遺詔最後一段之特殊重要，還在於它變更了祖製。這主要體現在兩個方麵。一是因為在此之前，新君之立，皆係由八旗王公大臣，尤其是八旗親王、郡王、貝勒商議而定的。清太祖努爾哈赤於天命七年(明天啟二年，1622)親定八和碩貝勒共治國政製，規定新汗由八和碩貝勒商議後“任置”。清太宗皇太極暴卒後，亦由八旗王公大臣議定推立新君。新汗新君並非隻能由先汗先帝之皇子中選立，其他非皇子的王貝勒也有資格被推立為嗣君。本書第一章的白黃旗主爭位，即已講明了此事。但是這次的繼位人，並不經過八旗王公大臣議立，而是由世祖福臨指定，他可以征求王公大臣和湯若望的意見，但最後決定權仍僅僅歸於這位快死去的皇帝，這與祖製是截然相反的。
另一方麵，以往皆係八旗宗室王貝勒輔佐新君治政，或代攝政務。二十五年前太宗皇太極被諸貝勒“任置”為汗時，盡管他已年過而立之歲，多次統兵出征，文武雙全，可是即位之初，仍係與大貝勒代善、二貝勒阿敏、三貝勒莽古爾泰並坐同尊，共治國政。十七年前太宗去世後，睿王爭奪帝位未遂後，諸王議立由鄭睿二王輔政，軍國大事皆由兩位攝政王處理，六齡幼君純係傀儡，太後亦無實權。現在，福臨變更了祖製，既指定皇子繼位，又不讓諸王輔政，而諭命四位大臣“保翊幼主”，輔治國政，徹底廢除了自太祖以來八旗王貝勒議處、輔治國政的祖製。
福臨之所以要變更祖製，其原因雖未明說，但綜合當時政局，也不難了解，主要是此舉有其必要性，也有其可能實現的條件。
八年傀儡幼帝朝不保夕的苦難生涯，兄王冤死，嫂被皇叔多爾袞霸占的仇恨和羞辱，嚴重傷害了生性倔強的少年天子的自尊心，使他對攝政王恨之入骨，對親王輔政、攝政製度深惡痛絕，堅決不讓此景重現，故果斷革除祖製，改由諭定之親信大臣輔理國政。這是輔政大臣製出現的主觀原因。但這一製度之能實現，又取決於兩個基本條件。
第一個基本條件，也是最重要的決定性條件，就是君權強大。經過親政以來十年的慘淡經營，少年天子已經擁有主宰全國軍政的大權，真正達到了至尊無上的地步。他親領正黃、鑲黃、正白三旗，在八旗之中占據了絕對優勢，其他親王郡王或隻轄一旗，或僅隻轄有幾個佐領，無法與帝抗衡。他連續籍沒或降爵懲處了六位親王，皇父攝政睿親王多爾袞卒後籍沒焚屍削爵，勒令英親王阿濟格自盡，籍沒削爵，豫親王多鐸連坐，卒後其子多尼由親王降為郡王。因與睿王之案有牽連，巽親王滿達海、端重親王博洛、敬謹親王尼堪卒後追罪，巽王、端重王之子俱降兩級，降為貝勒，巽王所襲之爵係其父代善之爵，令康郡王傑書襲其父親王爵，敬謹親王尼堪已為國陣亡，其爵仍令傳襲。他革除了王管部院之製，禁止部院再以書啟奏叔王鄭親王濟爾哈朗，一律奏呈於帝。他多次拒絕諸王貝勒和滿洲大臣之議，悉按己意處理國政，如順治十年廢皇後，十七年堅持繼續派遣巡按。他親自擢用了一批忠於皇上的臣將，加強了兩黃旗和正白旗的實力，上三旗人才濟濟，猛將如雲，分任軍政要職。墾田頃畝的增加，社會生產逐漸恢複，田賦收入陸續增多，雲貴五省的平定，除福建的廈門一帶及川東小塊地區外，全國的絕大部分州縣盡隸清政府版圖，這自然是皇上治國有道，因而提高了天子威望。君威無比，帝權強大，是福臨能夠變更祖製，親立皇子為太子，取消諸王輔政，指定親信大臣保翊幼主輔理國政的最基本的條件。
