果然，就在當月，多爾袞以爭功等微小罪名處罰了隨征四川的將領希爾艮，此外如鼇拜、蘇納海、車爾布、覺羅巴哈納、索渾，富喇克塔等，均降職或停賞，甚至尼堪、滿達海等人最初也被議罰款，後來特旨免罪。這些人的罪名之一就是附和豪格，一同舉薦“有罪楊善之弟機賽”為護軍統領。《清世祖實錄》卷36，順治五年二月庚寅。
從此，多爾袞拉開了打擊異己的序幕，並很快將其推向高潮。順治五年三月，鄭親王被他的子侄輩吞齊、富喇塔，以及吞齊喀、紮喀納等人訐告，其中重罪之一就是他曾同情和庇護豪格。此案雖非針對豪格而發，卻重懲了濟爾哈朗的鑲藍旗勢力和鼇拜、圖賴、塔瞻、錫翰、索尼等反多爾袞的兩黃旗死硬派。這時，豪格已經知道，災禍就在眼前了。
果然不出所料，隻隔了一日，多爾袞就把豪格又推了出來，說他征服四川已有兩年，地方卻並未全部平定。說他推薦楊善之弟機賽補任護軍統領。說他對希爾艮冒功之事不加處理，甚至對多爾袞的“三次戒飭，猶不引咎”，於是諸王大臣議其罪應擬死。多爾袞這時擺出一副仁慈的麵孔，說：“如此處分，實在不忍。不行不行，不能這樣做。”眾人知道多爾袞之意，最後免了豪格一死，但卻剝奪了他的所屬人員，幽禁起來，等於判了無期徒刑。
豪格對此無端陷害，自然十分震怒，何況他性子又頗為暴躁。被關了禁閉之後，他還對阿濟格尼堪和蘇拜說：“要把我放了就沒事，如不放，別以為我會眷戀幾個孩子，我拿石頭把他們全砸死！”《清世祖實錄》卷37，順治五年三月己亥、辛醜。
不久，豪格便死在獄中了。究竟他是怎麼死的呢？有人說，是多爾袞“謀殺”的，《清朝野史大觀》卷1，“多爾袞”第4頁。也有的傳是多爾袞命監守者屢屢侮辱他，豪格“義憤填膺，……不數日，竟絕粒而死”。《多爾袞軼事》，“納肅親王妃”。不管怎麼說，豪格為多爾袞殺害致死是毋庸置疑的，死期當在順治五年或六年間，享年不過四十歲。
關於多爾袞和豪格之間的關係，還流傳著一則桃色傳說：豪格的福晉博爾濟錦氏容貌豔麗，趁祝賀多爾袞壽誕時二人私通，感情日濃。為長期在一起相處，多爾袞便頻繁派豪格出征，後來又找借口幽係了豪格。不久豪格死，攝政王府便張燈結彩，鼓樂齊鳴，京中大臣爭先恐後，往多爾袞府第去慶賀婚禮，各衙門為之一空。待新娘一現，才發現正是肅王妃，此時已成為攝政王妃了。《多爾袞軼事》，“納肅親王妃”。這段傳說，不全真實。多爾袞打擊豪格，絕不會僅僅因為這爭風吃醋的豔事，主要還是為了剪除政敵，鏟除威脅。但也並非盡屬於虛，順治六年十二月多爾袞元妃博爾濟錦氏死後，次年正月便納肅王妃博爾濟錦氏為己妃，這是有史可證之事。《清世祖實錄》卷8，順治元年正月己亥。這說明多爾袞與肅王福晉早就相識，也有可能發生過關係，不然為何在元妃死後，多爾袞偏偏選一個寡婦進入內宅，而且如此迅速？由此出發，多爾袞在豪格剛剛從四川回來就興起大獄，而且如此沉重地打擊他(對濟爾哈朗以及兩黃旗的鼇拜等，要寬容得多)，也很有可能摻雜著這種個人的因素。
不管怎麼說，多爾袞達到了一箭雙雕的目的，他既消滅了最主要的政敵，又把楚楚動人的肅王妃擁入懷中，取得了一次大勝利。但是，兩黃旗的眾多將領還都手握重兵，虎視眈眈，隨時都有可能顛覆他的統治，必須嚴密防範和不停頓地打擊。
(三)兩黃旗的受製與分化。
