教學工作：實施導師考評結果與導師招生掛鉤；製訂導師招生遴選具體量化標準；繼續推進研究生培養過程信息化、規範化管理，建立了研究生信息網絡係統。本院有博士學位授權專業9個，博士生導師27人；碩士學位授權專業17個，碩士生導師52人。在讀博士生52人、碩士生127人。本科生196人，其中五年製23人、七年製173人。本科七年製26名學生分別參加了執業醫師技能考核和理論考核，通過率100％，獲得執業醫師資格證書。開展了專科醫師、住院醫師臨床思維培訓。
全院繼續醫學教育參加率99％，達標率99％。組織、協辦國家級繼續醫學教育項目學習班20個、市級學習班3個、區縣級學習班8個。組織申報2010年國家級繼續醫學教育項目9個、市級3個、區縣級11個。接收進修300人，其中副高級職稱56人、主治醫師127人、醫師32人、護師及護師以上52人、護士25人、其他8人。
信息化建設：建立了異地數據備份係統；引進了基線網絡監控係統，隨時查詢和追蹤網絡中出現的問題；完成神經內科新電子病曆係統的升級、電子住院證的試點工作，建立了病曆書寫質量控製機製；完成神經外科垂體瘤手術全過程的流程化管理係統、圍手術期抗菌素的管理係統，建立衛生材料的新管理流程，實現了從采購部到臨床科室的全程追蹤管理；完成門診醫保實時刷卡結算係統的整體改造。
國內外學術交流：年內，派出13批13人次分赴美國、加拿大、瑞士、意大利等國家和中國香港地區進行學術交流、培訓考察。
後勤工作：全年完成48項基礎維修改造工程。完善應急預案，開展實戰演練，特別是自備發電機帶載運行檢測，提高了醫院應急救援處置能力。防控甲流：成立防控工作領導小組、專家組；建立了完善的流感患者預檢、甄別、信息上報、救治的流程；完善了對甲流危重症患者的搶救流程。自4月30日～12月31日，共接診患者7860例次，篩查2548例次，其中陽性309例次，甄別治療4868例次，病房收治40例次。
國慶醫療保障：為國慶慶典第二分指揮部崇文方隊隊員及保障人員3000餘人接種了甲流疫苗。派出7人參加天安門慶典醫療保障工作。本院醫療站點的特點是：地處廣場中央，保障範圍廣，被保障人員數萬人；進駐早，撤出晚，保障時間長（國慶閱兵和晚會均要參加）；除了接診站點周圍的患者外還要負責廣場內的現場救治。8月29日至9月30日，醫療隊員共參加4次演練。現場出診2次，接診救治114人。9月30日21時～10月2日1時，醫療隊員在天安門廣場堅守近30個小時，出診1次，接診27人。醫院派出9人的觀禮台醫療保障小組，承擔人民大會堂北側臨時看台5200名觀禮嘉賓的醫療保障任務。此外，還派出12人承擔了國慶天壇公園遊園的醫療保障任務。10月1日～3日，在天壇公園處理外傷、發熱等患者9人。
本院名譽院長王忠誠院士作為2008年度國家最高科學技術獎獲得者在天安門城樓上參加了國慶慶典觀禮。黨委書記高曉蘭作為全國先進基層黨組織代表在天安門東側觀禮台參加了國慶觀禮。神經外科中心副主任張俊廷作為第二屆首都十大健康衛士代表在天安門西側觀禮台參加了國慶觀禮。神經外科中心五病區主任趙元立和主任醫師隋大立作為民主黨派代表在人民大會堂北側臨時觀禮台參加了國慶觀禮。