第一節大、小和卓稱汗叛清。
一、拒帝招撫兩和卓忘恩作亂。
(一)和卓出牢感恩“來歸”。
乾隆二十年四月二十四日，清定邊右副將軍薩喇爾呈報擊敗準噶爾汗達瓦齊的消息時奏稱：領兵前進，陸續招降各部人員，共四千餘戶，“內和卓木原係葉爾羌、喀什噶爾回部之長，因策妄阿喇布坦時羈留伊父為質，未經放回，將屬下三十餘戶，率領來歸。”《清高宗實錄》卷487，頁12.
薩喇爾提到的原“葉爾羌、喀什噶爾回部”之長的和卓木，就是大和卓木(亦稱大和卓)布拉呢敦(布那敦、博羅尼都)與小和卓木霍集占兩弟兄。《清實錄》、《聖武記》等書所說的“回部”、“回人”，在唐朝叫“回紇”，宋、遼、金時寫為“回鶻”，元、明兩代叫畏吾、畏兀、畏兀兒，清人稱為“回部”、“回民”、“纏回”、“回子”，就是今天新疆的維吾爾族，主要聚居在天山以南的廣大地區，也有部分住在北疆和伊犁。
維吾爾族曾經建立過強大的回紇汗國，但從十三世紀初蒙古興起以後，就降為蒙古汗王的屬人，在相當長的時間內，由元太祖成吉思汗之次子察合台的後裔分別統治，形成了若幹王國和地麵。明末清初，回疆有大小回城數十，回莊小堡上千，統一隸屬於葉爾羌汗國，汗仍然是察合台的後人。這時伊斯蘭教中出現了“白山”、“黑山”兩個教派，互相爭奪，“黑山”派在葉爾羌汗伊斯瑪業勒的支持下，將白山派首領伊達雅圖勒和卓驅逐出境。康熙十九年準噶爾博碩克圖汗噶爾丹應和卓伊達雅圖勒的請求，發兵十二萬，滅了葉爾羌汗國，盡執元裔諸汗遷居天山以北，扶持伊達雅圖勒為阿帕克和卓(意為世界之王)，通過他及各城伯克統治回疆。康熙三十六年噶爾丹兵敗暴卒，阿帕克和卓之子瑪哈木特在喀什噶爾、葉爾羌的伯克(封建主)支持下，乘機興起，欲圖建立一個伊斯蘭教汗國，完全擺脫準噶爾貴族的統治。策妄阿拉布坦出兵征服南疆，拘禁瑪哈木特於伊犁，以其二子布拉呢敦、霍集占為人質，令率數千維吾爾族人員墾地輸賦，並曾將他倆囚於地牢數載。
乾隆帝看過薩喇爾呈述和卓木來歸的奏折後批示說：“投誠之和卓木”，原係葉爾羌、喀什噶爾回部之長，“羈留準噶爾為質”，未經放回，“情甚可憫”，“著薩喇爾即將伊派令前來入覲”，至回營時，“仍令複回原部，並將此預行告知，俾知感戴”。《清高宗實錄》卷487，頁12―14.也許由於不久就生變亂，二人未曾至京朝覲大皇帝。清政府遣兵送大和卓布拉呢敦回葉爾羌，“使統其舊部”，留小和卓霍集占於伊犁，“掌回務”。
乾隆帝對“投誠之和卓木”的如此安排，顯然是表明此時他已確定了對回部(回疆)的基本方針，把它和哈薩克部區別開來，實行不同的政策。
對哈薩克，他隻要求其朝貢，允許互市，保持與對安南等國一樣的朝貢關係，基本上是國與國之間的外交關係，隻不過清是大國，是天朝，哈薩克、安南等是小國，是“屬國”；而對回部，則是把它當做與喀爾喀四部蒙古一樣的“藩部”，將其納入清朝的版圖，征收貢賦，責令按期朝貢與入覲，重大問題要聽從清政府裁處。雖然清廷沒有說明為什麼要這樣做，但道理也很簡單，因為，從十三世紀以來，回疆就是蒙古察合台汗後裔及準噶爾汗的屬部，歸其統治，遵其命令，繳納賦稅，充當差役，僉兵從征，甚至和卓、伯克成為人質，聽從準汗的差遣和奴役。現在既然準汗臣服於清朝，清政府當然有權接管回疆，當然對回部擁有統治之權，清帝與回部和卓、伯克和一般人員之間當然存在著君臣之分、君民之分。所以，乾隆帝得知和卓來歸時，即令其入覲，既表示予其以目睹龍顏的恩寵，讓其“俾知感戴”，也清楚地顯示出從此以後雙方就是君臣關係，和卓成為清帝屬臣。
乾隆帝不僅在二十年四月進攻準汗達瓦齊時就決定了要統一回部，而且這時還基本上確定了以“招撫”為主的策略，通過遣使宣諭，讓各和卓、伯克率部來歸，以便和平統一回部。他的這一想法，是與當時厄魯特四部台吉、宰桑紛紛來歸的事實分不開的，驍勇剽悍的準部台吉、宰桑都不敢與清朝對抗，都自動降順，那麼，一聽準軍到來就四處逃亡的回部人員，豈能舉兵相敵，當然會仿其所為爭先來歸。所以，他敢於遣兵護送大和卓回葉爾羌，“使統其舊部”，並不將其羈為人質，又令定北將軍班第遣人招撫大伯克霍集斯等來歸和入覲。直到二十二年四月他還諭告軍機大臣：大兵征討阿睦爾撒納及其他叛亂的台吉、宰桑，進展十分順利，“即可剿滅賊眾。厄魯特等既皆翦除，則回部自可招服”。《清高宗實錄》卷533，頁18.
