毛澤民根據新疆的實際情況，製定了財政、銀行、金庫等方麵各種切實可行的規章製度。為了全麵實行各項規章製度，他傾注了大量心血。毛澤民創立了新疆財政監察委員會，各行政區派有財政監察組。財監會檢查，經常是突然進行，執法如山。它到財會部門封存賬目，到金庫倉庫封存票據，限期交清財務，當時稱之為財會人員“八小時交接製”。1940年《反帝戰線》第三卷介紹財政監察委員會一年來的工作時寫到：“自開始提倡八小時交接的辦法，頗引起各方的駭異。適本年七月在迪化正式舉行演習，已切實證明八小時交接，不是標奇立異，而是我們能做到的（計能在八小時接交完竣，竟達二十七個機關），並且應當做到的。迪市演習成功後，伊犁、塔城兩區均相繼自動演習，這是清廉政策在今年新的勝利。”由於製度嚴格，財會人員平時都有準備，所以能按時結算，清查工作不拖拖拉拉，很少發生財務理不清的問題。財政監察製度後來又發展為全疆性的財政審核製度，即由財政監察委員會向各部門派稽核員和總稽核，負責財政監督檢查。所有部門的一切財經手續，必須通過稽核員簽字蓋章方能生效。這樣就杜絕了財經工作中“跑、冒、滴、漏”現象，使一些貪汙、盜竊、經濟犯罪、“敗家子”，難有機會可乘。
新疆與內地不同，沒有私人銀行和錢莊，僅有一個新疆省立銀行。新省銀行1930年由官錢局改組而成，專為政府撥款服務，從未開展其他業務。盛世才上台後，銀行業務範圍有所擴大。毛澤民將省銀行改組成官商合辦的商業銀行，吸收商股和社會遊資，擴大銀行資本，使銀行在扶助農、牧、工商業的發展，調劑金融，穩定物價，改善人民生活等方麵發揮了更大的作用。1938年12月5日，新疆商業銀行籌備委員會成立，毛澤民任籌委會委員長。經過緊張有序的籌備，新疆商業銀行於1939年1月1日正式成立。商業銀行資本定額為500萬元，其中官股占60%為300萬元，商股占40%為200萬元。銀行章程規定，官股利低，商股利高，存款利高，借款息低。因此，商業銀行受到群眾的擁護，不但商界積極入股，普通群眾也有不少合夥入股者。
在毛澤民領導下，商業銀行發展很快，除迪化總行外，下屬分行由9處增加到17處，並設有13個辦事處。商業銀行營業範圍不斷擴大，有彙兌、存款、貸款、保管等，利潤大大增加。商股獲利不小，所以他們喜氣洋洋地在給股東大會賀電中說：“我們在銀行入股，不但得到了優厚的股息紅利，而且間接地參加了抗戰建新的工作。”毛澤民為天下寒士謀，建議商業銀行開展了“典當”業務，名為“公濟當”。過去新疆豪富人家多開當鋪，當息很高，一般是月息15分，有些20分，而且當期三個月，過期不贖即為“死當”，典當的物品就歸當鋪老板所有。商業銀行開設的“公濟當”，規定微利3分，當期一年，到期不贖，還可延期，取消“死當”。“公濟當”的開設，受到勞苦大眾的歡迎。