在選用中草藥治療月經不調、痛經、閉經、崩漏、月經前後諸證、絕經前後諸證等月經病時，要做到謹慎合理地使用，必需注意選擇合適的藥物、有明確的應用目的，同時還應做到組方精練、劑量科學。
（1）藥物合適：在藥物的選擇上，不僅要考慮其性味歸經、功能主治，還需要結合現代藥理研究成果，做到中西合參，綜合分析，合理選擇。例如，山茱萸、枸杞子均具有較好的補虛益腎功能，且無明顯的不良反應，可廣泛用於治療月經不調、痛經、閉經、崩漏、絕經前後諸證等月經病。若從中醫的角度考慮，山茱萸具有補益肝腎、收斂固澀之功效，枸杞子具有補肝腎、益精血之功能，均適用於中醫辨證屬肝腎不足之月經病患者；用於濕熱下注及實火引起者並不對證。又如淫羊藿具有溫腎壯陽之功效，對月經病中醫辨證屬腎陽虧虛者較為適宜；若用於陰虛火旺之患者則藥證不符。
（2）目的明確：辨證論治是中醫的特色和優勢，應用中藥應以辨證為依據，這是常理，但也應注意結合現代醫學對月經不調、痛經、閉經、崩漏、月經前後諸證、絕經前後諸證等月經病的認識，做到用藥的目的明確。經過一段時間的治療，觀察目的是否達到，如果沒有達到，必須審查用藥是否合理，及時調整用藥，以期達到理想的療效。
（3）組方精練：中醫治病組方強調配伍，主、輔、佐、使目的明確，用藥精練，毫無目的地雜藥亂投，一開就是二十幾味甚至幾十味，這是絕對錯誤的。藥物進入人體後，都要經代謝解毒，發揮其治療作用，中藥也是一樣，在選用中藥湯劑治療月經不調、痛經、閉經、崩漏、月經前後諸證、絕經前後諸證等月經病時，組方用藥要科學、精練，配伍要合理，每一味藥都要有明確的目的，以期達成最佳配方。
（4）劑量科學：中藥都有一定的用量範圍，超長時間、超大劑量使用，是導致不良反應發生的主要原因，如長期使用木通容易引起腎衰竭和肝損害；桃仁、杏仁等含有氰苷，超劑量使用其中毒反應可以致命，在治療月經不調、痛經、閉經、崩漏、月經前後諸證、絕經前後諸證等月經病時，必須嚴格掌握其常用劑量，不能隨意加大劑量，也不可不加分析地長期使用，做到用藥的劑量科學合理。藥典所定的劑量具有法律效力，它是法律和科學的結合，不可輕易突破。