1939年11月初，朱德總司令向盛世才發出撤回新兵營的電報，由盛世才負責同國民黨交涉。
11月8日，盛世才致電國民政府軍事委員會軍令部：“徐向前部退入新疆一部，官兵約300餘人，經職省收容。頃朱總司令以前方需要甚急，擬即派員將該部悉數護送歸隊。再職省收容該部後，曾發舊式槍械，準其攜帶。並請飭朱主席準予通過，並予以便利。”
11月10日，甘肅省主席朱紹良接盛世才電後也致電軍令部，請示徐向前部官兵攜械過境或徒手過境。
11月22日，軍令部長徐永昌將此情況呈報軍事委員會委員長蔣介石，參謀總長何應欽，並提出兩條處理辦法：1.該部既由新省收容施行訓練將及兩年，且人數僅有300餘，增加前方抗戰力量有限，似可令盛世才將該部編為新省部隊中，不必遠道跋涉遣送歸隊；2.擬準其將該部護送歸還十八集團軍，但為免除沿途誤會起見，準予徒手過境，所有槍械仍歸還新省，並令朱長官檢查護送。
蔣介石批準了第一個方案，並令盛世才執行。
11月30日，盛世才致電蔣介石，請求將徐向前官兵遣送歸隊，盛還讓他駐重慶代表張元夫向蔣介石麵陳徐向前部回延理由。
抗日戰爭時期，新疆是最重要的國際交通線，蘇聯大批援華物資經新疆源源不斷地運往抗戰前線，蔣介石擔心如不同意盛世才的請求會引起盛的反感，於國民黨不利，遂電令朱紹良：徐向前留新官兵，業經準予派員帶車護送至延安，似不可再阻留，以免晉庸（盛世才字晉庸）誤會，請準其通過。
中共中央指示陳潭秋，新兵營總支隊總隊長級幹部乘飛機，其餘同誌乘汽車返回延安。因國共兩黨軍隊摩擦得很厲害，怕路上遇到麻煩，要有得力幹部帶隊。
陳潭秋根據黨中央指示，決定除航空隊、獸醫班留下繼續學習外，新兵營官兵329名，由曾玉良、喻新華等人帶隊，於1940年1月11日乘汽車離開迪化回延安，盛世才派督署參議丁寶珍護送。蔣介石本不準帶武器，經盛世才的交涉，新兵營官兵帶步槍30支，子彈1.5萬發，手槍2支，子彈200發；丁寶珍和衛士車隊司機帶手槍3支，步槍14支，連珠槍3支，七九馬槍2支；另外帶迭克鐵裏瓦式機槍4挺，子彈4萬發，作為送給朱德、彭德懷的禮物。
饒子健、姚運良、宋承誌等總支隊領導人及警衛人員和病員共31人，於1940年2月2日乘飛機離開迪化回延安。當時還留下會開汽車的陳福海、趙內瑣等6人，準備繼續學坦克。1940年7月陳福海等21人，由盛世才派龔副官送回延安。
肖顯清——
1939年12月，天氣格外的寒冷，我們平靜的生活發生了變化。過去每個月隻放二至四場電影，而一進12月則幾乎每兩三天就放一場，飯也吃得非常好。說是過年，未免太早，問首長是怎麼回事，首長也不講，好像有什麼秘密，從表情上看很沉重。12月10日，又讓我們把9月剛發的棉衣換成“推呢坎”（音）的新棉衣，又發新棉被、皮鞋、氈靴。到了20日左右，大家的疑問解開了。
這天，召開了回延安的動員大會。陳潭秋同誌動員說：因為國際國內的形勢發生了新的變化，黨中央決定你們回延安。由於前線需要戰鬥骨幹，你們大部分同誌要到抗日前線去！（大家鼓掌）你們來迪化兩年零八個月，在中共中央的指示下，在陳雲、鄧發同誌的領導下，完成了學習任務，成績優良。蘇聯顧問對你們的學習很滿意，我已向黨中央作了報告。我來得晚一些，對同誌們幫助不夠，請多多批評。
我們聽了他的講話，很是感動。接著，他又講了幾條規定：1.為了保密，你們在學習中的筆記一律不準個人帶走，大家包好，由我們負責轉送延安；2.你們的行李每人不能超過30公斤，多的東西交到我們辦事處；3.關於你們的安全問題，延安、莫斯科方麵，迪化、重慶方麵都有了協定，這是有保證的，請大家放心。蘇聯要運一批抗日的物資到重慶，如有人問你們，就說是護送物資的。這個車隊有50餘輛汽車，開車的司機都是紅軍戰士，100人左右，每輛車上都有一挺機槍。路上出了問題，你們不要出麵，有盛世才派的丁參議帶著幾個人辦外交。我們內部派朱光同誌出麵，他是東北抗聯的，從蘇聯學習歸來的黨員。陳潭秋同誌再三講，最不放心的是河西走廊這段路，各兵站的勤雜人員中，有西路軍的傷員，很可能認出自己的戰友。為了這次行動的勝利，你們千萬不能去認。你們不是學了日語嗎，在生活上講日語。我想，戰友們以後會理解的。4.我們再三研究，請示了中共中央，還要留下一部分同誌在迪化工作，希望被留下的同誌要服從組織決定，服從全局的需要。
陳代表接著抒發了自己的感情。他說，要不是工作需要，我也和大家一起回延安。我們朝夕相處雖時間不長，可同誌們的學習、訓練和高貴品德給我留下了深刻的印象。我記得今年9月間，支隊首長向我彙報學習情況時，說還有十個同誌沒有入黨，主要原因是學習上差一點，其他方麵都是好的。我就講，他們經過長征，三次過草地，特別是在河西走廊苦戰半年，能走到新疆，就是很了不起了，是很好的同誌了。一席話講得我們心裏熱乎乎的。我們回想起在迪化的日日夜夜，為與陳代表分離而難過，為學習而依戀，為能重返前線而無比高興。