張琴秋任醫院政治部主任期間，由於國民黨對根據地實行經濟封鎖，王坪、沙溪嘴地區軍民的生活極其艱苦。沒有米糧，隻能把黑豆、蠶豆磨成粉當主食；沒有鹽巴，隻能吃鹽水煮野菜。為了使傷病員早日康複，張琴秋盡一切辦法改善醫院的夥食，通過各種渠道給傷病員買鹽吃。她說：“別的開支都能省，給傷病員買鹽的錢不能省！”張琴秋能歌善舞，每到一地，常常被圍起來，為傷病員跳高加索舞、烏克蘭舞，帶領大家唱革命歌曲。她唱歌洪亮婉轉，大家都喜歡聽。張琴秋關心傷病員，也受到了傷病員的崇敬和愛戴。有些拄拐杖的傷員行動不便，但聽說她來了，都自動到門口歡迎，那情景是很感人的。
西路軍由倪家營子回師東返的夜間，張琴秋生了小孩。孩子在冰天雪地的沙灘上出世，沒有來得及看一眼陽光，生命便永遠留在濃重的夜色中。身邊的戰友親眼看見，鮮血染紅了張琴秋坐騎的馬鞍。熟知這一情況的西路軍政治部主任李卓然後來回憶說：“記得張琴秋同誌在行軍的路上生了孩子，警衛員告訴了我，我立即命令他和挑夫一起，把馬馱的一部分文件，能丟掉的丟掉，不能丟的就燒掉，去馱張琴秋同誌。後來他們回來告訴我，她生了一個男孩子，長得很漂亮。可那時正值西路軍慘敗，彈盡糧絕的冰天雪地之中，隻好把孩子丟在雪地裏了，走了好遠還能聽見孩子的哭聲……這是我們的戰士無情？母親無情？這無情正是有情於國家獨立、新中國成立後的孩子不致再被丟在雪地裏。對於這些，我們有幸活著的人還能有什麼不滿意的呢？”
石窩分兵，張琴秋隨幹部遊擊支隊在遊擊中被敵人衝散俘獲，在押解下山途中和七八個戰友擺脫敵人逃了出來。由於張琴秋身體十分虛弱，戰友們綁紮了一副擔架抬著她。大家麵向東方走了三四天，不幸又被搜山民團所俘。
敵人對新來的女紅軍查詢登記，大夥都為張琴秋擔心，唯恐口音不同露出破綻，紛紛代為答話：她叫苟秀英，四川人，45歲，是給紅軍煮飯的，已病了幾天啦。敵軍官一看，確實是個又髒又病的老太婆。其時，張琴秋30歲出頭，在大夥的掩護下，她在甘州平安度過兩晝夜。張琴秋又和男女戰士一起，被押送青海西寧，同行中有紅九軍政治部白兵工作部副部長吳仲廉。張琴秋微昂著頭顱，朝慘淡的夕陽顫顫地走去。