脂蛋白中的蛋白部分稱為載脂蛋白，因其與脂類結合並運載脂蛋白而得名。
載脂蛋白不僅是脂蛋白重要組成成分，在結合和轉運脂質及穩定脂蛋白的結構上發揮主要作用，而且還可以調節脂蛋白代謝關鍵酶的識別，促進脂蛋白的合成與代謝，是作用於脂類和脂蛋白有關酶的重要輔酶，在脂蛋白代謝上發揮著重要作用。
各種載脂蛋白主要合成部位是肝，小腸也可合成少量。近年發現，腦、腎、腎上腺、脾、巨噬細胞等部位也能合成載脂蛋白。
載脂蛋白一般分為載A、B、C、E、（a）五大類，每類中又有亞類，如A類中有分為AⅠ、AⅡ、AⅣ，B類中又包括B48、B100等，還可能有一些變異體。迄今已發現20餘種載脂蛋白等。不同脂蛋白含不同的載脂蛋白，如高密度脂蛋白主要含ApoAⅠ、AⅡ；低密度脂蛋白幾乎隻含ApoB100；極低密度脂蛋白除含ApoB100外，還含ApoCⅠ、CⅡ、CⅢ及E；乳糜微粒含ApoB48而不含ApoB100.
人載脂蛋白的氨基酸序列、基因結構特點大多已較了解。在脂蛋白的代謝中，各種脂蛋白之間的載脂蛋白和其他成分處於不斷地交換之中，脂蛋白顆粒也會隨之發生改變，而影響到脂蛋白表麵的載脂蛋白，從而使載脂蛋白暴露出受體的結合位點，容易和受體結合，進行代謝。