然而，巨無霸指數並不能成為一種精確預測的工具。
首先，世界各國和地區之間並不存在建立在“一價定理”基礎上的實際購買力平價現實市場。從各個國家和地區的曆史情況看，即便是單個巨無霸的價格，各年在各國和地區之間也差別甚大，因此，不應以某一個國家作為標準來衡量其他國家和地區並據此得出“低估”或“高估”的簡單結論。如果因為在中國每個巨無霸售價僅1.765美元，就認為人民幣被人為地低估了，那麼，是否因為2003年4月英國每個巨無霸售價為3.14美元，而認為美元也被人為地低估了呢？
還有，如果我們按照“星巴克咖啡指數”來計算，一份星巴克大杯拿鐵咖啡在美國售3.75美元，在中國卻售28元，1美元約合7.47元人民幣，人民幣是不是又被高估了呢？
其次，實際購買力中的“購買力”不能簡單以某種產品的價格來計算，還應充分考慮到各國和地區的經濟狀況（尤其是居民家庭的收入水平）。比如，2002年中國人均GDP僅1000美元左右，而美國的人均GDP高達30000多美元，這二者是不可比的。以購買巨無霸的能力計算，中國大中城市中95%以上的家庭將月收入全部用於購買10元一個的巨無霸也僅能買到200個左右，而美國製造業的一般藍領工人每月薪酬足以購買2.71美元一個的巨無霸1000個以上。這就是為什麼在美國吃麥當勞隻是一頓快餐，而在中國大中城市中眾多家庭都將其看作有著某種享受的特殊消費（如許多家庭將上麥當勞當作是給孩子的一種獎賞）。事實上，對任何公司經營者來說，能夠抬高自己產品的價格以換得更高的利潤，總是夢寐以求之事。麥當勞的巨無霸在中國賣價10元人民幣一個的現實，是由中國居民收入和消費水平決定的。即使10元人民幣一個的價格不高，但是麥當勞也隻能在中國的一些大中城市開店，而且不但不敢深入農村，甚至也不敢涉足絕大多數中小城市。換言之，如果麥當勞的巨無霸果真敢按美國價格在中國銷售，恐怕用不了多少時日他們就門可羅雀了，收攤回國了。
另外，在中國還有眾多商品價格明顯高於美、英和歐洲國家，如小轎車、商品房、數碼相機、家用電腦等等，為什麼不用這些物價來解釋所謂的“實際購買力”理論並證明人民幣彙價被嚴重高估了呢？顯然，列舉巨無霸指數來證明人民幣幣值問題，在理論上是有缺陷的，在方法上是不科學的。其實在目前世界貿易的現實情況下，根本找不到這樣一種可以證明購買力平價理論的一種“標準商品”。
實際上，按照購買力平價理論的要求，所有商品在各個國家之間必須可以自由交換，巨無霸漢堡包顯然不能滿足這一要求。任何商品現在都不能滿足這一要求。巨無霸漢堡也隻是為了滿足當地人的飲食需求，並且，其價格也受到許多無法進行自由貿易的商品和服務的影響，例如麥當勞在各國支付的房租、勞動密集型的服務、蔬菜等等，各國的價格都是千差萬別的。
然而，巨無霸指數雖然存在著這些缺陷，但是它仍然具有它無法抹煞的特殊作用，至少它可以從另一個角度幫助人們理解不同國家生活費用的差異，並且作為購買力平價指數的一個參考。