大雄寶殿正中，佛祖釋迦牟尼高踞於蓮花座上。佛祖兩眼向前凝視，右手微微抬起，仿佛正在說法，造型極為生動，肅穆中又有親切之感。佛像由中央美術學院華東分院（現為中國美術學院）師生和民間藝人所塑，是以唐代禪宗著名雕塑為藍本創作的。佛身與各個局部比例適度，體態端莊，麵容慈祥，按佛教語言謂“妙相莊嚴，氣韻生動”。佛身淨高9.1米，加上蓮座、須彌座和石壇，共高16.6米。佛像上懸寶蓋，彩畫垂旒，高24.8米。佛祖背後的一圈火焰叫“背光”，從尖頂到地麵是19.6米，中間有一麵“摩尼鏡”（又稱長明鏡），火焰中還有七尊小佛像，是釋迦牟尼在修道成佛前的七種佛相，又說是他的祖先。這尊佛像從高度說，稱得上是我國最大的木雕坐式佛像。
大殿兩廂站著的是保護佛法的“二十諸天”，個個體態豐偉，姿容凝重。“諸天”，是佛教中“諸位尊天”的簡稱。“尊天”，是管領一方的天神，他們還沒有成佛，是在家的“神”，但都是佛法的護持者。他們各有生平，源自南亞次大陸的古老神話傳說。佛法東傳，經過西域到中國，其中又有嬗遞。立在靈隱寺大雄寶殿中的，已經是漢化了的“諸天”。依佛教排列的禮佛次序，他們的排位是：大梵天、帝釋天、北方多聞天王、東方持國天王、南方增長天王、西方廣目天王（以上四位“諸天”，就是“四大天王”）、密跡金剛、大自在天、散脂大將、辯才天、功德天、韋馱天、地天、菩提樹神、歡喜母、摩利支天、日天、月天、水天、閻摩羅王。
靠殿壁兩廂趺坐著的十二尊塑像，是“十二圓覺”。“圓覺”，直譯意為“圓滿的靈覺”，也就是“修行覺悟圓滿無缺”、“修行功德圓滿”的意思，是“真如”、“佛性”的別名。據傳，釋迦牟尼的十二部佛經，就是由這十二位大弟子整理出來的。據《圓覺經》，十二位菩薩是：文殊菩薩、普賢菩薩、普眼菩薩、金剛藏菩薩、彌勒菩薩、清淨慧菩薩、大勢至菩薩、觀世音菩薩、淨業障菩薩、普覺菩薩、圓覺菩薩、賢善首菩薩。
釋迦牟尼像的後壁，有一座彩色“五十三參”海島立體群塑。群塑全部用泥塑成，有姿態各異的大小佛像一百五十尊，表現了一個生動的佛教故事，說的是善財童子南遊，曆經千辛萬苦，參拜了五十三位“善知識”（名師），終於得佛果的故事。據佛經講，善財童子是福生城“長者”之子。在他剛剛入胎的時候，家裏就有種種珍寶湧出，故名善財。他曾向文殊菩薩請教佛法，文殊菩薩指點他去南遊一百一十城，參訪五十三位“善知識”，最後遇見普賢菩薩“即身成佛”。所以佛教建築中的階梯常鋪為五十三級，比喻“五十三參，參參見佛”。這座風格獨特的立體群塑，下部是波濤起伏的大海，上麵自頂至底，塑成一座巨大的海上仙山，在斷崖峭壁、玲瓏岩穴之間，五色祥雲氤氳繚繞。大小一百五十尊佛像，參差錯落其間，大慈大悲救苦救難觀世音菩薩居中，她足踏鯨背，意態瀟灑，手執淨瓶，“法水”正汩汩湧出，傾注在奔騰的波濤間。觀音的右側就是雙手合十、身穿紅肚兜的善財童子，他在第二十七參遇到觀音，得道後成為觀音的脅侍。觀音左側為龍女，她和善財童子一起被民間稱為“金童玉女”。這座佛教雕塑在宗教藝術上具有相當高的價值。
