根據《治安管理處罰法》第九十五條和《公安機關辦理行政案件程序規定》的規定，公安機關在對治安案件調查結束後，應當根據調查結果，區分不同的情況，分別作出相應的處理決定：
（1）作出相應的處罰決定。公安機關依照《治安管理處罰法》的規定，對有關治安案件調查結束後，認為違法行為確有必要依法給予治安管理處罰的，按照情節輕重和危害結果，作出處罰決定。“確有違法行為”的，是指依照《治安管理處罰法》第三章的規定，需要給予治安管理處罰的違反治安管理行為，如果不是違反治安管理的其他違法行為，則不適用本法進行處罰。
（2）作出不處罰決定。根據調查獲取的事實，公安機關認為依據法律不應當處罰的，或者違法事實不能成立的，應當作出不予處罰決定。
（3）移送有權主管機關依法追究刑事責任。根據調查結果，公安機關認為違法行為已涉嫌犯罪的，轉為刑事案件辦理，或移送有權主管機關依法追究刑事責任。依據《公安機關辦理行政案件程序規定》第一百四十七條的規定，違法行為涉嫌構成犯罪的，轉為刑事案件辦理或者移送有權處理的主管機關、部門辦理，無需撤銷行政案件。公安機關已經作出行政處理決定的，應當附卷。
（4）通知有關行政主管部門對涉及的其他違法行為進行行政處罰。根據調查結果，公安機關發現違反治安管理行為人還有其他違法行為的，在對違反治安管理行為作出處罰決定的同時，應通知有關行政主管部門處理。由於法律規定不同的行政機關擁有不同的行政處罰權，如公安機關擁有拘留權，吊銷公安機關發放的許可證的權力，如果行為人還有應當被吊銷營業執照的行為時，依據法律規定，就隻能由工商行政主管部門行使，公安機關沒有這個權力。