順治帝閱疏後於九月十五日降旨：“前以貪官蠹役壞法害民，深為可恨，故立流徙之法，重懲貪蠹，以安民生。刑名事關重大，立法不厭周詳，此奏內事情，著九卿、科道會同詳議具奏。”《清世祖實錄》第140卷第8頁。
過了兩個月，順治十七年十一月二十七日，刑部等衙門遵旨集議後，上奏對此事的擬議意見。也許是他們也認為流徙新例太重，也許是由於林起龍非等閑之人，對刑部等衙門集議此事帶來了重大影響。林起龍係順治三年進士，授吏科給事中，因過因故革職，順治帝親政後，召其來京，順治十年複原官。十一年二月初二，林起龍上疏言滿兵困苦，乞念“八旗舊兵為朝廷禁旅”，其馬匹、軍裝、軍器、草料等項費用，應由官府發給錢糧。順治帝閱後大為讚賞，特諭告吏部說：太祖、太宗創業開基，朕平定中原，統一四海，“悉賴滿洲兵力，建功最多，勞苦實甚”，今產薄差繁，資生無策，十年以來章奏雖多，未有言及於此者。“近覽科臣林起龍所奏，思慮周詳，條畫有緒，實心為國，忠誠可獎”，著令吏部酌議具奏優獎。隨即議準，加五品京堂銜(給事中為七品)。從此他備受皇上青睞，不斷擢升，十五年已任至戶部侍郎，十六年加太子少保，又上《更定綠旗兵製疏》，詳論綠旗兵冗力弱之弊，帝獎其奏“深切時弊，多有可采”，下所司議行。十七年加太子太保、兵部尚書，擢鳳陽巡撫，任至從二品的封疆大吏。《清世祖實錄》第81卷第2頁，第82卷第22頁，第83卷第2頁，第127卷第28頁；《清史稿》第244卷，《林起龍傳》。這樣一位屢言大事頗有識見蒙帝賞識擢用的方麵大臣，所奏之事，豈能輕易否定。何況帝對林起龍請改新例之疏，作了這樣的批示：“刑名事關重大，立法不厭周詳，此奏內事情，著九卿、科道會同詳議具奏”，似乎頗有采納其議的傾向。
是否如此，雖不得而知，但刑部等衙門集議後，卻讚同了林之建議，奏稱：“今撫臣林起龍言立法過重，人犯抵死不招，徒有流徙之虛名，致棄充餉之實用。臣等議，今後貪官犯贓，仍照律追擬，以助軍需。……衙役亦照官律擬罪。”②《清世祖實錄》第142卷第21、22頁；第22頁。
按照通常慣例，九卿、科道集議之事，一般是比較細致全麵，且多能體會帝之意圖，往往是奏上即準，或僅作些微批改，不料這次卻碰了一個大釘子。
少年天子對林起龍之奏和九卿科道之議，甚為不滿，降旨說：
“貪官蠹吏害民，屢懲弗悛，不得不特立嚴法，冀人人畏懼，省改貪心，始不負朕懲貪救民之意。今林起龍疏稱，隻緣法重，以致人犯抵死不招，追贓甚少。爾等會議，請仍照律擬罪，贓追入官，以助軍需。夫與其畏法不招，何若使其畏法不貪，與其饜足貪腹，以贓濟餉，何若使其不貪，民得豐裕，國賦亦充。朕明知立法既嚴，於貪官蠹吏有所不便，必懷怨心，但軫念民生，即為貪蠹所怒，亦不遑恤，若不如此，貪風何由止息，小民何日安生。仍著遵前諭行。林起龍所奏與爾等所議，俱屬不合，著嚴飭行。”②
福臨此旨，不算長，才二百二十個字，但寫得很好，不愧為一篇佳作。此諭之妙有四。一係帝嚴正申明懲貪救民之決心，不懲貪，不嚴懲，則貪官汙吏不知畏懼，不思悔改，則民無寧日，故必嚴辦。二是痛斥詭辯，所謂法重使犯官抵死不招，致追贓太少和有損軍需之說，純係一派胡言，為貪官開脫。旨中所說“與其畏法不招，何若使其畏法不貪，與其饜足貪腹，以贓濟餉，何若使其不貪，民得豐裕，國賦亦充”，講得真好，真精辟，真是至理名言，官若畏法不貪，則民自富，民富則國富國強，兵餉充裕，庫銀巨萬，何須仰仗於區區贖杖之銀籍沒之產。科爾昆、孫廷鈴、車克、王崇簡、梁清標、能圖、杜立德、王弘祚等六部滿漢尚書和鳳陽巡撫林起龍，枉自讀了多少年經史子集，卻將事體本末完全顛倒，不如這位少年天子如此透徹理解懲貪裕民富國之道。