反對基督教的猶太教拉比、文士和法利賽人不時向羅馬的仆從國王希律·安提帕告狀，大講基督教運動如何危險，耶穌就是複活的約翰，基督教徒不服從希律王和羅馬的統治等等，企圖聳恿希律·安提帕國王殺掉耶穌。
耶穌明白自己的處境和形勢。他覺得，作為一個宗教領袖，隻有用驚人的勇氣和挑戰去激勵以色列的上層和廣大群眾，喚起人們共同奮起與羅馬鬥爭，皈依基督教，猶太民族和人類才有希望。於是，他決定率十二門徒前往猶太王國首都，猶太教的聖城耶路撒冷，向保守的猶太教挑戰，向羅馬的走狗希律王示威。即使犧牲，也在所不辭。他認為，死是喚起民眾的最後一種方法。用自己的死，去促使人們覺醒、徹悟。人固有一死，這樣的死便是死得其所，死而無憾。
耶穌把一把象征開啟天國之門的鑰匙交給他最賞識的大弟子彼得保管，於公元30年初春時節，帶著十二門徒，義無反顧地向耶路撒冷進發。路上，弟子們為老師找到一匹驢子，耶穌便騎著驢到了耶路撒冷。
進城後，耶穌發現，猶太教祭司向這裏的商人收取高額稅金，商人又把物價抬得很高，將稅金轉嫁到顧客身上。有些祭司在城中的聖殿裏設櫃經營，賣的祭品比別的地方貴幾倍。耶穌斥責聖殿的祭司說，“你們竟然在聖殿裏做非法買賣，牟取暴利，已經犯了褻瀆神明的罪。這裏的祭品比平常的價格貴了五六倍，使窮人買不起祭品來祭獻上帝，你們太狠心了。”
耶穌的義舉得到民眾的歡迎，也導致一些祭司更加仇視耶穌。他們便與羅馬駐以色列地區總督彼拉多勾結，欲置耶穌於死地。彼拉多遂派人收買耶穌的門徒猶大，對他威脅利誘。猶大經不起威逼誘惑，收下了30枚銀幣，出賣了自己的老師耶穌。因此，後來猶大成了叛徒的同義語。
耶穌預感到大難即將臨頭。公元30年逾越節的前一天，他與十二門徒在下榻的客店裏共進晚餐。入座後，耶穌說：“你們中間一定有人出賣了我”。這便是盡人皆知的“最後的晚餐”。後來文藝複興時期的大畫家達·芬奇據此畫了著名的油畫《最後的晚餐》。吃飯時，耶穌拿起麵餅，祝福，掰開，分給眾人。說：“你們吃吧，這是我的肉體”。又端起酒杯，祝福，把杯裏的葡萄酒倒給眾人。說：“你們喝吧，這是我的血液。”眾弟子忍著悲痛和憤怒按照老師的吩咐吃餅飲酒，給老師餞行。於是，耶穌便立了聖餐禮。後來16世紀宗教改革時，新教便隻承認耶穌本人奉行和設立的洗禮和聖餐禮。
當天夜裏，抓耶穌的人便帶武器來了。但他們隻聞耶穌其名還未見過其人。猶大便溜出去對領頭的人說，我與誰接吻，誰便是耶穌。那夥人把耶穌師徒圍住後，猶大假惺惺地與耶穌告別，給他請安，與耶穌接吻。這便點出了耶穌是誰，使耶穌被捕。文藝複興時期的大美術家喬托據此畫了著名的油畫《猶大之吻》，鞭撻叛徒的卑鄙。耶穌的一個門徒拔刀反抗，但被耶穌製止。這樣，弟子們隻得眼睜睜地看著老師被抓走。
耶穌被捕後，遭審訊毆打，受盡了折磨。接著，猶太教祭司對耶穌進行了宣判。宣判書寫道：“耶穌的傳教，背離了猶太教先知摩西的律法，有意毀滅上帝的聖殿。耶穌教唆人民不繳納羅馬規定的稅金。耶穌以‘猶太人之王’出現，蠱惑民心，反抗羅馬，是擾亂和平的反叛者，該當死罪。”耶穌聽到判決時，毫無懼色，坦然承認自己是聖子、救主，是彌賽亞。還說了一句意味深長的話：“我的王國不在人間”。
公元30年4月7日，耶穌被處於釘十字架的死刑。這是一種當時很殘酷的刑罰，即把人的兩條小腿重疊，釘在十字架的豎木上，把兩臂分開，釘在十字架的橫木兩端，直到架上的人慢慢斷氣。行刑的那天，耶穌背負著豎木高4公尺，橫木寬2公尺，重60公斤的十字架，艱難地走向刑場。刑場沒在一處丘陵地帶。劊子手們剝去耶穌的衣服，釘在十字架上。耶穌滿身是血，忍著鑽心的疼痛，視死如歸，像是在向天禱告。送行的、旁觀的人都目不忍睹，失聲痛哭。被釘在十字架上的耶穌，在極度痛苦中慢慢死去了。年僅37歲，未曾婚娶的耶穌把全部的愛獻給了基督教事業和全人類，離開了人間。後來，十字架便因此成了基督教的標誌，“背負著十字架”一詞在文學中也成了“承受著巨大的苦難”的同義詞。
耶穌兀後，一個叫約瑟的信徒用細麻布裹屍，安葬了耶穌。今天，羅馬教皇的宮廷裏還珍藏著一塊有血跡的細麻布殘片，是耶穌裝殮後剩下的。許多專家多年來不斷對它進行鑒定和研究。
傳說耶穌在死後的第三天便複活了，當天晚上便向門徒們顯現，後又向眾人顯現。之後，被上帝接到了天上，坐在上帝的右邊。這顯然是反映了人們和信徒的一種良好願望，同時也昭示：他活著時雖然失敗了，但他死後卻勝利了。