攻克長泰之後，鄭成功集結大軍進攻漳州府城，將之層層包圍。四月，清朝為解漳州之圍，於是募集百艘船艦進犯廈門，攻鄭成功所必救。鄭成功遂派陳輝、周瑞等率領百餘艘戰艦迎擊，於崇武大敗清軍，取得崇武戰役的勝利。鄭軍在海上大捷，因而對漳州城的施壓沒有稍減；然而漳州守軍亦相當頑強。同年九月，清軍將領固山額真金礪率領2萬人大軍開抵福建，進入泉州府；鄭成功下令解除漳州之圍以待敵軍。
永曆七年（公元1653年）四月，金礪進犯海澄，與鄭成功展開激烈戰鬥。在清軍的猛烈炮火之下，鄭成功部隊損失慘重，許多部將戰死；鄭成功見軍隊士氣低落，親臨陣前喊話，也險遭炮擊。五月，鄭成功偵知清軍火藥錢糧不繼，於是誘敵決戰，趁清軍大舉渡河之際，以火攻大破金礪，取得海澄戰役的勝利，海澄得保安全。海澄戰役以後，金礪被清廷召回京師，雙方再度處於相持局麵。
北上皆捷，南征失利
永曆九年（公元1655年）九月，清朝定遠大將軍、鄭親王世子濟度率3萬大軍入閩，會同駐閩清軍，準備進攻廈門。鄭成功決定放棄已占領的漳州、泉州兩府屬邑，並拆毀城牆讓清軍無所屯紮，借此鞏固金門、廈門的防禦。與此同時，還派遣部將率領舟師兩路進擊，一路北上浙江，一路南下廣東，令清軍腹背受敵、難以兼顧頭尾。北上鄭軍連戰皆捷，攻入舟山；南下鄭軍雖一度攻取揭陽，卻遭到清援軍擊潰，死傷慘重。隔年四月，濟度調集各路水師進攻廈門，於圍頭海域遭鄭軍痛擊，清軍大敗而歸。鄭軍取得泉州戰役的勝利。永曆十年（1656年）十二月，鄭成功部隊又在閩東北取得護國嶺戰役的勝利。
南征舟師返回廈門，鄭成功議處敗戰之罪，原本要處死蘇茂、黃梧、杜輝，但是在眾將跪地求情之下，鄭成功決定將蘇茂一人斬首，黃、杜則戴罪圖贖。後鄭成功命黃梧鎮守海澄，還特別囑咐黃梧以戴罪之身應力圖建功；但是黃梧知道鄭成功一向治軍嚴苛，害怕自己一旦再犯錯就會送命，於是便與副將蘇明商議，決定向清朝投降，獻出海澄縣城。海澄是鄭成功多年來投注了相當多人力、物力建造起來的堅固堡壘，黃梧的投降無疑給了鄭成功一大打擊。
攻取台灣，荷蘭屈服
永曆十五年（公元1661年），鄭成功親率將士000人、戰船數100艘，自金門料羅灣出發，經澎湖，向台灣進軍。同年四月初一，鄭軍經由鹿耳門水道進入台江內海禾寮港（今台南市北區，荷蘭駐軍要塞）登陸，在台江海域與荷蘭軍艦展開激戰，擊沉荷軍艦赫克特號，取得台江內海控製權，並同時在北線尾地區擊敗荷蘭陸軍，以優勢兵力包圍普羅民遮城（今台南市）。不久，守軍出降。五月初五，鄭成功改赤崁為“東都明京”，設承天府及天興、萬年二縣。八月中旬，荷、鄭兩軍於台江內海展開激烈海戰，鄭軍大獲全勝，擊沉一艘荷蘭軍艦，並奪取船隻數艘，自此荷軍喪失主動出擊的能力。
同年十二月，日耳曼裔荷蘭士官叛逃，鄭成功在其提供之情報的幫助下，炮轟擊毀熱蘭遮城的烏特勒支碉堡，使熱蘭遮城之破終成定局。十二月初八，荷蘭大員長官揆一修書予鄭成功，表示同意“和談”。幾經談判，荷蘭終於在十二月二十日向鄭成功屈服，退出台灣。淪陷了30多年的台灣從此重又回到祖國的懷抱。
鄭成功收複台灣後，首先廢除了荷蘭殖民者的殘酷剝削，並把荷蘭人所築的赤嵌城改為承天府，把台灣改稱東都。開辟田園，從事生產，設立學校，發展文化，使台灣的經濟文化得到迅速的發展。
“點評”
鄭成功是一代偉人。他忠貞剛毅，氣貫長虹。他敢於鬥爭，敢於勝利，一舉擊敗了世界頭號海上霸主——荷蘭殖民者，將他們驅逐出台灣，維護了中國的領土完整。鄭成功是一種精神，他堅忍不拔，義薄雲天。他曆經百戰，縱橫陸海，高舉義旗北伐、東征，用可歌可泣的英雄業績書寫了“精忠報國”的壯麗人生。
§§第十五章 清朝時期