第三，注意發展農業生產。桑哥理財時，把眼光主要放在經商方麵。不忽木和完澤執政則把眼光主要放在農業生產方麵。由於朝廷幾經折騰，社會有所動蕩，開始出現流民。忽必烈為了發展生產，曾令地方官將汴梁等地逃難者“男女配偶成家”，由政府發給農具，讓他們附在土地上耕種。又曾“敕畸零拔都兒三百四十七戶佃益都閑田，給牛種農具，官為屋居之”。“命趙德澤、吳榮領逃奴無主者二百四十戶，淘銀耕田於廣寧、沈州”。這樣做，既可以解決那些流入和佃戶的溫飽問題，又可以為農業生產的發展作出貢獻。忽必烈還大力發展屯田事業，“設安西、延安、風翔三路屯田總官府”，令延安、鳳翔、京兆三路被桑哥罷免為民的軍士，重新“屯田六盤”。令一般軍隊，一衛萬人中，調二千人屯田。曾於和林漢軍四百人當中，“留百人，餘令耕屯杭海”，又因“木八刺沙上都屯田二年有成”，“增軍千人”。又“括所在荒田無主名者，令放良、漏籍等戶屯田。”生活在邊疆地區的捏怯烈女真，這時仍以漁獵經濟為主，忽必烈下令說：“與其漁於水，曷若力田，其給牛價、農具，使之耕”。同時，忽必烈又下令廉訪司，讓他們“巡行勸課農桑州”，督促發展農業生產。這些政策的施行，又使忽必烈晚年的政策重新回歸到中統、至元初年的重農軌道上來。
第四，取消理算，堅持設立肅政廉訪司，加強對地方官吏的監察與考核。從阿合馬到桑哥，都把理算（或稱鉤考）作為檢查各級機構貪汙、積欠，以增加國家財政收入的一項重要措施，他們可以利用理算，打擊異己，因此，導致社會動蕩不安，官員們紛紛表示反對。至元二十八年（1291年）十二月，禦史台臣上奏忽必烈說：“鉤考錢穀，自中統初至今餘三十年，更阿合馬、桑哥當國，設法已極，而其餘黨公取賄賂，民不堪命，不如罷之。”忽必烈令官員們討論。大概是因為官員們都反對理算吧，忽必烈隨即下詔：“罷鉤考錢穀，應昔年逋負錢穀文卷，聚置一室，非朕命而視之者有罪”。
忽必烈在禁止大規模理算以後，並非對各級官吏放任不管，而是加強禦史台、行台和肅政廉訪司的職能，讓他們加強對各級官員的監察和考核，為了讓這些監察官員各盡其職，忽必烈采納燕公楠的建議，每年歲終，各行省官員赴京彙報一年政績時，也“令行台臣赴闕，奏一歲舉刺之數”，如果這些監察官員沒有舉剌，那就是不稱職的監察官員。為了防止監察官員濫行舉劾之權，忽必烈又在真定路達魯花赤合散的建議下，不僅讓廉訪司的官員檢查民官，也允許“民官複檢責廉訪司文卷”。這種互相檢責、互相牽製的做法，既控製了各級地方官員，又限製了監察官員的胡作非為，對於政府機構的正常運轉大有好處。
第五，頒行《至元新格》。忽必烈建立政權以後，即著手進行立法工作，但一直未能製訂出比較係統的成文法典。至元二十八年（1291年），忽必烈又令何榮祖編定法律。“何榮祖以公規、治民、禦盜、理財等十事緝為一書，名日《至元新格》”，忽必烈“命刻版頒行，使百司遵守”。這是元朝建立以來頒行的第一部成文法典，使元朝統治正式走上法製管理軌道。
在不忽木和完澤的幫助下，忽必烈實行了以上一係列措施，雖然政府入不敷出的問題沒有得到解決，卻使桑哥主政時動蕩不安的社會迅速穩定下來，經濟重新走上正常發展的軌道。一史書記載，“當是時，百官得其人，萬事得其理，陰陽調和，年穀屢登，庶民樂業，海內大治”，“以為複見中統、至元初治”。這種評價可能有溢美之處，但也能反映出忽必烈晚年的社會穩定情況。
真金於至元十年（1273年）被立為皇太子，至元十六年（1279年）參決政事，至元二十二年（1285年）十二月因南台禦史上章請求忽必烈退位並立真金為帝受了驚嚇，憂鬱而死。其實，真金與忽必烈並非完全對立的兩派，真金屬於地地道道的義理派，堅決反對功利派。忽必烈主張調和兩派的觀點及其治國措施，更加適合於國家建設，而在忽必烈的思想實際中，則稍稍傾向於義理派。所以，父子兩人並沒有根本性分歧，不過是治國主張稍有不同而已。這也是忽必烈沒有深究南台禦史上章而大加撻伐的主要原因。因此，真金死亡，忽必烈十分傷感，遲遲沒有著手重新選立太子。
忽必烈遲遲沒有選立太子，還有一個原因，就是沒有物色到合適人選。
忽必烈正皇後察必共生四子，長子朵兒隻，死得比較早；次子真金因為朵兒隻早卒而居長；三子忙哥刺至元九年（1272年）被封為安西王，至元十年（1273年）又晉封為秦王，鎮守關中，至元十五年（1278年）死；四子那木罕，至元二年（1265年）被封為北平王，至元十九年（1282年）改封為北安王。
據《史集》記載，“合罕（指忽必烈）在數年之前，當海都的軍隊還未擄去那木罕之時，曾無意中說出了由他繼承大位，這個熱望一直都存在他心中。但後來，合罕注意到真金很聰明能幹時，就很喜歡他。”
那木罕為察必所生幼子，按照蒙古族的風俗習慣，幼子繼承家庭財產並有繼承汗位的權力，因此，忽必烈可能說過由那木罕繼承大位的話。但後來，忽必烈發現真金是更加合適的人選，就立真金為皇太子了。
真金被立為皇太子以後，那木罕想當皇帝之心並沒有死。因為，按照蒙古族選汗的習慣看，在召開忽裏台選舉大汗時，可以有兩個候選人，那木罕一直夢想成為另外一個候選人。為了爭奪帝位，他曾對忽必烈說：“他（指真金）繼位後，將怎樣稱呼你呢？”惹得忽必烈“生了氣，把他大罵一頓，從自己身邊趕開，並說道：‘不許再來見我”’。忽必烈開始對那木罕產生不滿。更能使忽必烈不願意立那木罕為皇位繼承人的，還是因為那木罕有著至元十三年（1276年）被西北諸王俘獲的不光彩曆史。