三乃教訓臣僚要有敢於任事不避恩怨的作風，任何一項法例，一個規定，一件措施，都必然會使某些人獲利，某些人不便，或遭受損失，都會招致怨言惹人不滿，問題是此例於誰有利，於誰不便，若是利於黎民利於國家，而不利於貪官汙吏，那麼便不應怕其生怨而中止新例，便要堅持下去，做到聖旨所說“但軫念民生，即為貪蠹所怨，亦不遑恤”，這樣就能止息貪風，民得寧居。四為是非分明，不管是為帝一再獎擢之能臣林起龍，或是屢受帝嘉獎之杜立德(被帝讚為“不貪一錢，亦不妄殺一人”之刑部尚書)、科爾昆等滿漢尚書，隻要持議偏妄，於民於國不利，即否定其議，且予斥責。總之，順治帝之此旨，可以算得上是一篇懲貪安民利國的絕妙佳作，若能長期照此辦理，吏治自能改觀，貪風焉能不斂。
為了更好地貫徹執行懲貪安民方針，順治帝還恢複了派遣禦史巡按各省的製度，以便更好地了解民情，糾參懲罪貪官汙吏。
三、力排眾議巡按停而複派。
巡按之派而複停，停而再派，是順治年間一件震動朝野的大事。巡按，乃沿襲明製。明朝特重言官糾劾之製，都察院有左、右都禦史各一員，官階正二品，與六部尚書同級，又設十三道監察禦史一百一十人。監察禦史官階並不高，才正七品，與小小芝麻官知縣一個級別，但其權甚大影響甚大。明製規定，十三道監察禦史，“主察糾內外百司之官邪，或露章麵劾，或封章奏劾。在內兩京刷卷，巡視京營，監臨鄉、會試及武舉，巡視光祿，巡視倉場，巡視內庫、皇城、五城，輪值登聞鼓。在外巡按、清軍，提督學校，巡鹽，茶馬，巡漕，巡關，攢運，印馬，屯田，師行則監軍紀功，各以其事專監察”。②《明史》第73卷，《都察院》。
尤以巡按之權更大。全國共有巡按二十一員，其中十三省各一員，任期三年。監察禦史雖僅正七品之低品級文官，但一被皇上欽點為巡按，就身價百倍，權大責重。他“代天子巡狩，所按藩服大臣、府州縣官諸考察，舉劾尤專，大事奏裁，小事立決。按臨所至，必先審錄罪囚，吊刷案卷，有故出入者理論之”。②一省之中，有“掌一省之政”的從二品巡撫，有“掌宣化承流，帥府州縣官，廉其錄職能否”的從二品布政使，有的省還駐有“掌厘治軍民，綜製文武，察舉官吏，修飭封疆”的從一品總督，還有按察使一人，“掌一省刑名按劾之事”，還有官階從三品的參政、從四品的參議道員若幹名，又有“掌一府之政”的正四品知府，“掌一州之政”的從五品知州，“掌一縣之政”的正七品知縣若幹員，他們平時在省府州縣均是言出令行萬民畏懼的大老爺，但一逢巡按來臨，總督巡撫固然要對其尊敬，布政使以下都得聽從這位七品官吩咐，唯其馬首是瞻，尤其是道員、知府、知州、知縣，更是奉承唯謹，畢恭畢敬，百般效勞，生怕得罪了這位巡按。原因很簡單，他是欽差大臣，是“代天子巡狩”，失敬於他，就是對帝不敬，就要被定上欺君大罪，他的舉薦彈劾，關係到地方官的升降獎懲。而明帝之所以要派遣巡按，一個重要目的就是嚴格保證地方絕對聽命於中央，保證帝旨之直達全國各府州縣，防止地方分裂或叛亂，同時也可了解民情，知民疾苦，除暴懲貪，濟民之困，以便更好地鞏固朱氏王朝的統治。
入清以後，初仍沿襲此製，遣官分任各省巡按。但順治七年四月，戶部等衙門會議兵餉缺額設法彌補時，奏請裁並衙門，其中包括裁汰巡按。四月二十九日攝政王多爾袞以帝名義降旨裁革巡按說：巡按禦史已到地方者，奉行事件無論已完未完，悉將文卷冊籍移送該巡撫料理，立即出境。已差未行及已差未到者，俱不必前去，以後巡行察舉，不拘年分，候旨特遣。《清世祖實錄》第48卷第22頁。