江寧若失，全省難保，浙江亦將落入鄭軍之手，清政府賴以立國的主要財賦支柱經濟支柱便將斷折，東南半壁江山改易旗幟，後果之嚴重，無論如何估計，都不過分。正是由於此戰關係極為重要，生性急躁易於衝動的少年天子福臨，竟不顧母後和王公大臣勸阻，下詔親征。
這一決定萬分荒謬，且將帶來極其嚴重的惡劣影響。江寧距京師遠達二千四百餘裏，即使帝率八旗勁旅晝夜兼程，也得十餘天，恐怕那時鄭成功早已高踞總督公署安撫黎民了。戰乃危事，勝負難卜，萬一清軍長途跋涉，勞累疲憊，陷入養精蓄銳的鄭軍伏中，皇上有個閃失，噩訊傳開，清軍難免大敗。即或互有勝負，相持不下，部分降清漢將漢官本已驚恐猶豫，更有可能三心二意，暗約降期，伺機內應，直隸京師發生變亂，更將立即威脅到清朝統治。不管怎樣說，在當時清朝統治尚未十分鞏固的形勢下，禦駕親征之詔，是極為欠妥，十分謬誤，且非常冒險的決定，後果之嚴重，恐將大大超過江寧之失守。因此，上至太後，以及滿洲王公和文武群臣，都反對這一決定，害怕這一決定，極力諫阻。
當時的一位傳教士把南京被圍及帝欲親征情形作了詳細的敘述，很能反映事實真相，現摘錄如下：
“(鄭成功)於1659年督率一蓋滿揚子江麵之巨大艦隊和一大批軍隊，沿江聲勢浩蕩地直向南京侵來，沿江各城市俱已被他所占據，而於是年中竟把南京圍困了起來。……當時在南京城內所駐紮之六千人馬中，僅隻有五百名滿洲戰士，而他們對於漢人軍隊，又是懷著猜疑態度的。一批派赴南京的援軍，竟被鄭成功之軍隊悉行殲滅。南京形勢岌岌可危，陷落似已是早晚間事了。
當這個噩耗傳至北京，膽怯的人們已經為首都底安全驚懼了起來。皇帝完全失去了他鎮靜的態度，而頗欲作逃回滿洲之思想。可是皇太後向他加以叱責，她說，他怎樣可以把他的祖先們以他們的勇敢所得來的江山，竟這麼卑怯地放棄了呢。他一聽皇太後底這話，這時反而竟發起了狂暴的急怒了。他拔出他的寶劍，並且宣言為他決不變更的意誌，要親自去出征，或勝或死。為堅固他的這言詞，他竟用劍把一座皇帝禦座劈成碎塊。照這樣他要對待一切人們的，隻要他們對於他這禦駕親征的計劃說出一個不字來時。皇太後枉然地嚐試著，用言詞來平複皇帝底暴躁。她扯身退去，而另遣派皇帝以前的奶母，到皇帝前勸誡皇帝，因為奶母是被滿人敬之如自己生身母親一般的。這位勇敢的奶母很和藹地向他進勸，可是這更增加了他的怒氣，他恐嚇著也要把她劈成碎塊的，因此她就吃了一驚地跑開了。各城門旁已經貼出了官方的布告，曉諭人民，皇上要親自出征。登時令城內便起了極大的激動與恐慌，不僅僅在老百姓方麵，因為他們不得不隨同出征，就是在體麵的人們，也是一樣的在激動恐慌。因為皇上在疆場上一旦遇到不幸，這可是因他的性格的暴烈，極有可能的，那麼滿人底統治，就又要受危險了。……各親王和各貴顯，各部臣和許多朝中的官吏，列為一長隊到湯若望底住館舍，迫切地請求他援助(湯若望冒險勸諫皇帝免掉親征，‘不要使國家到了破壞地步’，皇帝同意而下詔停止親征)。”魏特：《湯若望傳》，第289―291頁。
皇上親征作罷，清王朝避免了一次大的災難。順治帝鎮靜下來以後，便和議政王大臣們緊急商議對策。
四、轉危為安清軍大獲全勝。
還在江寧被圍之訊傳來以前，清廷已得悉鄭軍進攻瓜州、鎮江，立即決定遣將派兵，前往江南增援。順治十六年七月初八，世祖福臨諭命內大臣達素為安南將軍，同固山額真索洪、護軍統領賴塔等，統領八旗官兵，征剿鄭成功，並賜其敕說：“海逆鄭成功竊犯瓜州等處，茲命爾達素為安南將軍，同固山額真索洪、護軍統領賴塔等，統領大兵，前往征剿，與江南昂邦章京、總督、提督、巡撫等，協心戮力，多設方略，相機剿除，凡事與眾護軍統領等會議而行。……”②③《清世祖實錄》第127卷第3、4頁；第6頁；第8頁。
