“北洋軍閥多君子”這話用在北洋政府總理段祺瑞身上毫不為過，據說段祺瑞一生甘於清貧，在其任政府總理時，他“不抽、不喝、不嫖、不賭、不貪、不占”，人稱“六不總理”。並因致電逼迫清帝退位、討伐張勳複辟和抵製袁世凱稱帝這三件事，有“三造共和”的美譽。
段祺瑞雖然位居國務總理一職，但他在北京一生沒有不動產，都是租房子過日子的。在他原配夫人去世後，袁世凱把養女張氏嫁給了他，並將一套房子作為嫁妝一並相送，可這套房子是原房主與袁世凱打牌輸了40萬大洋，才把房子抵押給袁世凱的，但並沒有給房契。等袁世凱一死，房主的兒子拿著房契來找國務總理段祺瑞，要收回房子。段祺瑞見人家手中有房契，二話沒說，帶著一家人搬了家。
作為全國的軍政首腦，大權在握，自然不缺人給送東西。但段祺瑞他從來不收禮，隻是遇見最親近的下屬和友人送來禮物、卻之不恭時，才會在禮物中挑選一兩樣最不值錢的東西留下，餘者則悉數退還。段家家規很嚴，夫人和姨太太都不準幹預公事。有一位姨太太想替老媽子的親戚謀個差事，段祺瑞立即氣歪了鼻子，段祺瑞在生氣的情況下鼻子會歪，表示自己不會做出賣官鬻爵的事情。段祺瑞的兒子段宏業從小寄養在親戚家，十幾歲才回到段祺瑞身邊，小時候由於缺少良好的教育，所以文化水平不算高。不少人勸段祺瑞給兒子在政府部門安排個職位，段都沒有答應，在他看來自己的子女們應該靠自己，從最底層做起，一步步上升，不能一下子就做官。胞弟段祺甫來京求大哥給自己找個官做，段祺瑞也是一口回絕，給了他一些錢回去做買賣。
和當時其他軍閥一樣，段祺瑞也討了幾房姨太太。當時的第四位姨太太，一進門就愁眉不展，原來她已經有了意中人，段祺瑞便吩咐他妻子要像嫁女兒一樣，成全她和意中人的婚事。段祺瑞讓姨太出嫁的事，在當時傳為佳話。
上中學的時候，讀魯迅先生的《紀念劉和珍君》一文，感覺北洋政府壞透了，後來看段祺瑞傳記的時候才知道三一八慘案發生後，段祺瑞在哀悼死難同胞大會上，當眾長跪不起，自願承擔全部責任，並主動辭去所有職務，立誓終身食素以贖罪。此後他退居天津，成為虔誠的佛教徒，自號正道居士，每日吃齋，念佛，看書，下棋，還資助了好幾個圍棋手。1933年保持晚節，堅決不做日本的漢奸傀儡，被蔣介石以師禮接到上海居住。
1936年夏，段祺瑞因多吃了幾塊西瓜導致腹瀉，從此病痛不斷，醫生就勸他吃點肉食，增加體質，但段祺瑞表示：“人可死，葷不可開。”拒絕了醫生的建議，最終不治而死。解放初期，章士釗曾將段祺瑞的生平扼要呈書給毛澤東，尋求他的意見。毛澤東閱後微微一笑說：“有功有罪，已經化敵為友了嘛。”
而他晚年留下的遺言，則表達了對中華複興的堅定期待，短短的“八勿”遺言中涉及了修身，齊家，治國，平天下的各個方麵的寶貴人生經驗。
段祺瑞遺囑：
餘年已七十有餘，一朝怛化，揆諸生寄死歸之理，一切無所縈懷，惟我瞻四方，蹙國萬裏，民窮財盡，實所痛心，生平不喜多言，往日曲突徒薪之謀，國人或不盡省記，今則本識途之驗，為將死之鳴，願我國人靜聽而力行焉！則餘生雖死猶生，九原瞑目矣。國雖微弱，必有複興直道，亦至簡單。
勿因我見而輕起政爭，
勿尚空談而不顧實踐，
勿興不急之務而浪用民財，
勿信過激言行之說而自搖邦本。
講外交者，勿忘鞏固國防；
司教育者，勿忘保存國粹；
治家者，勿棄國有之禮教；
求學者，勿鶩時尚之紛華。
此八勿，以應萬有，所謂自力更生者在此，轉弱為強者亦在此矣。餘生平不事生產，後人宜體我樂道安貧之意，喪葬力崇節簡，殮以居士服，毋以葷腥饋祭。
此囑。