此刻的陳馮富珍，不僅麵對SARS的瘋狂挑戰，還在默默承受著另一種更令她痛苦的壓力。
2003年年初，SARS疫情在香港的突然出現，讓香港衛生署措手不及，在防治方麵顯得有些被動。這時，香港公眾和一些政府議員對衛生署產生了很多負麵的意見，認為相關部門“忽視市民的健康、沒有盡到應有的責任”，甚至認為“對港民安危置若罔聞、無動於衷”。正是在這種情況下，世界衛生組織成立了一個“國際審查小組”前往香港調查、了解情況。
當時，作為這個小組成員之一的著名呼吸疾病治療專家鍾南山院士，開始頻繁往來於香港與廣州，並經常與陳馮富珍女士一起參加各種會議。
“最後調查的結論對她的工作是肯定的。當時麵對眾多的指責、質疑，她心裏並非沒有委屈，但我從未見過她表露出一絲的反感和不耐煩。她總是盡量地解釋、盡量地做溝通工作。她的解釋非常誠懇和實事求是。”鍾院士回憶。其實，SARS於2002年冬季最先在廣東出現的時候，陳馮富珍已對此高度關注，曾積極地與廣東省以及中央政府進行過溝通。
在接受調查期間，陳馮富珍一點也沒有停止防治SARS的工作，表現出的堅強和勇氣，令鍾南山院士十分欽佩：“她很寬容，有很強的協調能力。麵對不同意見時，她從不會輕意否定或是忽略，而是善於以一種積極的態度，從不同的意見中吸取、綜合並形成有價值的思路和方法。”
很少有人知道，當時已經55歲的陳馮富珍是香港特區政府的合約雇員，SARS肆虐時，她已經退休，堅守崗位和勤奮工作，在很大程度上是義務的，是強烈的責任心，使她在麵臨危局時選擇了留下，並承擔一切。而且，作為一個妻子和母親，除了每天公布疫情，宣傳對抗SARS的知識外，每天早出晚歸的她，還要抽空去買消毒水，回到家裏稀釋消毒，盡到一個家庭主婦的責任。
正是在陳馮富珍和同事們的不懈努力下，SARS的魔影終於被一點點地驅逐出了香港。
據鍾南山院士介紹，對急性傳染病的防治是陳馮富珍的專長，SARS、禽流感這類疾病的防治都屬於她研究的領域。
香港衛生署的同事對陳馮富珍的評價是：“她處理每一件事都很有魄力。”
一位與陳馮富珍共事近20年的同事，至今還記得：有一年香港爆發霍亂，調查顯示，在飼養海產的魚缸中發現霍亂菌。陳醫生為了更清楚掌握實情，早上6時，親自跑到海產批發碼頭，目睹供應商抽取汙染海水飼養海產，確定病人是進食了受海水汙染的海產品而生病。
“陳醫生非常明白要有效控製傳染病，必須爭取第一時間進行調查。有一次，一位同事向她請教為何假日都要隨時候命。陳醫生很有耐性地花了一個小時向他解釋，病菌是不會放假的，我們身負重任，要隨時準備作戰。”這位同事回憶說。
在麵對禽流感過後產生的市民心理恐慌時，為樹立港人的信心，她帶頭吃雞。正是陳馮富珍在處理禽流感危機、非典危機時的出色表現，使她獲得了國際社會和世衛組織的青睞。
妻賢夫助
與其他從政的女性相比，2006年59歲的陳馮富珍身上表現出來的溫婉慈祥的特質尤為明顯，頗有“明星”風範。她非常注重自己的儀表，她喜歡化妝，每次會見客人，從衣著到儀態，都會精心設計。如果有報紙刊登了她的靚照，她還會囑咐同事聯絡報社買下相片以作留念。
家庭中的陳馮富珍更加溫柔。2005年接受《紐約時報》專訪時，她不忘強調：“作為一個傳統的中國女人，我決定追隨我的丈夫。”丈夫是陳馮富珍生活的重心。早年，她陪丈夫到加拿大讀書，就是因為害怕兩人關係就此終結。