另一方麵，王權之削弱，也為輔政大臣製和立皇子之舉的順利實現，提供了有利條件。想當年，禮、睿、鄭、豫四位親王和克勒郡王各為一旗之主，英親王、餘餘郡王及其子端重親王各轄若幹牛錄，先後擔任大將軍，統軍出征，議處國政，下五旗王貝勒是何等的威風。然而，曾幾何時，睿、英二王籍沒，豫親王多鐸之子多尼襲封親王後，既降為郡王，又由其兩代轄有的鑲白旗調至正藍旗，實際上已被剝奪了旗主之權和身份，正藍旗和鑲白旗已成為無旗主之旗。隻有禮親王代善之子康親王傑書、鄭親王濟爾哈朗之孫簡親王德塞、克勤郡王嶽托之孫衍禧郡王羅可鐸仍分係祖、父所遺之正紅、鑲藍、鑲紅旗旗主。這就從根本上注定了下五旗王貝勒難與皇上敵對。
兼之，順治帝逝世前夕，宗室諸王大都幼小，沒有能力治政統軍。以“鐵帽王”而言，簡親王德塞隻有九歲，莊親王博古鋒十一歲，信郡王多尼雖有二十六歲，然而在世祖去世後第四天即已病故，其子鄂紮襲爵，隻有六歲，衍禧郡王羅可鐸、康親王傑書和顯親王富壽稍大一點，分係二十一歲、十九歲、十八歲。順承郡王勒爾錦的年歲也小，其他軍功諸王之子孫，敬謹親王尼堪之子尼思哈於順治十七年死時，才十歲，端重親王博洛之子齊克新，順治十八年死時隻有十二歲。惟有安親王嶽樂已進入中年，三十七歲。
從世祖福臨之弟兄和皇子的情況看，肅親王豪格、承澤親王碩塞、洛洛、格博會諸皇兄已死，其餘葉布舒、高塞、常舒、韜塞等皇兄皇弟，都是先皇之庶妃所生，當時尚無封爵，沒有資格肩負治國重任。福臨之現存四位皇子，皆是幼童，當然不可能結黨謀位。
正是由於以上情形，此時宗室諸王權勢處於自太祖以來最為衰弱之階段。王權之弱，為世祖變更祖製創造了十分有利的條件。
皇權強大，王權削弱，固是世祖變更祖製的最好機會，但僅此也不行，還須物色到合適的大臣。這幾位大臣，既必須是皇上的忠臣，又必須有才幹，有威望，已經擔任要職，為帝寵信。經過親政前後十來年的考察、栽培和使用，世祖福臨找到了這樣的人選，即內大臣索尼、蘇克薩哈、遏必隆和鼇拜。
索尼，滿洲正黃旗人，大學士希福之親侄，於太祖時自哈達來歸，精通滿、蒙、漢文，任職文館，賜“巴克什”號，授一等侍衛，曆事太祖、太宗、世祖三朝，久任吏部啟心郎，具體處理部務，軍功政績卓著，世職晉至二等子。索尼智勇雙全，在兩黃旗大臣中威信甚高，很受攝政王多爾袞賞識，曾幾次拉攏，索尼忠貞不貳，誓死效忠先帝太宗和少年天子福臨，嚴詞拒絕。睿王惱羞成怒，革索尼職，罰銀，遣往盛京守昭陵(太宗之陵)。世祖親政後，即召索尼還朝複爵，先後擢任內大臣、議政大臣、總管內務府事，晉世爵至一等伯，賜赦免死二次。
蘇克薩哈，滿洲正白旗人，父蘇納娶太祖第六女，曆任護軍統領、兵部承政、固山額真，授三等輕車都尉世職，後因故削世職。蘇克薩哈乃蘇納額駙之長子，初授委署佐領，鬆錦戰役立功，授三等輕車都尉世職，順治七年複其父世職，以蘇克薩哈並襲為三等男。順治八年正月世祖福臨親政後，蘇克薩哈與睿王府護衛詹岱等首舉故主殯殮服色違製及諸叛狀，追罪睿王，帝遂擢蘇克薩哈為護軍統領、議政大臣，晉一等男兼一雲騎尉。順治十二年蘇克薩哈率兵大敗大西軍南康王劉文秀所遣之盧明臣部，晉二等子，任領侍衛內大臣，加太子太保。
