參謀長劉亞樓，副參謀長伍修權、曹祥仁。
政治部主任譚政，副主任周桓。
後勤部部長李富春（兼）。
東北軍區之下分為十二個軍區：
安東軍區司令員程世才，政委江華，副司令員沙克。
遼寧軍區司令員張學思，政委白堅，副司令員解方、趙傑，副政委劉惠農。
遼南軍區司令員陳奇涵，政委張秀山，副司令員邊章伍、副政委林一山。
吉林軍區司令員周保中，政委陳正人，副政委唐天際。
遼吉軍區司令員聶鶴亭，政委陶鑄，副司令員高鵬、蔡斯烈，副政委彭嘉慶。
龍江軍區司令員葉長庚，政委王鶴壽，副司令員關慶寰。
嫩江軍區司令員朱滌新，政委劉錫五，副司令員趙承金。
鬆江軍區司令員陳光，政委張策，副司令員李壽軒。
合江軍區政委洛甫（張聞天），副司令員李荊璞、楊梅生，副政委張啟龍。
牡丹江軍區（1948年7月撤銷）政委何偉，副司令員田鬆。
內蒙古軍區司令員兼政委雲澤（烏蘭夫）。
冀察熱遼軍區司令員程子華，政委黃克誠，副司令員李運昌、副政委黃火青。
在冀察熱遼軍區之下，又有三個軍區：
熱河、冀熱察、冀東。
東北野戰軍與東北軍區是一個領導機關，但由於軍區和野戰軍在有些工作上仍有分工，所以領導幹部的名單上稍有不同。在野戰軍中林彪隻擔任司令員，政委由羅榮桓擔任（這就是人們一般又把東北野戰軍或日後的第四野戰軍稱為“林羅大軍”的由來），參謀長劉亞樓，政治部主任譚政，不設副司令員、副政委、副參謀長、政治部副主任。不同的是野戰軍的後勤部長兼政委是鍾赤兵。到大決戰開始之前的1948年8月14日，根據中央軍委的指示，為了集中力量打大仗，東北人民解放軍進行了一次上層的整編，將野戰軍總部和軍區總部的司令部、政治部、後勤部這三大部分開，成了兩個係列。從此，林彪、羅榮桓和劉亞樓就全部心思在前方打仗，後方軍區機關的工作都交給高崗、陳雲、李富春等同誌負責。
東北野戰軍所屬野戰部隊的編製序列有：
前方第一指揮所（後改稱第一兵團，東北野戰軍的前方指揮所和兵團與後來四野的兵團不同，其下並不直屬固定的幾個縱隊，而是根據戰局的需要，由總部決定在一定時期或某一戰役中，指揮哪些部隊）司令員蕭勁光（兼），政委蕭華，副司令員陳伯鈞，副政委唐天際，參謀長解方。
前方第二指揮所（後改稱第二兵團）司令員程子華（兼），政委黃克誠（兼），副司令員彭明治，參謀長黃誌勇。
東北野戰軍這時共有12個主力縱隊和一些其他部隊：
一縱司令員李天佑，政委梁必業，副司令員曹裏懷。
一縱下轄三個師：一師師長江擁輝，政委吳岱；二師師長賀東生，政委劉興元；三師師長彭景文，政委劉賢權。
二縱司令員劉震，政委吳法憲，副司令員吳信泉。
二縱下轄三個師：四師師長陳金玉，政委李雪三；五師師長吳國章，政委賀大增；六師師長張天雲，政委石瑛。
三縱司令員韓先楚，政委羅舜初，副政委劉西元。
三縱下轄三個師：七師師長鄧嶽，政委李伯秋；八師師長左葉，政委劉光濤；九師師長徐國夫，政委譚開雲。
四縱司令員吳克華，政委莫文驊，副司令員胡奇才，副政委歐陽文。
四縱下轄三個師：十師師長蔡正國，政委葛燕章；十一師師長周光，政委李丙令；十二師師長江燮元，政委張秀山。
五縱司令員萬毅，政委劉興元，副司令員吳瑞林，副政委唐凱。
五縱下轄三個師：十三師師長徐國夫，政委丁國鈺；十四師師長彭龍飛，政委譚文邦；十五師師長胡繼成，政委何善遠。
六縱司令員黃永勝，政委賴傳珠，副司令員李作鵬、楊國夫。
六縱下轄三個師：十六師師長王東保，政委張池明；十七師師長龍書金，政委徐斌洲；十八師師長王兆湘，政委陳德。
七縱司令員鄧華，政委吳富善，副司令員曾克林。
七縱下轄三個師：十九師師長徐紹華，政委鄧東哲；二十師師長劉述剛，政委劉永源；二十一師師長李化民，政委朱民親。
八縱司令員段蘇權，政委邱會作，副司令員張天雲，副政委王逸群。
八縱下轄三個師：二十二師師長吳烈，政委陳仁麒；二十三師師長張德發，政委謝家祥；二十四師師長丁盛，政委韋祖珍。
九縱司令員詹才芳，政委李中權。
九縱下轄三個師：二十五師師長曾雍雅，政委徐光華；二十六師師長蕭全夫，政委李振聲；二十七師師長任昌輝，政委王文。
十縱司令員梁興初，政委周赤萍。
十縱下轄三個師：二十八師師長賀慶積，政委晏福生；二十九師師長劉轉連，政委卓雄；三十師師長方強，政委孔石泉。
十一縱司令員賀晉年，政委陳仁麒，副司令員周仁傑。
十一縱下轄三個師：三十一師師長歐致富，政委謝鏜忠；三十二師師長李光輝，政委劉祿長；三十三師師長周仁傑，政委鍾文法。