正文 基於HPLC—Q—TOF_MS的代謝組學方法用於解毒祛瘀滋陰方對係統性紅斑狼瘡幹預作用的研究(2 / 3)

1、3 血清樣品分析在室溫下解凍血清樣品,取100 μL置於離心管中,加入400 μL甲醇沉澱蛋白,渦旋30 s,在靜置10 min後,采用13 000 r·min-1, 10 min,4 ℃低溫高速離心,取300 μL上清液用去離子水1∶1稀釋,稀釋後的600 μL血清樣品用0、22 μm尼龍膜過濾,棄去初始濾液,用於液相質譜分析。從4個實驗組樣本中抽取等量的血清混合,製成質量控製品,質量控製品的前處理方法與樣品相同。

色譜條件:流動相A為0、1%甲酸水溶液,B為0、1%甲酸乙腈溶液,采用梯度洗脫(0~2 min,20%B;2~12 min,20%~65%B;12~24 min,65%~85%B;24~26 min,85%~98%B;26~28 min,98%B),後運行時間為5 min。設置柱溫箱溫度為35 ℃,自動進樣器溫度為5 ℃。

質譜條件:分別使用ESI正、負離子模式采集數據。掃描範圍m/z 50~1 000,幹燥氣為N2,幹燥氣溫度為350 ℃,正、負離子模式毛細管電壓分別為4 000, 3 500 V,碎裂電壓為180 V,錐孔電壓為60 V,霧化器壓力為275、8 kPa。使用Centroid模式保存質譜數據,數據采集速率為2 spectrum·s-1。數據采集過程中參比液實時監測校準質譜係統。二級質譜數據采集時,碰撞能分別設置為20 eV,二級質譜采集速率為2 spectrum·s-1。

1、4 數據處理使用Mass Hunter Workstation(version B、03、01 Qualitative Analysis, Agilent)提取代謝物信息,利用分子特征提取(molecular feature extraction, MFE)算法提取總離子流圖(total ion current,TIC)中特征離子。提取離子豐度閾值為200,基峰豐度閾值為1 000,正、負離子模式加和離子種類分別為[M+H]+和[M-H]-,提取單電荷離子。提取後代謝物信息包括保留時間,精確質量數和豐度,將提取後的數據轉存為、CEF格式文件,利用MPP軟件進行數據預處理。使用保留時間和精確質量數對離子峰進行對齊,數據對齊時保留時間偏差設置為0、15 min,質量數偏差為10,然後對離子響應值進行歸一化處理,利用歸一化後的離子豐度中位數進行數據的中心化,再篩選在每組80%樣本中能被檢測的離子建立代謝物數據矩陣。合並正負離子模式下所采集的代謝物離子,利用SIMCA-P中OPLS進行數據分型,並根據載荷圖得到潛在的差異代謝物。差異代謝物使用精確的質量數和二級質譜圖,利用METLIN[7] (http://metlin、scripps、edu/),KEGG(http://www、genome、jp/kegg/),Massbank (http://www、massbank、jp/index、 html)和HMDB (http://www、hmdb、ca/)等數據庫鑒定代謝標記物,分析代謝通路。

2 結果與討論