在強大的輿論壓力下，尼克鬆不得不在1973年4月30日晚上向全國發表電視講話，一方麵重申自己與水門事件沒有牽連，另一方麵又說他接受了總統辦公室主任霍爾德曼、內務顧問埃利希曼、法律顧問迪安及司法部長克蘭丁斯特的辭職。對尼克鬆來講，這實在是無奈的選擇。
尼克鬆清醒地知道，對水門事件一案的調查不會因受牽連的高官辭職而停止。於是他任命國防部長埃利塞特·理查德為司法部長，並授予其任命一位調查水門事件的特別檢察官的全權。尼克鬆本想通過這樣的姿態以顯示自己在水門事件一案上問心無愧，同時又可有效控製司法機關調查。始料未及的是，理查森選擇了哈佛大學的著名法學教授阿奇博爾德·考克斯為水門事件特別檢察官，而考克斯本人是一個懷有黨派成見的狂熱分子，與共和黨勢不兩立。他一上任就向白宮索要有關檔案，著手做深入調查。以民主黨參議員薩姆·歐文為主席的參議院水門事件特別調查委員會，則要求白宮有關官員隨時接受質詢。並要求公開調閱總統的有關檔案。有人甚至提出傳訊尼克鬆親自作證。
1973年7月12日，尼克鬆因病住進了海軍醫院。在他住院期間，他的助理亞曆山大·巴特菲爾德向參議院特別調查委員會泄露了“天機”。自1971年3月以來，白宮安裝了能自動記錄談話的秘密錄音係統，總統在辦公室的所有談話，都有錄音磁帶備考。特別檢察官認為這是證明總統是否有罪的最有力的證據，要求白宮交出有關磁帶。參議院調查委員會也提出了同樣要求。新聞界抓住這條爆炸性新聞大做文章，公眾的反應也極其強烈。尼克鬆一時急得像熱鍋上的螞蟻，他的本能反應是，借助總統享有的特權，絕不交出磁帶。而考克斯窮追不舍，竟然點名索要水門事件三天後尼克鬆同霍爾德曼的兩次談話錄音。尼克鬆坐守陣地，強調總統有權拒絕特別檢察官的征調令，並要求司法部長解除考克斯的職務，從而停止調查，沒想到理查森竟拒絕執行總統指令，於10月20日提出辭職，同時，司法部副部長拉克爾考斯也辭職。尼克鬆措手不及，隻好臨時指定一名代理司法部長，隨後考克斯被代理司法部長解職，水門事件特別檢察官辦公處也隨之撤銷，其工作事務交由司法部受理。一時間，公眾洶湧的抗議滾滾而來，譴責總統向正義和法律挑戰。共和黨內不少議員也都感到總統做得過分，要求任命一名特別檢察官對水門事件進行調查。尼克鬆不得不同意。
1973年11月，來自得克薩斯的民主黨人利昂·賈沃斯走馬上任，他依然要征調1972年6月20日白宮的錄音磁帶為證據，在強大的壓力下，尼克鬆的心理防線正在崩潰。
但是從白宮中爆出另一個驚人的消息：作為重要證據的6月20日上午，磁帶竟然有十八分鍾出現空白。分管總統談話錄音的女秘書聲稱從未做過這樣的技術處理，即使工作中有過失，無意中抹掉一些錄音，最多也不超過五分鍾，那麼這神秘的十八分鍾空白到底記錄了哪些內容呢？是誰抹去的呢？
1974年初春，美國眾議院司法委員會開始考慮對總統進行彈劾，經過投票，通過了授權調查尼克鬆是否犯有可彈劾案的決議。3月1日，聯邦地方法院就偽證、密謀或阻撓審判等罪狀，對水門事件新的尚未起訴的七名被告予以起訴，包括尼克鬆的親信霍爾德曼、埃利希曼和米切爾等。盡管沒有直接對尼克鬆提出起訴，但大陪審團已將之當作“未被起訴的共謀者。”事到如今，尼克鬆不得不將一些複製的錄音磁帶交給了眾議院司法委員會。該委員會要求提交更多的磁帶。這些磁帶經過剪輯整理出來的抄本竟長達一千三百頁。
1973年7月中旬，參議院水門事件特別調查委員會發表了最後報告，開創了由尼克鬆總統或以他的名義犯下的種種罪名，為使尼克鬆競選連任，潛入水門大廈民主黨總部安裝竊聽裝置；為防止機密情報泄露，白宮小組的特別小組成員夜闖埃爾斯伯格辦公室搜集加害他的材料；為掩蓋事實真相，用多種方式阻撓調查，包括向水門事件被告支付堵嘴的錢，為打擊政敵提出利用有效的聯邦工具壓製，並草擬了一份“黑名單”。此外，那一段十八分鍾的空白，經專家鑒定，是被故意抹掉的。7月30日，眾議院司法委員會進行了彈劾總統建議的表決，認為總統以不正當行為妨礙司法審判，濫用權利，在白宮設立非法秘密調查小組，蔑視國會傳訊，應該受到彈劾和審判，應該被解除職務。
事至如今，尼克鬆隻有辭職一條路可走，不然就將在眾議院通過彈劾案後，接受參議院的審判而被趕下台。這會使他更加難堪。於是1974年8月8日，尼克鬆發表了辭職演說。8月9日，他和家人離開了他統領了六年的白宮。
水門事件，成了他的“滑鐵盧”。