在這座群塑中，還有一些與“五十三參”故事並無關涉的塑像。如中間最高一層那尊苦行僧，是在雪山修道還沒有成佛時的釋迦牟尼。還有如日神、月神、托塔天王、韋馱天尊、四大天王、十八羅漢等。在釋迦牟尼像下麵有一尊九華山地藏王菩薩，他是新羅王國（今朝鮮）的王子，削發為僧後，到中國的九華山修行得道。地藏王菩薩曾發許多大願，誓誌在釋迦牟尼圓寂後，彌勒菩薩成佛前的五十六億七千萬年間，度盡六道眾生，拯救諸方苦難，直到地獄撤空，自己才願升級成佛。
群塑裏還有一個“特殊”塑像，是一個手執掃帚、身黑如墨的“瘋僧”。相傳這位“瘋僧”是宋時的靈隱寺僧。當年，賣國奸賊秦檜一心想誣害嶽飛，到靈隱寺求簽，正碰上了他。“瘋僧”先曉之以大義，繼而用破掃帚照著秦檜沒頭沒腦地掃了過去。這就叫“瘋僧掃秦”，後來這個故事還被編成戲曲，搬上舞台。人們崇敬這個伸張正義的“瘋僧”，因此在群塑中也給了他一席之地。
靈隱寺石塔
石塔位於靈隱寺大雄寶殿前露台兩側，建於北宋建隆元年（960年），距今已逾千年，是靈隱寺裏曆史最久的遺物。兩石塔均為八麵九層樓閣式塔，高約12米，第一層邊長97厘米，用石料雕刻砌築而成，為仿木樓閣式塔，每層四麵辟壼門，線條和順流暢。每層有柱子、欄額、鬥栱、出簷、平座，脊飾上刻有仙人像，下刻佛頂首陀羅尼經，塔身下為一層須彌座，更下為九山八海基石，是典型的宋式建築。
藥師殿
藥師殿是第三重殿，正門上方有中國佛教協會原會長趙樸初先生所題的“藥師殿”三字，字體端莊，遒勁有力。殿中蓮台座上結跏趺坐的是藥師佛，左邊站立的是日光菩薩，手托太陽，象征著光明；右邊站立的是月光菩薩，手托月亮，象征著清涼。他們合稱為“東方三聖”。藥師佛是東方淨琉璃世界的教主，又稱為“大醫王佛”。因為他能使眾生離苦得樂，解除病痛和災害，所以人們又稱他為“消災延壽藥師佛”。
大殿兩邊十二尊塑像，頂盔貫甲，神態威武。他們是藥師佛的十二位弟子，號稱“藥童”。他們按十二個時辰輪流值班，教化眾生，保護眾生。
龍宮海藏
藥師殿後，新建“龍宮海藏”，展示靈隱寺曆代收藏的部分珍品，計有：唐開元石雕佛像，宋代魂瓶，創製於千年（相當於南宋年）前的緬甸玉佛、明代製造的具有魏晉風格的鎦金佛像，明成化青瓷、龍泉青瓷、日本花瓷、明末四大高僧蓮池大師遺物銅印，大黑天銅像、十世班禪舍利等。
“龍宮海藏”內同時展出部分經卷書畫等，如敦煌石窟藏經、雷峰塔地宮出土的《陀羅尼經》、乾隆禦書“雅宜清致”橫條、貝葉詩卷經卷、菩提樹葉《莊嚴三寶》繪畫、董其昌長卷和《金剛經》，清代九十八高齡竹禪法師所繪《濟公像》以及鄭板橋、康有為、吳昌碩、潘天壽等書法繪畫珍品等，藏品琳琅滿目，豐富多彩。
直指堂
第四重殿是直指堂。意為 “直指人心，見性成佛”。直指堂，也就相當於其他寺院的法堂。在寺院中，它主要是用於講經說法，寺院許多大型的講經法會，都是在這裏舉行。
法堂中間設講台，精美異常。上麵放有一把獅子座，是法師講經說法時的法座。尋因法師宣講如來正法，能摧破外道邪魔，猶如獅子一吼，百獸皆服，故名獅子座。座位背麵懸掛著雕刻精致的大法輪，它是法堂的主要特征。所謂法輪，是指佛陀說法，不止於一人一處，猶如車輪，輾轉相續，故名法輪。