過了七八天，七月十五日，可能鄭成功抵達江寧城下的消息已傳至北京，帝命江西提督楊捷充隨征江南左路總兵官，寧夏總兵劉芳名充隨征江南右路總兵官。②江西提督轄中左右前後五營，兵五千名，寧夏提督轄中左右前後五營，兵四千名。楊捷、劉芳名奉命調任隨征江南總兵官，自必帶領本部大部分兵士前往征戰，這兩員將領統領之兵當有五六千名。過了兩天，七月十七日，帝又命精奇尼哈番董學禮為左都督，充隨征浙江總兵官。又過了五天，七月二十二日，帝特派戶部尚書車克往江南催集各省錢糧，製造戰船，並賜予敕書說：進剿海寇，製造戰船，需用錢糧浩繁，必應用不匱，始可刻期告成。今特遣爾前往江南，凡各省額賦，除兵餉外，酌量堪動項款，移會各該督撫，作速催取起解，爾察明驗收，轉發督造船隻官員，用濟急需。③。
但是奇怪的是，帝既下諭停止親征，又未遣派宗室王公或其他滿洲勳貴擔任大將軍，統領京師禁旅，前往江南，會同安南將軍達素征剿鄭成功，原因何在？看來很可能帝與議政王大臣們認為，江寧必然失守，東南形勢未卜，在軍情尚未明朗化以前，不宜再派重兵陷入勝負難定之地，而在靜觀待變。
正當清廷帝王大臣憂心如焚坐臥不安之時，八月初一突然傳來了出人意料的特大喜訊：鄭軍大敗，江寧解圍。江南總督郎廷佐報捷之疏於八月初一送到皇上麵前。郎廷佐奏稱：“海寇自陷鎮江，勢益猖獗，於六月二十六日逼犯江寧，城大兵單，難於守禦。”幸貴州凱旋梅勒章京噶褚哈、馬爾賽等，統滿兵從荊州乘船回京，聞敵攻江寧，星夜疾抵江寧。臣同駐防昂邦章京喀喀木、梅勒章京噶褚哈等密商，“乘賊船尚未齊集”，當先擊其先到之船。喀喀木、噶褚哈等發滿兵乘船八十艘，於六月三十日兩路出剿，“擊敗賊眾，斬級頗多，獲船二十艘印二顆”。“至七月十二日，逆渠鄭成功親擁戰艦數千，賊眾十餘萬登陸，攻犯江寧，城外連下八十三營，絡繹不絕，安設大炮地雷，密布雲梯，複造木柵，思欲久困。又於上江下江及江北等處，分布賊艘，阻截要路”。臣與喀喀木等晝夜固守，以待援兵協剿。至七月十五日，蘇鬆水師總兵官梁化鳳親統馬步官兵三千餘名至江寧，撫臣蔣國柱調發蘇鬆提督標下遊擊徐登第領馬步兵三百名，金山營參將張國俊領馬步兵一千名，水師右營守備王大成領馬步兵一百五十名，駐防杭州協領牙他裏等領官兵五百名，俱抵江寧。臣等公議，敵今分兵逼城，立三營於儀鳳、阜二門外，當先擊之，遂於七月二十三日，“派滿兵堵賊諸營，防其應援，遂發總督提督兩標綠旗官兵並梁化鳳標營官兵，從儀鳳、阜二門出剿。賊踞木柵並力迎敵。我軍各將領奮不顧身，冒險先登，鏖戰良久，陣斬偽總統餘新，並斬偽總兵二員，擊死賊眾無數，至晚收軍。臣等又公議，滿洲綠旗官兵悉出擊賊，恐城內空虛，留臣守城，其喀喀木、噶褚哈、馬爾賽、梁化鳳等由陸路進，漢兵提督管效忠、協領紮爾布巴圖魯、費雅住巴圖魯、臣標副將馮武卿等由水路進，各統官兵，次日五鼓齊出。賊已離營，屯紮高山，擺設挨牌火炮，列陣迎敵，我兵自下仰攻，鏖戰多時，賊始大敗，生擒偽提督甘輝並偽總兵等官，陣斬賊眾，不計其數，燒毀賊艘五百餘隻，餘孽順流敗遁。喀喀木、噶褚哈等複領水陸兩路官兵，疾追至鎮江、瓜州，諸賊聞風乘舟而遁，大軍於二十八日回江寧。”《清世祖實錄》第127卷第11―13頁。