘉。蒙嘉於是向秦王報告：“大王威震天下，燕國國君不敢違抗，願意成為秦國的臣子，交納賦稅，交納貢物，隻求能保住先王的宗廟。為了表示他的誠意，特派使者送來燕國最肥沃的督亢之地的地圖，還特地砍下了樊於期的首級，都用匣子封存著，呈獻給大王，希望大王接收。”秦王聽了，興奮異常，穿好上朝的禮服，以隆重的九賓之禮，在豪華的鹹陽宮接見來自燕國的所謂使者。
荊軻手捧盛殮著樊於期首級的匣子，秦舞陽則懷抱裝有地圖的匣子，按次序向前。走上宮殿的台階上時，秦舞陽不由得恐懼得變了臉色，令大臣們狐疑。荊軻解釋說：“我們是從偏遠的北方來的，沒有見過天子，所以緊張。希望大王能夠寬容些，能讓我們完成使命。”秦王便對荊軻說：“拿地圖過來。”荊軻取出地圖，交給秦王，秦王展開地圖，匕首就露出來了。荊軻的左手倏地抓住了秦王的衣袖，右手拿起匕首，朝秦王直刺過去，但沒有刺中。秦王大驚，抽身而逃，連衣袖都被扯破了。秦王想拔劍自衛，由於劍鞘過長，劍一下子抽不出來，隻得握著劍鞘再逃。荊軻緊追著秦王，秦王則繞著柱子轉，旁邊的大臣們嚇得目瞪口呆，但又不知如何是好，因為按著秦國的法令，在宮裏侍奉秦王的大臣都不得攜帶武器，而那些殿下的衛兵盡管持著刀戟，但沒有秦王的命令不得上殿。混亂之際，大臣們隻得用徒手幫忙。侍從醫官夏無且正好捧了個藥袋子，這時朝著荊軻砸了過去，而秦王仍然在繞著柱子轉。這時有人喊：“大王，背劍！”秦王醒悟了，把劍鞘推到背上，終於把劍拔了出來，朝荊軻擊刺，荊軻的左腿被擊斷。倒地的荊軻還把手中的匕首投向秦王，仍然沒有投中，隻是投中了銅柱子。秦王便再次擊殺他，荊軻的身上有了八處傷口。荊軻自感大事告敗，遂靠著銅柱子大笑，並罵道：“你這個暴君！大事沒有成功，是因為想把你活捉，得到你的諾言去回報太子！”這時，秦王的衛兵都已上殿，殺死了荊軻。
荊軻已被殺死，但秦王好久無法快樂，剛才的一幕給了他沉重的教訓。幾年後，秦國滅了燕國，後來又吞並了天下。公元前221年，秦王嬴政成了秦始皇。這時，太子丹已被燕王姬喜殺死，作為禮物獻給了秦王。為了掃除異己分子，秦始皇仍然下令通緝太子丹和荊軻的門客。此時的高漸離已改名換姓，但依然時常擊築。凡是聽見他擊築的聲音的人，無不落淚。秦始皇聽說了，請高漸離入宮演奏。高漸離竟把鉛塊藏在築裏。等秦始皇靠近時，他舉起築砸向秦始皇，沒有砸中。秦始皇的左右殺死了高漸離，而秦始皇本人，從此再也不敢接近來自各諸侯國的人。
荊軻刺秦王的故事雖然悲壯，可還是有人感歎道：“啊，他真是一個勇士，可惜他太不精於刺殺了！”