但是，隨著回疆形勢的發展，以及陸續吸取了阿睦爾撒納權大生變和厄魯特台吉、宰桑降而複叛的教訓，他逐漸修改了策略，轉變為撫剿兼施，力擒首領，招撫多數，而且就在招撫各和卓、伯克來歸時，也十分警惕，盡力防止他們攬權割據獨霸回疆。
在一段時間裏，乾隆帝特別注意大、小和卓的動靜，極力爭取他們歸順清朝。他這樣做的原因，是不難理解的。由於廣大維吾爾族人員信奉伊斯蘭教，因此教主大、小和卓在回疆中威望甚高、影響很大，拉住了兩和卓，統一回部之事就易如反掌。何況，兩和卓之能脫離地牢之苦，靠的是清軍，清軍不打敗達瓦齊，他倆還得在牢中苦苦掙紮，他倆能不為有救命之恩的大皇帝盡忠效勞？退一萬步說，就算是不理睬恩德之事，單就實力來考慮，擁有信徒上百萬的大、小和卓，既然鬥不過噶爾丹策零與達瓦齊，被拘於獄，那麼，他倆又怎能和生擒達瓦齊的清軍交戰，怎敢拒絕“天下之共主”的大皇帝的招撫？因此，乾隆帝多次下諭，處理招撫二和卓之事。
乾隆二十一年四月十六日，定西將軍策楞奏：“回人總管”阿底斯等稟報：布拉呢敦、霍集占等“向與葉爾羌、喀什噶爾有隙”，現將回人並我等妻子移往庫車、賽哩木、濟木薩一帶居住，若遣使招撫，“自必投誠”，移往吐魯番。“查回人素受準夷奴役”，今舍伊犁而去，必不願回，應即派員同阿底斯等前往招撫，將他們移往吐魯番。②《清高宗實錄》卷511，頁3，23.阿底斯的報告，有真有假，說二和卓帶領回人離開伊犁，前往回疆，此事屬實，而言其與葉爾羌、喀什噶爾有仇有怨，則係謬誤，此二城為回疆中的大城，二和卓及其祖、父在此有很大的影響，親友屬員很多，是他倆依靠的重要基地，怎能說“有隙”而不前去。顯然，阿底斯這樣說有其個人打算，那就是欲圖利用清朝的威力“招撫”一大批“回人”，帶到吐魯番，使他們成為自己的部下，聽從差遣和納賦，這樣一來，不僅增加了屬民，擴大了租賦收入，壯大了個人勢力，而且也可討好於清朝，得到賞賜，封授爵職，大大抬高自己的政治地位。策楞可能是由於不了解二和卓的情況，故聽信了阿底斯的話，派員隨其前往招撫，乾隆帝則因為早有統一回部的想法，故未加核實而聽其行動。
也就是這月(四月)的二十七日，策楞再報：布拉呢敦、霍集占等兩次遣人至軍營，“俱未得達”，今又遣厄魯特策勒伯探聽清兵抵達伊犁的消息，“欲來投誠”。乾隆帝諭告軍機大臣：布拉呢敦等“屢次遣人探信，如投誠之意屬實”，策楞應立即派兵前往曉諭，他們設若親至軍營，“即準其歸降，其如何安插納貢之處，奏聞請旨”。②。
(二)自立為汗霍集占反叛。
起初，布拉呢敦與霍集占對怎樣處理與清朝的關係，看法有所不同。布拉呢敦比較謹慎，不願開罪於清政府，願意接受清朝的轄束；霍集占則“奸詐異常”，不甘為人下，力圖獨主回疆。乾隆二十年秋阿睦爾撒納叛亂後，霍集占忘掉清帝救命之恩，“率眾助逆”，於乾隆二十年十二月與阿會合，“兵勢頗盛”，擊敗了薩喇爾和協助清軍平叛的厄魯特台吉、宰桑之兵，使阿在這次戰爭中避免了失敗，進入伊犁。《清高宗實錄》卷505，頁9.第二年清軍收複伊犁時，小和卓始率部逃歸回疆，與兄長住在一起，他對清朝始終抱有疑貳之心。兩弟兄意見分歧，霍集占勢力大，能言善辯，對兄長的態度和行動逐漸產生了很大的影響，因此自二十年夏被清軍從地牢釋放後，在相當長的時間裏，他們一直沒有正式向清朝臣服和歸順，但也未采取公開敵視行動，而且還故意做了一件表示友好之事。