改革與管理本年度醫院決定試行科室成本核算。機構人事製度、後勤改革同樣是醫療機構配套改革的重要內容。成立了醫院機構改革領導小組，在對多家醫院進行考察和調研的基礎上，形成了醫院機構和人事製度改革的目標、思路和具體方案。還加大了審計力度，明確了關於醫療設備采購管理的有關規定，加強了對藥品和試劑采購的監控。
許多處室不斷地強化科學管理，增強服務意識，提高工作效率，如信息處解決了計算機2000年問題，完成了門診收費和住院病人管理係統服務器的係統升級和全院155台單機的檢測；外事處進一步健全了有關外事管理的規章製度。
精神文明建設醫院通過開展“創建文明行業，實現規範化服務達標”活動，實行了一係列方便患者就醫的措施，提高了醫療質量和服務水平。為了慶祝建國50周年，喜迎澳門回歸祖國，本院舉辦了首屆文化藝術節。工會配合醫院中心工作，積極開展各種文體活動，豐富職工的文化生活。堅持對團員青年進行政治思想教育，弘揚愛國主義精神。認真做好社會治安綜合治理工作。積極參加社會公益活動。
1999年，醫院的計劃生育、無償獻血、綠化美化等工作都達到了文明單位的標準和要求。獲中央國家機關精神文明單位和首都精神文明單位稱號。共有95名職工無償獻血。王建業任東城區第十二屆人大代表。
中日友好醫院
事業概況開放病床1300張，其中中醫病床400張。職工2799人，其中衛生技術人員2299人，包括副主任醫師以上（含相當職稱，下同）389人，主治醫師596人，醫師1314人，護士810人。
醫療工作門診663629人次，其中外籍人員和華僑24728人次，日門診量2379人次。急診88324人次，急診搶救1145人次，搶救成功率舫.81%。新生兒死亡率12.媽圍產兒死亡率8.2%，孕產婦死亡率10%。
出院患者18810人次，床位使用率91.1%，床位周轉次數14.5，治愈好轉率弘.18%，入出院診斷符合率99.00%，人院7日確診率99.48%。手術12536例，其中門診手術5697例，住院手術683。中日友好醫院是國內外重大會議、活動的保健醫院之一。1999年，醫院辦理高幹保健419人，參加各種會議、活動保健25次，共派出醫療保健組70餘人次，圓滿地完成了各會議（包括人代會、政協會）及活動的醫療保健任務；根據中組部和衛生部保健局的安排，為在京享受住院醫療照顧專家（副部級）205人進行了體檢。
為支援“老少邊窮”地區醫療事業的發展，擴大醫院影響，開展了遠程醫療服務，目前已與全國8個地區開通了遠程醫療會診工程（最遠為新疆庫爾勒地區八1999年共組織會診29次，取得了良好的社會效益。醫院在全國各地建立11個血液淨化分部，並與12家各級醫療機構建立了對口支援協作關係。
醫院將醫療工作重點放在了抓基礎、抓規範上，進一步完善24小時住院醫師負責製，嚴格執行三級查房製度，先後出台了關於醫師值班交接班的暫行規定和關於進一步加強疑難病例討論會診的暫行規定。進一步加強了院長行政查房，全麵了解臨床醫教研情況，對一些急需解決的問題通過現場辦公及時解決，提高了工作效率。
在加強重點學科建設方麵，注重發揮中西醫結合優勢，形成了以中西醫結合治療心腦血管疾病、中西醫結合治療腫瘤為代表的中西醫結合醫療特色。進一步完善了“國際醫療部”、“友好血液淨化中心”、“口腔中心”等多樣化特需醫療服務，以滿足廣大患者不同層次的醫療保健需求，取得了較好的社會效益和經濟效益。
成立了深化醫院改革領導小組，下設5個專題工作組。根據衛生部《關於深化城鎮醫療機構改革的若幹意見（草案）》，本著“思想要積極，步驟要穩妥，措施要得力，效果要明顯”的原則，開展調查研究，召開各種座談會40餘次，400餘人次參加，發放調查問卷900份，並先後到北京8所大型綜合性醫院和上海、武漢、山東、天津等地14所醫院以及香港進行調研考察，形成了較係統較全麵的中日友好醫院深化改革整體方案（草案），為醫院的改革與發展奠定了堅實的基礎。
醫院成立了信息化建設專題工作組，完成了計算機應用係統需求、計算機網絡係統需求和計算機應用標準等一係列基礎性數據、資料。同時，針對問題，製定了應急方案，保證了醫院計算機2000年問題的平穩過渡，受到衛生部及北京市衛生局的高度評價。
護理工作進一步加強精神文明及行風建設，提高護士服務意識和護理服務質量。護理部將評選“文明護士站”、“精神文明窗口”工作與護理質量控製工作相結合，采取單項否決，全年共評出13個“文明護士站”、2個“精神文明窗口”。