華嚴殿
華嚴殿是最後一重殿。從華嚴殿往下觀望，五個大殿貫穿在一條中軸線上，層層遞進。華嚴殿內供奉有三尊莊嚴雄偉的佛像，中間手結毗盧印的是毗盧遮那佛，左邊手持蓮花的是大智文殊菩薩，右邊手持如意的是大行普賢菩薩。三尊佛像僅用一根珍貴巨大的楠木雕刻而成，佛像雕工精致、線條優美，為了和楠木本色相協調，隻用金箔勾畫了一些細細的花邊，給人以莊嚴肅穆之感，整組佛像高達13米。據記載，三者都是華嚴世界裏的聖人，所以又稱為“華嚴三聖”，華嚴殿即是依此而得名。
五百羅漢堂
羅漢堂內供奉的五百尊青銅羅漢像，每尊高為1.7米，底座寬1.3米，重1噸，其形象各異，表情豐富，千姿百態，栩栩如生。他們是佛陀身邊五百位常隨弟子。羅漢堂中央是一座佛教四大名山銅殿，分別供奉五台山文殊菩薩、峨眉山普賢菩薩、普陀山觀音菩薩、九華山地藏菩薩。在佛教中，此四大菩薩分別象征大智、大行、大悲、大願。
高僧輩出 名賢結緣
開山祖師慧理
慧理，西印度人，東晉鹹和元年（326年）至武林山，見飛來峰而歎曰：“此為天竺靈鷲峰一小嶺，不知何代飛來？佛在世日，多為仙靈所隱。”人鹹不信，遂建靈鷲、靈隱二刹。正所謂“天竺靈鷲錢塘落，慧理祖師開山功”。慧理常晏坐於岩中，故世人稱其處為理公岩，又名晏寂岩。
中興延壽禪師
延壽，集禪門法眼宗第三代宗師與淨土宗六祖為一身。他自幼習儒，懷有經世濟國的抱負，先後任庫吏及鎮將，悟得世事無常之理。三十歲依止令參禪師出家，後隨德紹禪師學習禪定，誦讀法華，勤修淨業。建隆元年（960年），錢忠懿王請其重創靈隱寺，靈隱之興由此故，後稱住持靈隱者以為第一代也。後延壽繼主永明道場（即淨慈寺），倡禪淨雙修，以心為宗，以悟為旨，著《宗鏡錄》、《自行錄》等書。每日行一百八十善，弟子二千餘人，時人號為慈氏下生。開寶八年（975年）十二月，延壽焚香告眾趺坐而化，得舍利無數，立塔於淨慈寺右側，賜號智覺禪師。
重興具德和尚
具德又名弘禮，會稽張氏子，幼從父兄住杭州經商，不喜章句時文，又不好經營生計，而好與黃冠道士者遊，既而悟其非，至普陀山出家。具德聽三峰宗法藏禪師說法於金粟寺，並隨他人入三峰請益，十七年後終得徹悟，為三峰法藏禪師之嫡嗣，天童密雲禪師之法孫。以臨濟正宗傳承而論，具德和尚乃為臨濟第三十二代祖。順治五年（1648年），僧友豁堂禪師請他到靈隱寺主事，以期重振靈隱寺昔日雄風，此時正值明末清初戰亂之後，靈隱呈現出一片破敗景象。一年後，具德正式入住靈隱寺。入住後，具德即率大眾躬親秉持，斬棘除壤，凡事先之，不辭勞苦。乃於庚寅年（1650年）集料興工，大殿、法堂、方丈寮、客舍、鍾鼓樓等次第而成，使幾盡頹廢之靈隱寺煥然一新。具德和尚重興靈隱寺後，常以自家獨特禪法，廣引學人，道風所被，僧俗俱攝。時人讚曰：“慈明、楊岐、戒演、妙喜之後，一人而已。”具德和尚於清康熙六年（1667年）十月十九日圓寂，年六十八，有《十會語錄》三十餘卷傳世。