順治帝福臨親政伊始，便要取消攝政王裁汰巡按的令旨。順治八年二月十八日，工科左給事中姚文然上疏，奏請恢複巡按之製說：“巡按察吏安民，其任極重”，向議暫停，為不得其人故也。臣謂巡按之失人，總因都察院堂官之溺職。巡按出有差規，入則考核，整肅憲綱，全在堂官，欲巡按之得人，宜自澄清都察院諸臣始。帝將此事交與群臣商議。
順治帝於八年閏二月連下諭旨，嚴厲斥責各省督撫不糾參貪官汙吏，以致“有司貪汙成習”，《清世祖實錄》第53卷第20頁。民不堪命。他並下專旨，指責都察院左都禦史卓羅、副都禦史羅壁、巴朗等官“不循職掌，緘默苟容”，曠職失責，將其革職。
在帝旨嚴諭之下，順治八年三月初十，都察院奏上巡方事宜五條：一、定按臣差額。順天、真定派一巡按禦史，江寧、蘇、鬆、淮、揚並為二名巡按，浙江、江西、湖北、湖南、福建、河南、山東、陝西、四川、廣東、廣西，各派一名巡按，另派督學、巡漕、茶馬、巡鹽禦史。二、出差限期宜嚴。禦史奉差，一經命下，應照主考分考例回避，不見客，不收書，不用投充書吏員役，不赴宴會餞送，領敕後三日內即出都門。三、宜禁在差之員役。入境之日，隻許自帶經承文卷書吏，所至府州縣，取書吏八名、快手八名，事畢發回，隨地轉換，不得留按差、書吏、承差名色，不得設中軍、聽用等官，以及主文代筆。府州縣運司等官鋪設迎送，應一概嚴禁。四、宜核在差事跡。命下之日，每一差(即每一巡按禦史或茶馬禦史等)立為一冊，自出都以及入境，一應條陳、舉劾勘報等事，按日登記，以憑考核。五、宜定差滿之期。督學或三年或二年半，巡漕、鹽政一年交代，其餘大差中差，以一年半為期，差回之日，公同考核，三日內議定優劣，具疏奏請，分別勸懲。帝閱之後，允從其議。②《清世祖實錄》第55卷第7―9頁；第12、13頁。
過了五天，順治八年三月十五日，帝諭派監察禦史分巡各地，張慎學巡按順天，上官巡按江安徽寧池太廬鳳，秦世禎巡按蘇鬆常鎮淮揚，杜果、張嘉、聶？、王應元、王亮教、馮右京、劉達、王佐等八位監察禦史分別巡按浙江、江西、湖北、福建、河南、山東、山西、陝西八省，又派潘朝選等四位禦史分別巡視兩淮、兩浙、長蘆、河東鹽課，張中元巡視漕運。②。
順治帝福臨極為重視巡按之事，不僅遣派禦史出巡，而且在他們離京之前，還專門召見和訓示。順治八年四月初三，他禦駕至太和殿，召見巡按各省禦史，賜座，諭告他們說：“朕命爾等巡按各省，原為民生計也。爾等果能公廉自矢，為朕愛養斯民，使得安享太平，自當升賞，若貪婪害民，必行治罪。”諭畢，賜茶，遣行。《清世祖實錄》第56卷第8頁。順治八年八月二十九日，山西巡按劉嗣美引見，帝禦太和殿，召其入殿諭告說：“朕以爾為耳目，簡任巡方，爾其仰體朕意，察吏安民，清公自矢，則有司皆以爾為楷模，而循吏必多矣。”《清世祖實錄》第59卷第28頁。
但是，是否設置巡按之爭，並未結束，剛過兩年，巡按之製又遭衝擊。順治十年五月鄭親王濟爾哈朗等上疏，奏請罷革巡按。他們說：“各省巡按，為察吏安民之官，近者多受屬員獻媚，參劾無聞，應將巡按概行停止，其十四道、京畿道禦史，止留二十員，其餘俱應裁汰。”吏部、都察院議複此疏時，讚同其議，帝允其請。《清世祖實錄》第75卷第8頁。
此舉甚為言官不滿，順治十一年四月二十五日，蒙帝嘉獎勇於言事的吏科給事中林起龍，又上疏請複派巡按。他奏稱：“巡方者，天子耳目之官，內宣朝廷德意，外察督撫賢否，上考百官善惡，下問萬民疾苦，以及封疆安危，兵馬強弱，錢糧虛實，刑名直枉，無不稽查，所關至重。乞速選新舊廉能大臣，巡行各境，凡地方真情形真利病，加意體察，虛心谘訪，一破從前陋習，則利興害去，而德澤下究矣。”帝命所司評議。②《清世祖實錄》第83卷第13頁；第24頁。
