8月
市衛生局參與2009～2011年本市深化醫藥衛生體製改革方案的製訂，並結合擬定中的北京醫改方案牽頭進行了資金需求測算。
落實防控甲流籌建潮白河骨傷科備用醫院資金74827587元。
落實國慶60周年醫療衛生保障經費4342296元，主要用於國慶閱兵公共衛生保障、環境整治、後勤保障急救、遊園活動後勤服務保障工作。
市衛生局決定開展北京市醫療質量萬裏行——血液安全督導檢查，檢查範圍為本市一般血站及各用血資質的醫院輸血科（血庫）。
市衛生局組織專家對本年度“十百千”衛生人才進行評審。評審出“十”層次資助人員10人、“百”層次資助人員47人。
8～9月
市衛生局委托北京預防醫學會舉辦自然疫源性疾病防控知識師資培訓班，全市各三級醫院及各區縣疾控中心的相關專業人員98人參加。
9月
1日
市衛生局舉行鼠疫防控桌麵演練。民航華北局、首都機場醫院、北京鐵路局衛生處領導與市衛生局副局長趙春惠、疾控處、應急辦、醫政處、科教處領導，以及市疾控中心的領導、專家和有關人員21人參加。
市衛生局對18個區縣疾控中心進行鼠疫防控應急拉練。
市衛生局召開國慶實驗室生物安全工作布置會，各區縣、各有關單位領導及相關工作負責人160餘人參加。市衛生局召開國慶安全保衛工作部署會，區縣衛生局、三級醫院、局直屬單位主管安全工作的領導90餘人參加。
1～7日
市愛衛會組織國家及本市有關專業部門的專家和工作人員，分4個檢查組對19個區縣和地區的市容環境衛生、病媒生物控製、單位居民區衛生和公共場所禁止吸煙情況進行了綜合檢查。
3日
市衛生局召開北京市醫療機構國慶期間藥品和醫療器械安全使用工作會。
3～4日
市衛生局召開社區衛生中醫藥特色診區建設項目評審工作會。選擇20個單位作為建設單位，建設周期2年。
市衛生局召開全市二級以上醫療機構疾病控製工作會。
3～7日
市衛生局組織協調東城區、朝陽區衛生局，完成第十六屆北京國際圖書博覽會的公共衛生保障。
4日
市衛生局組織協調西城區衛生局，完成首長教育視察活動的公共衛生保障。
副市長丁向陽、中國醫藥衛生事業發展基金會理事長王彥峰、市政府副秘書長魯勇，以及市衛生局、財政局、發展改革委、人力社保局、中醫局、藥監局等部門有關領導，聽取了中醫藥專項課題“防治甲型H1N1流感中藥篩選及評價研究”和“甲型H1N1流感抗病毒與中藥治療的多中心、前瞻、隨機對照研究”的進展彙報。
市衛生局醫政處召開精神科、兒科對口支援工作階段總結會。
市衛生局召開第二批深入學習實踐科學發展觀活動總結大會。會議由局黨組副書記張秀芳主持，黨組書記、局長方來英作總結講話。市衛生局領導班子成員、局級領導，各直屬單位領導班子成員、工會主席、黨辦主任，市衛生局、中醫局機關各處處長，局機關所屬中心正、副主任，市衛生局學習實踐活動辦公室和學習實踐活動指導檢查組成員200餘人參加會議。
市衛生局通報了近期首都防治甲流的情況。
5日
市衛生局召開首都衛生人才隊伍建設中長期發展規劃研討會。
6日
“人口衛生”方陣總隊參加在天安門廣場群眾遊行第二次實地演練。
7～18日
市中醫局舉辦第二、三期社區中醫適宜技術培訓，12個區縣社區衛生服務中醫藥工作者參加。
8～9日
在醫療機構自查的基礎上，將18個區縣劃分為9個組，分別組建藥品和醫療器械專家組，對全市54家各級各類醫療機構開展了重點抽查。檢查組人員現場反饋了檢查結果，提出了整改意見和整改期限。
8～10日
市衛生局組織協調海澱區、朝陽區衛生局，完成太平洋地區高級軍官後勤論壇第三十八屆研討會的公共衛生保障。
9日
市繼續醫學教育委員會對2010年繼續醫學教育項目進行專家評審。北京地區中央、部隊、高校、市屬、區屬等93家醫院共申報國家級繼續醫學教育項目748項、市級繼續醫學教育項目448項。召開市衛生局、中醫局機構改革動員部署大會，市衛生局黨組書記、局長方來英，黨組副書記張秀芳，中醫局局長趙靜，駐局紀檢組組長何群等出席。
9～11日
市衛生局舉辦內審培訓班，36家直屬單位分管內審工作的領導和內審人員參加。副局長郭積勇到會並講話。
9日、12日
市中醫局兩次召開北京市防治甲流中醫藥專家組會議。局長趙靜主持會議。
10日
市衛生局召開全市甲流病毒檢測工作會。18個區縣衛生局疾控科負責人和30個甲流病毒檢測單位實驗室負責人參加了會議。
11日
市疾控中心再次召開北京市甲流病毒核酸檢測技術培訓會，19家醫院、11個區縣疾控中心90人參加。
市衛生局組織係統內離退休幹部及工作人員66人參加市老幹部局舉辦的“祖國在我心中”合唱比賽。
市衛生局係統舉行“我和我的祖國”歌詠比賽。
11～25日
市衛生局舉辦北京地區專科醫師培訓管理幹部學習班和北京地區專科醫師培訓基地師資培訓班4期。中央、部隊、高校、市屬、企業及區縣100餘家醫療衛生單位的教育管理幹部和全科培訓基地、社區衛生服務中心負責人近400人參加了培訓。
12日
首都預防艾滋病宣傳誌願者“1＋1”十進行動之“相互關愛，共享生命”9月主題活動在18個區縣部分商場舉行。
中央政治局委員、中央書記處書記、中組部部長李源潮，常務副部長沈躍躍，市衛生局黨組書記、局長方來英和黨組副書記張秀芳到北京積水潭醫院幹部病房，看望老紅軍彭幼華。
12～13日
市衛生局黨組副書記張秀芳、局老幹部處處長柳淑華和各單位黨政領導走訪慰問了本係統老紅軍彭幼華等7人。
12～14日
市愛衛會舉辦社區“健康風采”大賽決賽。
12～15日
市衛生局組織協調朝陽區、東城區、順義區衛生局，完成第十五屆世界航線發展論壇的公共衛生保障。
13日
市衛生局對參加北京同仁醫院內部競爭選拔副院長的7人進行了麵試。
14日
市軍轉辦和市衛生局聯合舉辦2009年北京市衛生局係統軍隊轉業幹部安置選擇會。
國家食品藥品監督管理局局長邵明立、副局長邊振甲帶隊調研、檢查了北京市國慶餐飲服務食品安全保障工作。副市長丁向陽，市衛生局局長方來英、副局長於魯明，市政府食品安全監督協調辦公室副主任王建華，東城區和海澱區政府及區衛生局領導陪同檢查。