溫福將大營紮於木果木，命侍衛德爾森保領兵駐紮簇拉角克一帶，令提督董天弼守底木達。由於屯兵日久，屢攻不下，金川番兵又藏匿各處密林，夜間四出劫營，官兵不勝其擾，防不勝防，士氣低落，防範鬆懈。大金川土司索諾木乘機讓僧格桑遣派許多頭人由美臥溝出至小金川，“煽故降番，使複叛。諸降番見大軍久頓不進，遂蜂起應之”。乾隆三十八年六月初一日夜間，大小金川番兵從大板昭山口下，奪清軍卡五所，搶占底木達營盤，擊殺董天弼，隨又奪占糧台，潛攻木果木。溫福聞悉，尚不嚴備山後要隘。六月初八日金川奪據炮局，初九日搶占大營東北山上木柵，初十日又奪占大營後麵木柵。此時溫福軍營尚有官兵近二萬人，本可據營堅守，甚至反守為攻，但幾日來的失利，使許多官兵心驚膽戰，綠營兵丁又素來怯懦懼戰，兼之，溫福指揮失宜，當運糧民夫三千餘人逃奔大營時，溫福竟下令緊閉大營四門，民夫潰散，“聲如壞堤，於是軍心益震”。金川兵四麵進攻，突入營中，“溫福中槍死，各卡兵望風潰散”。海蘭察率領部分士卒突圍出，沿途收集潰兵，於十二日退至美諾。
清軍木果木之敗，損失慘重。陣亡或未經衝出的文武官員有：定邊將軍溫福，提督董天弼，四川提督馬全，署貴州提督牛天畀，總兵張大經，副都統阿爾素納、巴朗，禦前頭等侍衛德爾森保，副將二達色、多隆武、趙琮，參領觀音保、德保、額爾塞、阿哈達，知州徐諗、吳璜、彭元瑋、常紀，知府吳一嵩，以及主事、知縣、同知、典史、副參領，護軍校、驍騎校、協領、防禦、都司、守備、參將、遊擊等，共一百餘員，兵士陣亡三千餘人。木果木軍營遺失米糧一萬七千餘石、銀五萬餘兩、火藥七萬餘斤、大炮五位。這是乾隆帝執政三十六年來的第一次大慘敗。
二、皇上緊急應變副帥智脫險境。
乾隆三十八年六月初十日定邊將軍、大學士、兵部尚書溫福命喪木果木之時，遠在數千裏外的乾隆皇帝弘曆並不知情，還在苦苦思索克敵妙計，等待捷音，並連發諭旨，指授用兵方略。當大金川兵於六月初一突襲大板昭、底木達時，乾隆帝於此日再次下諭，重申必滅金川的決心。他諭軍機大臣：溫福等奏，攻剿昔嶺及達紮克角木柵，均有金川人出寨邀擊官兵。金川“竟敢公然打仗，實為可恨，必當剿洗淨盡，不可稍有遊移”。至於軍需銀兩，共撥二千九百萬兩，約計用至明年四五月，盡屬寬裕。設或以多費為可惜，中止撤兵，“賊必並吞各土司，聯而為一，直鬧至維州橋，其時豈能置之不問，是現在所用，盡為虛擲，又須另起爐灶，所費必更不貲，而辦理倍難，謀國者斷不應出此。即或急切未能藏事，但能掃蕩擒殲，為一勞永逸之計，即使再多費一千萬兩，朕亦不靳。溫福、阿桂、豐升額等各宜深體朕意”。《清高宗實錄》卷936，頁5.六月初十日，他又諭示軍機大臣，遣春寧、特成額帶荷包、奶餅，往溫福、阿桂軍營分賞，並查看打仗情形，即回具奏。他不知道，此時溫福已在木果木成了大金川人的刀下鬼了。
正當皇上誌滅金川佇候捷音之時，急報接連而至。六月十六日，溫福、阿桂於五月末發出的奏折到京，言及金川侵擾糧站。第二日阿桂之折又到，奏稱六月初二日得悉，底木達於初一夜間失陷，喇嘛寺糧台被占。二十三日參讚大臣海蘭察緊急奏折到京，言及初十日木果木大營失陷，溫福陣亡，已帶滿兵突圍，於十二日退至美諾，四川總督劉秉恬亦由登春奔回，正會同博清額、伍岱、和隆武商議固守及開通將軍阿桂後路。
乾隆帝獲悉木果木慘敗後，當日(六月二十三日)連下五道諭旨，又於第二日下達七道上諭，部署緊急對策。這十二道諭旨主要講了五個問題。其一，添派滿兵。“溫福等失事，皆為綠旗兵所誤。去年春，朕已派定健銳等營精兵數千備調，因溫福、阿桂奏，以京兵較綠旗兵費幾數倍，朕為其說所遊移，遂爾中止”。今事已如此，悔亦無及，現選派健銳、火器營兵各一千、黑龍江兵一千、吉林兵一千、伊犁厄魯特兵一千，前往軍營，照例厚給賞賜。其二，增遣將官。色布騰巴勒珠爾複為固倫額駙，仍戴寶石頂、三眼孔雀翎，授為參讚大臣，富德著由三等侍衛授為頭等侍衛、領隊大臣，並派出乾清門侍衛保寧、伊達裏、納木紮、珠爾格德等人前往。其三，指授方略。此時海蘭察已與劉秉恬、富勒渾(署四川總督，率貴州兵)會合一處，“惟當示以鎮靜”，將美諾至明郭宗一帶辦理周密，其餘各緊要處，須開通者迅速開通，“應剿殺者盡力剿殺，總須占住小金川、沃克什地方，整頓兵眾，鼓勵士氣，以期另辦”。阿桂知悉木果木情形，自必統領大兵撤回，“隻須阿桂與海蘭察等會合，大局即定”。宜喜一路，留參讚大臣舒常帶兵駐守，副將軍豐升額即由該處徑往阿桂軍營。其四，緩征錢糧。川省官兵經過州縣，錢糧緩征二年，京兵、陝甘兵經過州縣，錢糧分別緩征五分至八分。其五，懲獎士卒。“溫福軍營綠旗兵盡皆潰散，實堪發指，若不將倡首及附和者正法多人，軍律安在！”必須嚴辦。其隨從海蘭察、伍岱剿敵之兵，亦係綠營，尚知奮勉打仗，即應賞賜以示鼓勵，或賞一分鹽菜銀，或賜半月餉銀，對士兵土練亦一體賞賜。②《清高宗實錄》卷937，頁20―32，34.