遏必隆，滿洲鑲黃旗人，係開國元勳弘毅公額亦都第十六子，母為和碩公主。遏必隆初襲父一等子，任侍衛，管佐領，尋因故削爵，不久以鬆錦戰役立功，授騎都尉世職，入關後敘功晉二等輕車都尉世職。順治五年以曾謀立肅親王豪格，革世職及佐領，籍沒家產一半。順治八年世祖福臨親政後，複其職，並襲兄圖爾格之二等公為一等公，擢領侍衛內大臣、議政大臣，加少傅兼太子太傅。
鼇拜，滿洲鑲黃旗人，開國元勳直義公費英東之親侄，太宗及順治時，勇猛衝殺，軍功累累，入關前夕已任至護軍統領，晉世職三等子。入關後晉一等子，因忠於世祖，被攝政王抑其功，不僅未再晉爵，反降為一等男，幾次論死罰贖。世祖親政後，初晉鼇拜三等侯，再晉二等公，加少傅兼太子太傅，擢任領侍衛內大臣，教習武進士，賜赦免死二次。
這四位大臣，既係開國功臣，曆任要職，封授爵位，有的還係皇親國戚，其中三人擁立世祖有功，且因效忠少君而遭攝政王壓抑懲罰，另一人首告睿王“謀逆”立下功勞，因此世祖對他們格外寵信，擢任大官要職，晉授爵職，倚為親信，故選中他們為輔政大臣，讓其保翊幼主，輔理國政。
順治十八年正月初七少年天子福臨病故，當天原任學士麻勒吉、侍衛賈卜嘉遵帝遺命，捧遺詔奏知皇太後，太後命宣示諸王公大臣及侍衛。索尼、蘇克薩哈、遏必隆、鼇拜四人跪告於諸王貝勒推辭輔政說：“今主上遺詔，命我四人輔佐衝主，從來國家政務，惟宗室協理，索尼等皆異姓臣子，何能綜理，今宜與諸王貝勒等共任之。”諸王貝勒說：“大行皇帝深知汝四大臣之心，故委以國家重務，詔旨甚明，誰敢幹預，大臣其勿讓。”索尼等奏知皇太後，乃誓告於皇天上帝與大行皇帝靈位前，然後受命視事。②《清世祖實錄》第1卷第4、5頁；第5、6頁。
四位輔政大臣之誓詞為：“茲者先皇帝不以索尼、蘇克薩哈、遏必隆、鼇拜等為庸劣，遺詔寄記，保翊衝主。索尼等誓協忠誠，共生死，輔佐政務，不私親戚，不計怨仇，不聽旁人及兄弟子侄教唆之言，不求無義之富貴，不私往來諸王貝勒等府，受其饋遺，不結黨羽，不受賄賂。惟以忠心，仰報先皇帝大恩。若複各為身謀，有違斯誓，上天殛罰，奪算凶誅。”②。
至此，世祖福臨遺詔指定皇子繼承帝位，諭令四位大臣保翊幼主輔治國政，這一變革祖製的重大決策得以實現了，從此以後，新君皆由先皇於皇子中擇立。這對穩定新舊天子交接之時的政局，提高君威，壓抑王權，加強君主集權製度，產生了強大的影響。
二、嚴於律己特頒引咎遺詔。
順治十八年正月初七少年天子福臨病逝，降頒遺詔。在清朝十二帝(包括太祖、太宗)中，這道遺詔可算是最為特別的遺詔，甚至可以說是唯一奇特之遺詔，往前延及秦漢唐宋元明諸朝，它也算是罕有之遺詔。
奇特之一是，此遺詔並非沿襲俗例，專為本帝歌頌，套用陳詞濫調寫成的讚本聖德的本紀和行狀，而是一份發自內心深處嚴格引咎自責的罪己詔，此在曆朝兩千餘年上百名帝君的遺詔中，實為罕見，實非尋常。