2.平定準噶爾之亂，授權噶倫聯合執政。1717年，蒙古準噶爾部侵擾西藏，洗劫拉薩，殺拉藏汗，結束了蒙古和碩特部在西藏的統治（1642—1717）。為了安定西藏，康熙帝從1718年到1720年，先後兩次派兵入藏，平定準噶爾部的入藏之亂。在此期間，西藏人民也在拉藏汗的官員康濟鼐、頗羅鼐的率領下，從阿裏、日喀則向拉薩進軍，從西部配合清軍夾擊準噶爾部。阿爾布巴也在拉薩以東的工布地區抵抗準噶爾軍隊。由於清軍和西藏的地方軍民的共同戰鬥，到1720年8月，占據西藏的準噶爾部即被全部驅逐。在平定準噶爾部侵擾西藏的同時，清朝中央還把達賴七世格桑嘉措（1707—1757）從青海塔爾寺護送到拉薩，並於1720年9月15日在布達拉宮舉行了坐床典禮。1721年，清朝中央決定廢除在西藏地方政權中總攬大權的第巴職位，設立四名噶倫，共同管理西藏地方的行政事務。一名是原任西藏阿裏地區的總管、拉藏汗時的官員康濟鼐，他在反抗準噶爾部的鬥爭中功勞最大，清朝中央任命他為首席噶倫；二是工布地區的貴族阿爾布巴；三是拉薩地區的貴族隆布鼐；四是達賴七世的強佐（司庫或總管）紮爾鼐。1723年（雍正元年），清朝中央又提升江孜地區貴族頗羅鼐（1689—1747）為噶倫，使噶倫增至五人。同時，為了安定西藏的社會秩序，保證新建的地方政權行使職權，清朝政府還在西藏留駐軍隊4000人。
噶倫一職，原來就有。但隻是較高級的行政官員。噶倫之上，還有拉藏汗與第巴。清廷提高噶倫地位，令其直接掌管西藏地方政權。作為朝廷命官，皇帝與西藏的關係比原來隔著蒙古汗更加密切了一步。
3.設立駐藏大臣，劃定藏區政圖。噶倫聯合執政剛剛實行了6年，1727年（雍正五年），西藏統治階級內部即發生內訌。代表前藏地方勢力的噶倫阿爾布巴聯合隆布鼐、紮爾鼐，殺死了代表後藏勢力的首席噶倫康濟鼐。康濟鼐的親信頗羅鼐自日喀則起兵，於1728年攻下拉薩，逮捕了阿爾布巴等三噶倫，等待清廷處理。清廷完全支持內訌事件的得勝者頗羅鼐，以叛逆罪將阿爾布巴等三人處死。
清廷在平息了這次內訌事件之後，對西藏政務進行重要改革：
A。鑒於西藏貴族聯合執政易起紛爭的現實，清朝決定委派自平定準噶爾之亂以來，一貫效忠於清廷的頗羅鼐總理西藏地方政務；
B。從1727年開始，清朝中央正式往西藏派遣駐藏大臣正副二人，任期三年，第一任是副都統馬喇和內閣學士僧格。留川陝兵2000人分駐前後藏，歸駐藏大臣指揮；C。1728年將康定、理塘、巴塘等地劃歸四川管轄；將中甸、阿墩子、維西等地劃歸雲南管轄；昌都以外各土司仍歸西藏管轄；將後藏的拉孜、昂仁、彭錯林三個宗（縣）贈給班禪直接管轄。