鄭親王濟爾哈朗等議政王大臣可能揣摩帝有複設巡按之意，遂放棄一年前奏廢巡按之議，在遵旨議複林起龍之疏時，奏稱“應每省遣滿漢官各一員”。順治帝閱疏後降諭暫不設置說：“朕念近來吏治敝壞，民生困苦，故欲特遣滿漢大臣，巡察文武貪廉、軍民利病，複念奉差官員，隨帶員役馬騾，廩糧草料勢難缺少，直省地方頻年水旱，供億艱難，未免擾累，姑暫行停止。”②。
但是，不久又有漢官奏遣巡按，順治十二年初，宗人府府丞原毓宗條奏，請恢複禦史巡方之製，帝命鄭親王濟爾哈朗等會議。鄭王等議後奏稱：應令吏部、都察院會同考選各部院理事官、郎中以下才品兼優者，巡曆直省，回京之日，聽都察院考核，稱職者升用，溺職者重懲。帝從其議。《清世祖實錄》第89卷第3頁。
順治十二年六月正式決定，以刑部主事(四品)顧仁巡按順天，吏部理事官(三品)鍾有鳴巡按江安，禮部郎中(三品)孔允樾巡按蘇鬆，兵部員外郎(四品)葉舟巡按浙江，刑部郎中笪重光巡按江西，禦史張朝瑞、胡來相、祖永傑、高爾位、聶？分別巡按湖北、湖南、河南、山西、甘肅，中書科中書舍人(從七品)朱克簡、翁祖望分按福建、宣大，刑部郎中劉允謙巡按山東，兵部督捕副理事官(四品)王繼文巡按陝西，戶部理事官高民瞻巡按四川，禮部郎中張純熙巡按廣東，刑部理事官張所養巡按廣西，禦史劉秉政等分別巡視茶馬、漕運和京通各倉。《清世祖實錄》第92卷第2頁。
第二月，七月初九，順治帝於太和殿召見上述人員，諭告他們說：巡方禦史屢停屢遣者，係因天下之大，庶僚備設，欲其職任耳目，以甄別賢否也。“爾等既為朕耳目之官，出而代巡，務真心勤瘁，上以副朕特遣之心，下以慰眾仰望之意”，倘謂君門萬裏，恣意行私，貪贓壞法，致下民怨谘，“斷不仍照前律，止於按贓治罪，雖銖兩之微，必誅無赦”。從前奉差之禦史，因朕諭嚴切，初亦思立名節，勉邀廉潔虛譽，“及將報代，貪婪掊克者甚眾”，如今後有此等事，定當從重議處。《清世祖實錄》第92卷第16、17頁。
經過此番遣派，持續了五六年，到順治十七年又爆發了一場大的爭論。順治十七年六月初九，都察院遵諭就裁冗裕餉之事奏稱：直隸各省，自差巡方以來，未能即致地方寧謐，民生安遂，每年一遣，誠覺徒勞，請停止巡方之差，俟二三年後，選擇重臣，差往巡察。其禦史額數六十員，除六道與京畿道及光祿十庫，需用人員應留外，其餘應行裁汰。《清世祖實錄》第137卷第12頁。
巡按，多由都察院的監察禦史擔任，某些都禦史也曾當過巡按，遣派巡按，是都察院行使糾察職權的重要手段，是體現本院權勢的極好手段，也為都察院堂官滿漢左都禦史以及滿漢左副都禦史、漢左僉都禦史交結權貴，顯示威嚴，擴大影響，以及幹預地方政務與收受賄賂，提供了極好的條件，他們怎會做此損傷自己的事情？顯有秘密內幕和深刻的政治背景。
翻開《清世祖實錄》，發現了與此似有關聯的兩段記載，一是順治十七年二月初二皇上下諭說：國家任務，委任庶官，必大小臣工悉得其人，乃可共襄化理，在京各衙門官員宜加澄敘，以勵官常。大學士、尚書等官，俱著自陳，侍郎以下官俱著開列職名，候朕親行甄別。過了五天，初七日，成克鞏等五位大學士、吏戶禮刑四部尚書孫廷銓等，各遵諭自陳乞罷，帝俱諭留任，工部尚書劉昌年邁，嘉諭後允其原官致仕。兵部尚書梁清標遭帝嚴辭斥責。左都禦史魏裔介遵諭自陳，順治帝對其痛加譴責說：魏裔介由科員經朕破格提拔，擢司邦憲，即當殫心竭力，秉公執法，實圖報稱，乃全無擔當建白，裨益朝政，但知沽名釣譽，急於致高位。且身為台臣之長，禦史貪黷不法，屢經發覺，豈真無聞見，曾未據實糾參，徇庇欺蒙，殊負委任，“本當拿問，嚴行治罪”，姑予寬典，著革去太子少保並所加一級，仍照舊供職。“以後著洗滌肺腸，盡改前非，若複蹈舊轍，定從重治罪，必不輕恕”。《清世祖實錄》第132卷第2、4、5頁。