滿洲正黃旗固山額真譚泰，自順治元年投靠了多爾袞之後，很為本旗人所不滿，隸屬正黃旗的大學士希福就經常嘲笑他“衰庸”，為譚泰所恨，後譚泰揭發希福偽傳多爾袞語，最後將希福罷官，沒收家產奴仆。《清史列傳》卷4，“希福傳”第190頁；《清世祖實錄》卷7，順治元年八月辛酉。希福的侄子索尼對譚泰頗為不滿，就告發譚泰，說他隱匿諭旨，“不集眾傳示”，結果譚泰被削公爵，降為昂邦章京，解固山額真任。《清史列傳》卷6.“索尼傳”，《清世祖實錄》卷20，順治二年八月丁未。譚泰立刻又報複索尼，說他曾對人說，“所攻克的燕京不過空城一座，剩下的隻是流賊，何功之有？”企圖激怒多爾袞，譚泰還揭發說，索尼曾令人在內庫鼓琴，在禁門石橋下捕魚，在庫院牧馬，在朝門擊鼓作戲等等，並說索尼罵譚泰“背主”，又要強送他馬。結果法司詢於圖賴、鞏阿岱、錫翰、冷僧機、鼇拜等在場之人，大都與譚泰所揭不同，但法司官承多爾袞之旨，議索尼三罪論死，冷僧機、鞏阿岱、錫翰、塔瞻、鼇拜等坐以包庇之罪，分別議以革職、鞭責、罰銀等。最後多爾袞見此案頗冤，無法服眾，便發下諭旨：“索尼應依擬處死，念於朝廷效力有年，姑免死，革職並牛錄任，著當差，永不敘用。冷僧機、鞏阿岱、錫翰、鼇拜、塔瞻、巴泰、巴哈、德馬護等本應依擬，故免罪。”《清世祖實錄》卷20，順治二年八月丁未。
圖賴對多爾袞也頗不以為然。他隨多鐸征江南時，譚泰曾求他把南京留給自己來取，圖賴不滿於此，向多鐸揭發，多鐸寫信並遣塞爾特送索尼轉多爾袞，但塞爾特卻示此信於希思翰，被後者扔到河裏，以保護譚泰。後事發，多爾袞在議譚泰罪時，以其為自己親信而三日猶豫不決，圖賴便跑去詰責多爾袞，問他，“何為遲久不結耶？”《清史列傳》卷4，“圖賴傳”第201頁。多爾袞那裏受得了如此蔑視，說圖賴“以言詞逼我，我可不能忍受得了這樣聲色俱厲的態度！難道我不是先帝的子弟麼？”說罷拂袖而去。在座諸王見多爾袞生氣，便把圖賴抓住綁了起來，但又不好因此給他定罪，隻好暗暗懷恨在心。《清世祖實錄》卷23，順治三年正月辛酉。順治二年十月，圖賴借請求多爾袞指示他的錯誤時說道：“圖賴向年效力太宗，王之所知。如今圖賴之心仍像效力太宗那樣，不避諸王貝勒等嫌怨，見有異心，不為容隱；大臣以下，牛錄章京以上，亦不徇隱其過惡，圖賴向天發誓，必盡忠效力。”《清世祖實錄》卷21，順治二年戊申。這實際上是公開向多爾袞表明自己的態度，如有對不起太宗，別有用心的人或事，他絕不會袖手旁觀。多爾袞對這種公開的宣戰卻無可奈何，因為找不到圖賴的話中有什麼茬子。後來，多爾袞命圖賴與博洛一起率軍，攻打福建、浙江，回到浙江金華時病死，其子輝塞襲爵。但到順治五年三月吞齊等訐告濟爾哈朗時，又把圖賴從前的“罪狀"翻了出來，認為他和索尼等六人共立盟誓，謀立肅王等，實屬大逆不道，革去公爵，籍沒家產，革其子輝塞所襲之職，奪其燕京投充漢人，因其官職所賞蒙古人，籍沒楊善、羅碩家產時賞給之物，幽禁肅王時所賞銀兩鞍馬等，並把他的兄弟子侄充當侍衛的，全部革退，《清世祖實錄》卷37，順治五年三月己亥。就差把他從墳墓中掘出來焚骨揚灰了。多爾袞終於抓住了機會，對圖賴惡狠狠地報複。
譚泰的待遇就不同了。順治二年他被索尼訐告奪職之後，三個月後他就官複原職了。《清世祖實錄》卷21，順治二年十一月丙辰。後來圖賴逼迫多爾袞處罰譚泰時，他被下於獄，除給家口男婦九十餘人、器皿、衣服之外，其餘家產全部沒收入官，《清世祖實錄》卷23，順治三年正月辛酉。不到兩年他又被放了出來。《清世祖實錄》卷26，順治五年正月丁已。譚泰被關押期間，多爾袞曾派人去看他，給他送吃的。譚泰便對來人說，“如果王爺救我，我當殺身報恩。”多爾袞知道了，把他放了出來，就在順治五年三月大批兩黃旗將領因吞齊訐告濟爾哈朗而遭嚴厲處罰時，譚泰不但未受任何牽連，反而官複原職，與何洛會一起到江西去征討金聲桓了。《清史列傳》卷4，“譚泰傳”第220頁。《清世祖實錄》卷37，順治五年三月己酉、庚戌。到順治七年多爾袞的威勢達到頂峰時，他也當上了吏部尚書。