此外，嚴複還很重視婦女教育。他對當時上海徑正女學的創辦大為讚賞。認為這是中國婦女擺脫封建禮教束縛的開始，也是中國婦女自強的開始。他從救亡圖存的目的出發，認為婦女自強“為國致至深之根本”。他還主張婦女應和男子一樣，在女學堂裏既要讀書，又要參加社會活動，如果不參加社會活動，創辦的女學堂就和封建私塾沒什麼區別，因而也就無意義了。顯然，他是將婦女置於整個社會變革，特別是婦女自身解放的前提下來考慮的，故十分強調參加社會活動對女學堂學生的重要意義，這也是他在婦女教育方麵高出一般人之處。
嚴複提倡西學，反對泮務派“中學為體、西學為用”的觀點。他曾多次將中學與西學作比較：“中國最重三綱，而西人首言平等；中國親親，而西人尚賢；中國以孝治天下，而西人以公治天下；中國尊主，而西人隆民……其於為學也，中國誇多識，而西人恃人力。總之，西學“於學術則黜偽而崇真。”他還指出“中國之人好古而忽今，西之人力今以勝古。”“古之必敝。”所以他認為就是堯、舜、孔子生在今天的話，也要向西方學習的。要救中國必須學西學和西洋“格致”：“益非西學，洋文無以為耳目，而舍格之事，則僅得其皮毛。”他認為“中學有中學之體用，西學有西學之體用，分之則兩立，合之則兩止”。他認為應做到“體用一致”，“本來一致”要從政治製度上進行改革，提出“以自由為體，以民主為和”的資產階段教育方針。
他從“體用一致”的觀點出發，具體規定了所設想的學校體係中各階段的教學內容和教學方法。他認為在小學階段，教育目的是使兒童能“為條達妥適之文”，“而於經義史事亦粗通曉，”因則“舊學功課，十當其九”，並以明白易懂的文字翻譯西學中“最淺最實之普學”為輔助讀物。在教學方法上，多采用講解，減少記誦功夫。中學階段應以“西學為重點”，“洋文功課居十分之七，中文功課居十分之三”，並且規定“一切皆用洋文授課”。在高等學堂階段，主要學“西學”，至於“中文”，則是“有考校，無功課；有書籍，無講席，聽學者以餘力自治力。”他認為對於青少年，應引導他們分析，學些專深的知識，如此，讓他們有所收益，觸類旁通、左右逢源。
科學方法問題是嚴複西學觀中的一個重要方麵，他曾翻譯《穆勒名學》（形式邏輯），並積極進行對“名學”的宣傳介紹。他認為歸納和演繹是建立科學的兩種重要手段。我國幾千年來，“演繹”甚多，“歸納”絕少，這也是中國“學術之所以多誣，而國計民生之所以病也”的一個原因。嚴複更重視歸納法，主張要“親為觀察調查”，反對“所求而多論者，皆在文字楮素（紙墨）之間而不知求諸事實”。他曾用赫胥黎的話說：“讀書得智，是第二手事。唯能以宇宙為我簡編，各物為我文字者，斯真學耳”。